1、蔣介石下命令除掉戴笠，軍統在抗戰時期迅速膨脹由原來的一個處發展到幾百萬人，且戴笠和美國人關係較好、已經威脅到了蔣介石的地位，在這種情況下蔣介石才痛下殺手除掉戴笠、證據在電視劇特赦1959中徐遠舉和周養浩曾經質問黃維戴老闆是不是國民政府國防部的人害死的，此前一向看不起特務的黃維竟然支支吾吾、這也反映出很多國軍將領應該是都知道一些內情。
2、被部下安放的定時炸彈炸死，有文章稱戴笠的專機上被其部下馬漢三派自己的秘書劉玉珠在檢查飛機的時候安放了定時炸彈、在飛機起飛時因天氣原因耽誤了行程，導致戴笠最終死於定時炸彈的爆炸。
3、死於我黨的特工之手，這種說法雖然沒有太多證據、但是在電視劇風箏中曾經提到過，而且最讓人感到詭異的是在戴笠死後不久、另外一架由重慶飛往延安的飛機也在途中失事，而飛機上的乘客同樣是無一倖免、大家都知道在那架飛機上有葉挺將軍及其家人，還有博古和王若飛等中共領導人、但是很多人都忽略了在那架飛機上還有一個人鄧發，他的身份是中共的秘密特工頭子、這和戴笠在國民黨內的身份非常相似，那麼這架飛機的失事是不是國民黨方面對於戴笠之死的一種報復呢？
4、自殺說，據去過飛機失事的現場的沈醉等人回憶道，在飛機失事後發現戴笠的槍裡少了幾發子彈、而飛行員身上也有中槍的痕跡，因此也不排除戴笠在接到蔣介石讓其去重慶覆命後萬念俱灰又不能起兵反抗、無奈之下只有自殺。
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