鷗四風
EVA的故事主要分為三部分，碇真嗣一行人打使徒的明線，老碇和SEELE較勁的暗線，以及穿插在兩條線之間的“人類補完計劃”。
46億年前——一顆隕石帶著白之月中的亞當、朗槍、死海文書墜落在了地球南極。
40億年前——一顆隕石與地球碰撞，黑之月載著莉莉絲墜落到了地球。墜落的位置為日本箱根，莉莉絲本體留在了地下的大坑中。碰撞產生的碎片被地球引力束縛變成月亮。莉莉絲創造了LCL之海，人類從中誕生。史稱“第一次衝擊”。（貞本義行漫畫版）
中世紀——一個宗教組織暗中興起，直到20世紀發展壯大，這個組織為SEELE的前身，掌握了死海文書，後成為人類補完計劃的主導者。
1999年——碇源渡、碇唯、冬月耕造的大學時期。源渡和唯交往初期還保留著自己的舊姓“六分儀”。老碇開始時對唯並沒有感情，只是想通過她接近SEELE。
2000年——人類對亞當的接觸實驗導致“第二次衝擊”，地軸偏轉，海平面上升，地球人口銳減一半，日本處在了永遠的夏季。葛城美里的父親也在衝擊中遇難。光之巨人，也就是亞當被炸回了胚胎形態，被SEELE帶走，幾年之後又被加持良治偷出來順便在護送二號機的時候帶給了老碇。（另有，渚薰是當日誕生的說法）
2001年——多數駕駛員出生，綾波麗“製造”時間不明。（生日與角色聲優一致）
2002年——老碇、冬月帶著美里來回到了南極，此行目的主要是調查事件真相。但聯合國向大眾公佈了虛假消息，真正的情況只有SEELE相關者知道。
2003年——聯合國設立“人工進化研究所”，位置就在日本箱根那個莉莉絲的大坑裡面。開始正式為“人類補完”計劃做準備。
2004年——碇唯在進行身體直接接觸EVA核心的啟動實驗中，因為距離核心太近，同步率超過1000%，被核心吸收。碇真嗣目睹了之一慘劇，留下了心理陰影。（不過她的死並沒有白費，之後駕駛艙採用了更為保險的插入栓設計)
2010年——MAGI系統全部開發完成，人工進化研究所組建為NERV並在全球設了八個支部。律子她媽殺掐死1號綾波麗之後自殺。
2015年——使徒襲來。緊接著是TV版的故事了，按照水天使、晝天使、雷天使、魚天使、音樂天使、胎天使、雨天使、空天使、恐怖天使、夜天使、霰天使、力天使、鳥天使、子宮天使、自由天使，的順序逐個擊敗使徒。比較值得注意的幾次分別是，霰天使控制了三號機，駕駛員為鈴原東治，被初號機手撕；初號機通過吞噬力天使獲得了S2機關；二號綾波麗與子宮天使同歸於盡；自由天使渚薰主動選擇死亡後，補完計劃的準備也基本完成，約定之日即將到來。
