03.02 利用CRISPR-Cas9編輯T細胞多個基因進行免疫治療

撰文 | 小飛飛

腫瘤免疫療法給腫瘤治療帶來了新的策略和希望。利用免疫細胞進行抗腫瘤治療,極大地改善了臨床上對腫瘤的治療。將腫瘤特異性的T細胞輸送到病人體內進行治療的方法叫做適應性T細胞療法(adoptive T-cell therapy,ACT)。ACT通常需要從病人血液或腫瘤中分離出T細胞,然後這些細胞在實驗室中進行基因改造增強它們的功能,然後回輸給病人【1】。對病人來源的T細胞,轉導入腫瘤特異性的TCR(T cell receptor),回輸給病人的TCR T細胞療法展現了不錯的安全性和前景。但TCR T細胞療法的缺陷之一是,轉基因的TCR會和內源性的TCR α和β鏈錯配或者競爭性表達,降低了有治療效果的轉基因TCR在細胞表面的表達【2】


同時ACT療法的另一缺點就是,回輸進體內的T細胞的耗竭和功能失調也會影響治療的效果,基礎研究表明PD-1的抗體阻斷和基因敲除都可提高T細胞的抗腫瘤功能【3】。CRISPR–Cas9基因編輯技術的出現和發展,極大的便利了人們基因編輯的手段和效率,以及在同一個細胞中同時進行多個基因編輯成為了可能。在T細胞中利用CRISPR–Cas9同時靶向T細胞中多個基因或可提高免疫治療的療效,但該療法在病人體內的安全性以及可行性都尚未知。

近日,來自美國賓夕法尼亞大學Perelman醫學院的Carl H. JuneEdward A. Stadtmauer團隊在Science上發表題為CRISPR-engineered T cells in patients withrefractory cancer 的文章,報道了第一個利用CRISPR-Cas9 在T細胞中編輯多個基因進行免疫治療的臨床一期試驗,檢測了該療法的安全性和可行性。


Science | 利用CRISPR-Cas9編輯T細胞多個基因進行免疫治療


研究團隊利用CRISPR-Cas9在T細胞中將編碼內源性TCR鏈的TRAC, TRBC兩個基因敲除以增加慢病毒轉導的腫瘤(骨髓瘤,黑色素瘤和軟組織肉瘤)特異性的TCR基因(NY-ESO-1)的表達【4】,同時利用CRISPR-Cas9將編碼PD-1的PDCD1基因也敲除掉減少回輸T細胞的耗竭(圖1)。最初有六名參與患者,但是隻有四名患者在體外獲得了基因編輯的T細胞,其中一名患者在回輸之前便病情惡化而死亡,最後只有三名患者(兩名難治性晚期骨髓瘤,一名已轉移的軟組織肉瘤)回輸了CRISPR-Cas9基因編輯的T細胞。


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圖1 CRISPR-Cas9 多基因編輯T細胞示意圖

研究團隊在回輸之前,檢測總體水平上重組TCR表達以及基因編輯情況,發現NY-ESO-1 TCR+T細胞佔總T細胞2%~7%,三種基因的編輯比例大約是TRAC:45%, TRBC:15%和PDCD1:20%,體外的CRISPR-Cas9基因編輯的T細胞也有較強的腫瘤細胞殺傷能力。三名病人回輸了CRISPR-Cas9基因編輯的T細胞,且都有很好的耐受性,沒有出現嚴重的副作用,也沒有出現細胞因子釋放綜合徵。


三名病人血液中NY-ESO-1 TCR+T細胞平均半衰期約為83.9天(15-153, 95% CI),檢測回輸之後的基因編輯細胞的比例,可持續檢測到TRAC和PDCD1基因編輯細胞佔病人PBMCs(peripheral blood mononuclear cells)的5到10%。同時檢測T細胞的CRISPR-Cas9的on-target編輯效率,TRAC和PDCD1可達到98%以上。檢測CRISPR-Cas9基因編輯引起的染色體易位情況,其中TRBC1:TRBC2易位重組引起的9.3 kB的缺失突變最為明顯,其他的染色體易位並沒有檢測到。


對病人回輸T細胞進行單細胞測序顯示,隨著時間的增長基因編輯T細胞的比例有所下降,但NY-ESO-1 TCR+T細胞隨著時間的增加免疫記憶相關基因表達有所增加。三名病人的臨床反應如圖2,兩名病人反應較好病情穩定(Stable disease,

SD),截至2019年12月,三名腫瘤病人疾病都惡化,兩名病人接受了其他治療,一名病人去世。


Science | 利用CRISPR-Cas9編輯T細胞多個基因進行免疫治療

圖2 三名病人臨床反應概況

總之,這項臨床I期試驗首次在病人中(first-in-human)初步證明了利用CRISPR-Cas9 在T細胞中編輯多個基因進行免疫治療的可行性和安全性,但後續試驗需要更多的病人參與,回輸基因編輯效率更高的T細胞,觀察更長的時間,來進一步評估該策略的安全性以及其治療效果。

原文鏈接:

https://science.sciencemag.org/content/early/2020/02/05/science.aba7365/tab-pdf

製版人:小嫻子



參考文獻

1. Lim WA, June CH. The Principles of EngineeringImmune Cells to Treat Cancer. Cell. 2017;168(4):724–740.

2. Provasi E, Genovese P, Lombardo A, et al. Editing Tcell specificity towards leukemia by zinc finger nucleases and lentiviral genetransfer. Nat Med. 2012;18(5):807–815.

3. Odorizzi PM, Pauken KE, Paley MA, Sharpe A, WherryEJ. Genetic absence of PD-1 promotes accumulation of terminally differentiatedexhausted CD8+ T cells. J Exp Med. 2015;212(7):1125–1137.

4. Rapoport AP, Stadtmauer EA, Binder-Scholl GK, etal. NY-ESO-1-specific TCR-engineered T cells mediate sustained antigen-specificantitumor effects in myeloma. Nat Med. 2015;21(8):914–921.


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