冠狀病毒是一種包膜的、正鏈單鏈RNA病毒。近日,傳染病結構基因組中心(Center of Structural Genomics of InfectiousDiseases,CSGID)發現並分析了兩個關鍵的SARS-CoV-2蛋白——NSP16-NSP10,這是迄今為止CSGID科學家們確定的第4種SARS-CoV-2潛在藥物靶點的蛋白質結構,其餘3種重要的病毒複製蛋白結構分別為:nsp15內切酶、nsp3ADP核糖磷酸酶和nsp9複製酶。
SARS-CoV-2中NSP16-NSP10配合物的1.80埃分辨晶體結構
NSP16-NSP10蛋白複合物稱為RNA甲基轉移酶或Mtase,根據之前的非典研究,NSP16和NSP10這兩個蛋白結合後成為一個功能蛋白,它們可以修飾新冠病毒的遺傳物質,以模擬人類的RNA,從而使病毒免於宿主的抗病毒防禦,爭取更多的時間繁殖。如果開發一種新藥物能夠抑制nsp 10/nsp 16,也可以使得免疫系統更快檢測和根除病毒。
研究者首先設計了DNA片段以表達NSP16和NSP10兩種蛋白質,隨後分析蛋白結構。加州大學河濱醫學院生物醫學教授Adam Godzik表示,研究小組已向公眾公佈蛋白質結構,以供其他研究小組作藥物研發。
SARS-CoV-2六聚體結構
Godzik指出,這是繪製新病毒全部蛋白結構圖譜的一部分,目前直接方向是通過解決附加結構來擴大結構覆蓋範圍,另一研究方向是開展與潛在藥物的共結晶實驗,探究冠狀病毒蛋白如何與藥物結合,這將有助於開發得到新冠病毒的靶向藥物。
End
[1] New drug target found for COVID-19
[2] Crystal structure of Nsp15 endoribonuclease NendoU from SARS-CoV-2
[3] https://csgid.org/deposits/index/title_form:SARS/obsolete:1
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