達爾文提出的進化論主張“物競天擇，適者生存”，他認為地球上所有的生物，都是由最簡單的生命，在極為漫長的時間長河裡，通過很多細微的變化逐漸演變而來。時至今日，進化論在經過長時間的發展和完善後，已經被科學界普遍地接受。
雖然進化論是目前對生命演化的最靠譜的解釋，但是不可否認的是，進化論並不完美。事實上，進化論有一個致命的弱點，100多年前，達爾文就意識到了這個問題，他指出：“假如有一天，人們能夠證實生物體內的某種複雜的器官，是不可能由大量漸進而細微的變化形成的，那麼進化論就會崩潰。”
進化論的反對者當然不放過這個弱點，在過去的日子裡，他們有針對性地提出了很多質疑。在眾多質疑聲中，美國利哈依大學的邁克爾.貝赫 （Michael J. Behe）提出的“不可簡化的複雜性”對進化論極具威脅。
簡單地講，“不可簡化的複雜性”是指一個複雜的系統，必定是由很多具備各種功能的零部件組成，它們各司其職，又必須互相配合，才能夠完成整個系統的功能，任何一個零部件的缺失都會導致這個複雜的系統變得毫無用處。
這樣的例子在日常生活中隨處可見，對於一臺複雜的機器，你確實可以將它的零部件簡化一部分，但卻不能一直簡化下去，當簡化到了一定的程度，所有的零部件都是非常必要的了，如果再簡化掉其中的某一個，那麼這臺機器就變成了一堆廢鐵。
而生命的複雜性遠非人類製造的機器能夠與之相比的，對此，邁克爾.貝赫用了一種細菌來舉例說明，這種細菌有一種幫助其移動的鞭狀細胞器，被稱為“鞭毛”。
研究表明，看似簡單的“鞭毛”實際上卻是一種非常精妙的系統，它擁有完整的有關能量、傳動、驅動、方向控制等功能，而這些功能又分別是由各類蛋白質組成的“零件”完成。很顯然，這種細菌的“鞭毛”就是一個典型的“不可簡化的複雜系統”，組成這個系統的任何一個零件都是不可缺失的。
邁克爾.貝赫認為，如果遠古時期的細菌只進化出了“鞭毛”的一個“零件”，那麼這個“零件”將會因為毫無用處而很快被淘汰掉。也就是說，遠古時期的細菌想要進化出“鞭毛”，就必須同時進化出“鞭毛”的所有“零件”，缺一不可，而事實上，這種事情發生的可能性無限趨近於零。
因為進化論無法解釋“不可簡化的複雜性”，所以這種細菌的“鞭毛”讓進化論支持者如臨大敵，所幸在經過長時間研究後，現在他們終於在基於進化論基礎上，給出了這個問題的答案，即細菌的“鞭毛”是可以簡化的。
進化論支持者指出，“鞭毛”的各個“零件”在形成複雜的系統之前，其本身是有一些簡單的作用的，而當這“零件”湊到了一起，它們才進化出“鞭毛”這種更加複雜的系統。
上圖為相關科學家繪製的“鞭毛”進化史，可以看到“鞭毛”從剛開始的相對簡單的被動轉運通道結構，一路進化到最後的複雜系統。
看上去“不可簡化的複雜性”對進化論的威脅似乎得到了解決，但實際上當年達爾文意識到的這個進化論的致命的弱點依然存在，要知道在地球上，細菌只不過是一種很簡單的生命而已，而更多、更復雜的生命結構，對於現在的我們而言，還是一個巨大的未知區域。
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