毛囊是指包繞毛根的軟組織，是一種複雜的組織結構，由一些同心圓狀的細胞呈柱狀排列。
毛髮是從毛囊中長出，而毛囊和毛髮又都是由毛球下部的毛母質細胞分化而來。
毛囊像個細長的口袋，開口於皮膚的表面底部，深入到真皮及皮下脂肪層。
毛囊由內而外又分為內、外毛根鞘和結締組織鞘三層，內、外毛根鞘起源於表皮，結締組織鞘起源於真皮。結締組織鞘又稱毛囊周圍鞘，圍繞毛囊，由內層環狀纖維和外層縱行纖維組成。毛囊周圍鞘內含有豐富的血管叢和神經末梢，毛細血管多與毛囊縱行排列；外毛根鞘位於毛囊周圍鞘內層，相當於表皮的基底層和棘細胞層，細胞質清晰，與表皮相連。
毛囊從頂部到底部外毛根鞘厚度不一，頂部較厚，向下逐漸變細至毛球部僅剩一層細胞。外毛根鞘最外層細胞呈柵欄狀整齊排列，細胞間只有不活躍的黑素細胞。當皮膚遭受損害時，黑素細胞可以增殖併產生黑色素，在移行至毛髮上部和表皮內；內毛根鞘在毛囊最內層，由三層不同的細胞層構成，包繞生長中的毛幹。鞘小皮是一層互相疊連的細胞，其長軸與毛髮長軸平行，與毛小皮互相藉助鋸齒狀突起緊密鑲嵌，令毛髮固定於毛囊中。毛囊角化時，細胞內細胞器消失，細胞核萎縮，角化過程從亨勒層最先開始和完成，其次為鞘小皮，最後為郝胥黎層。
根據目前的研究，我們知道每個人頭皮上的毛囊數從出生開始就終生不會改變，總共大約有10萬~15萬個毛囊。毛囊的總數量是恆定的，但頭皮的面積是隨著年齡的增長而變化的，因此毛囊的密度在不同的年齡段是有所不同的。例如在嬰幼兒階段，頭皮面積要遠遠小於成人，因此他們的毛囊密度是最高的，可以達到約500~700個／cm2，之後隨著頭部的發育，頭皮面積逐漸變大，其相應的毛囊密度則逐漸下降，至成人階段，降低到了嬰幼兒時期的一半，即約250~350個／cm2。而到了老年期，人的一部分毛囊則要發生退化。
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