沙漏遺愛
這問題......
南京的高校質量僅次於北京上海，有12所雙一流大學，其中有八所211大學，可以說以“南京”開頭的大學都是好學校，分數也極高。
再說這三座城市的經濟地位和地理位置，沒有疑問，南京依然遠遠超過合肥濟南，它們的經濟體量都不是一個層次。
至於合肥和濟南，合肥最出名的是中國科學技術大學，其次是安徽大學和合肥工業大學，共3所211大學。
山東大學是濟南乃至山東最好的學校，不過也是濟南唯一的一所211985大學。
個人觀點是南京＞合肥＞濟南
微談讀書
肯定是合肥、南京、濟南這個順序呀。三大科學中心是合肥，南京和濟南沒入選，四大科教城市，合肥入選，南京和濟南無，再比國家實驗室，國家大科學裝置，那南京和濟南差的更遠了。比高校，合肥，南京兩所985高校，其中合肥和南京各有一所中國頂級985，合肥還有一所是國防科大，按理說也是頂級，但是因為是分校，所以和南京一樣，一所頂級，一所次頂級，而濟南只有一所985，只能排到次頂級。合肥和南京還有眾多的研究院所，濟南在這方面差距就更大了。就合肥一個科學島，玩好了，那是直接改變人類命運的。
皖美鄉村之鳥人拍鳥
1999 年，合肥與北京、成都、西安一起被確定為國家四大科教基地 ，是國家給的，有原國家主席江澤民同志的題詞為證。（可以在“百度”上搜索）
題目中提出的南京市、濟南市是國家一線城市，而合肥市是國家二線城市，但在科研方面都拼不過咱安徽省的合肥市。以下是我本人手頭上掌握的資料作為論證： 
中國科大作為我國頂尖的高校，培養的畢業生可謂是一流的人才，而這部分人才有很大比例來自安徽，也有很大比例留在合肥各種研究所工作，或者留校任教。
隨著中國科大落戶合肥，中國科學院合肥分院也隨之落戶合肥市蜀山區“科學島”上，其中包括中科院物質科學研究院、等離子體物理研究所、固體物理研究所、光學精密機械研究所、智能機械研究所，還有原電子工業部16所、38所、43所等研究院所。 
合肥還有“超導託卡馬克裝置”、“國家同步輻射實驗室”、“微尺度物質科學國家實驗室”等多重點科研設施（以上統統都是高尖端的國家絕密的科學技術）。
還有我國第一臺微型計算機、第一臺VCD播放器、第一臺全自動洗衣機等，都是在合肥製造出來的。而隨著“京東方”落地合肥市後，先後在合肥建成國內首條6代、8.5代和全球首條10.5代液晶面板生產線，目前的合肥液晶顯示屏產量達2.2億片，產量和配套能力位居全國前列。 
現在的合肥，基本上每天誕生1戶國家高新技術企業；每天申請發明專利近90個、獲得授權13個以上；每天技術合同交易額大約4000多萬元。
求實雜談
我覺得相比較而言是南京。
本人在這3個城市都呆過比較長時間。中國科學技術大學可以秒殺不少985高校。1999 年，合肥與北京、成都、西安一起被確定為國家四大科教基地。許多科研機構在合肥，比如中國科學院合肥分院，原電子工業部16所、38所、43所等研究院所。合肥的科教資源還是很雄厚的。
但是從歷史文化底蘊，交通便利程度等其它因素來看，南京更雄厚一點。南京高校眾多，有2所985高校，且高校質量高。
考研科代表
科教資源雄厚
這三城肯定是合肥一南京一濟南，合肥是科教，科技城，在科教上沒有這個實力是肯定進入不了的。
在中國科教科技城：北京，合肥，上海，國家級科教科技三大中心城市！
合肥科教實力雄厚可想而知，講的
太多也沒有什麼意義，合肥，南京，濟南，比科教這個排名是正確的。
義良8
比高等教育資源，合肥比不過南京。但是比科教資源，合肥在全國都是第一第二的位置，南京、濟南如何能比得過合肥。
貓6咪
1.南京：南京大學，東南大學，河海大學，南理工，南航，南郵，南外，南師
2.合肥：中科大，合肥工業大學
3.濟南：山東大學
微醺挑燈看劍
南京已經淪落到要和合肥比了嗎？
車秋雨
中國教育資源城市，京滬就像大學裡的清北一樣，地位不可動搖。能在科教上穩壓南京的也只有這兩個城市。能和南京掰一下手腕有武漢、西安。也只能掰一下，依舊輸給南京。合肥和濟南根本不在一個層面。至於合肥與濟南，自然是合肥強於濟南，中科大穩壓山大，除此之外合肥還有合工大與安大兩所211。
巡山找肉吃
合肥的教育資源怎能與南京相比？毫不誇張南京的教育資源在全國排前三名，京，滬，寧！
