為了確定腎臟病理改變性質,制定確切的治療方案,估計病情及預後，只要臨床上沒有禁忌症均可考慮腎穿刺活檢術，需做腎穿刺活檢的常見疾病有:
(1)急性腎功能衰竭
不明原因的急性腎功能衰竭，腎臟大小正常、且無尿路梗阻者，為了確定診斷、選擇用藥、判斷預後，腎活檢是十分必要的。
(2)腎病綜合徵
成人原發性腎病綜合徵,應在治療前做腎活檢。主要目的是明確病理類型，確定治療方案，以免盲目使用腎上腺皮質激素及細胞毒藥物而出現不必要的副作用。特別是治療無效或反覆發作的病人更需進行腎活檢。
(3)原因不明的蛋白尿
一過性蛋白尿及真正的體位性蛋白尿是良性的過程，不需腎活檢。而持續性無症狀性蛋白尿，尤其是尿蛋白質定量>lg/24h，或伴有鏡下血尿、管型尿、高血壓及腎功能損害時，應考慮腎穿刺活檢。
(4)血尿伴或不伴有蛋白尿
尤其是在兒童及年輕人持續性反覆發作的腎小球性鏡下或肉眼血尿,經歷各種檢查仍不能確診者，腎活檢可能有助於確立診斷。檢查結果75%會得到肯定的病理組織學診斷，其中最常見的為IgA腎病和薄基底膜腎病。
（5）腎炎綜合徵
有下列情況者應做腎活檢：①腎炎綜合徵的病因不明，考慮是繼發於全身性疾病；②腎小球腎炎，腎功能減退較快，需明確其 病理類型;不典型的急性腎炎或急性腎炎數月後不愈或出現腎功能下降者:④急進性腎炎綜合徵,腎活檢可發現炎症及免疫沉積物的存在及其形態、程度等。
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