維奧
當然是對著說明書組裝出來的呀～開個玩笑～
在我小時候，流傳著一個版本，說是初號機是用黑豹，植入了一個身體增大的藥劑，然後在外部裝上裝甲，零號機是用人類身體同理所得，二號機是直接使用機械製作，因此它噴出的液體不是紅色而是機油。
當然了，這個設定只是當時我表哥哄我玩的，目前我所掌握的資料來看，eva的肉身都是克隆生成，尤其是在機體維修時，這一點最為直觀。克隆技術應該不用贅述了，只要原始細胞的基因不含拒絕克隆再生，那麼就是可行的。
然後來說說肉體克隆的來源：亞當&莉莉絲，這兩個都是公認的eva肉體克隆來源，
肉身出來之後，根據eva的劇情設定，機體需要靈魂，像是二號機這種純熟的作戰兵器就不需要靈魂了，其實錯了，二號機內部是明日香母親的靈魂。
零號機一隻眼，初號機2眼，二號機4眼，加起來就是7眼莉莉絲，所以一說是三臺機體瓜分了莉莉絲的靈魂，不過初號機中應該包含另外一個靈魂，就是碇真嗣的母親。
順便說一下綾波麗，她的身體是是用製作零號機剩餘的細胞製作的，但是植入的卻是碇真嗣母親的靈魂。
說了這麼多都是各種猜想，實際情況估計只有痞子才能給我們答覆，而且究竟在我們入土前能否公佈……額……
來看看維基百科上怎麼說吧，在TV版本中（劇場版已經完全不同了，不能比較）最後揭露了初號機是由第二使徒莉莉絲製作，零號機是第一使徒亞當，二號機是，各位駕駛員因此才能同步操作。
高達
我們可以在TV版第21話“NERV、誕生”中找到答案。
首先簡單介紹一下故事背景，2000年，SEELE在南極的地下空間中找到了亞當，並派出葛城調查隊前去對其進行調查，在實驗中不慎引發了“第二次衝擊”，亞當本體也以“光之巨人”的形象第一次在動畫中現身。第二次衝擊絕非偶然，事發的前一天，碇源渡帶著全部的研究資料回到了日本，這也成為了日後製造EVA的重要參考。
2003年左右，“亞當再生計劃”又稱“E計劃”正式開始進行，通過克隆等各項技術，以亞當為藍本，製造了第一臺EVA，也就是零號機。之後又用類似的手段，複製了二到四號。初號機比較特殊，是莉莉絲的複製，並最終成為了補完計劃的一環。
所以說用“克隆”比“製造”更為貼切。當然，後續要搭載很多設備，才能算是完成製造，例如插入栓，通信設備，限制器，內臟電池，外置盔甲等等。
當然EVA只是軀殼，想讓它動起來需要有靈魂的支持。
所以才有了駕駛員的同步技術，EVA的核心是靈魂人的容器，理論上身為適格者的駕駛員狀態正常的前提下，插入栓插得越深，人的靈魂就距離核心越近，同步率就越高。但也有像碇真嗣一樣，同步率超過400%，整個人都融化在插入栓中的風險。
劇場版破中的真希波瑪麗在開啟了二號機的獸化模式後，插入栓深度直接變成負值，也就是已經插到核心裡面去了，同步率暴漲。
另外，大家都知道，唯在初號機的啟動實驗中，與核心直接接觸，與初號機融為一體。當碇真嗣出於險境或喪失意識，碇唯的靈魂會站在主導地位驅動EVA，也就是我們常說的暴走。
