與一般導彈可以採用多種方式制導不同，洲際彈道導彈的制導方式比較單一，這主要是出於兩方面因素考慮，第一，安全性。像衛星制導、景象匹配製導、地形匹配製導這些制導方式往往容易被敵方干擾，洲際導彈這種大殺器自然要確保萬無一失，從這一點來講，上述制導方式統統不可取。第二，大多數制導方式無法滿足洲際導彈要求。要知道，洲際導彈末端攻擊的時候，其速度大都突破20馬赫，像GPS這些導航系統此時幾乎處於失效狀態，更何況，核戰爆發時，衛星系統是否可以安然存在還是一個未知數，各國又怎能把希望全部寄託在衛星導航系統上呢？因此，各國洲際導彈普遍採用兩種導航方式，一種是慣性制導，另一種則是星光制導，其中，第一種佔主要地位。
慣性制導指什麼呢？簡單來講，就是提前預設一條攻擊目標的軌跡，然後在導彈實際飛行過程中通過慣性陀螺儀和傳感器，不斷計算導彈在6個自由度上的速率、加速度以及角速度等其他各項相關數據，並儘可能修正導彈飛行軌跡確保其與預設軌跡儘可能吻合，當洲際導彈進入末端攻擊狀態前，關閉發動機，以慣性制導的方式打擊目標。
上世紀60年代的洲際導彈大多采用機械式慣導方式，那時的陀螺儀和傳感器技術都不太強，因此，在實際矯正導彈飛行軌跡時非常困難，即使是美軍，也只能把飛行誤差保持在分米級別，當導彈攻擊目標時，其地面攻擊點誤差甚至能達到5公里，當然了，這點距離與核彈的打擊範圍相比不算什麼。
直到八十年代，美軍率先使用激光光纖陀螺儀，並在導彈內部安裝計算能力超強的導航計算機，其糾正導彈飛行軌跡的能力才大幅上升，並最終做到打擊精度在百米上下，基於此，八十年代以後的洲際導彈大都具備攻擊敵方發射井的能力。
至於星光制導，也是美軍首次應用，當彈頭脫離火箭後，前者安裝的恆星敏感器可以捕捉到某顆恆星的具體位置，並以此來不斷調整彈頭的飛行軌跡或者減少重力對彈頭的影響，在星光制導的輔助下，洲際導彈的打擊精度更高，美國“三叉戟”、“民兵-3”的制導方式都採用了星光輔助制導。
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