在踏平浩罕汗国之后，俄国为了实现对中亚的永久统治，动员大批俄罗斯、乌克兰农民移居此地。到20世纪，吉尔吉斯地区已形成了俄罗斯、乌克兰、吉尔吉斯人村落交叉并存的局面，吉尔吉斯人面临着被分割和同化的危险。 浩罕残余势力不甘心失败，就在俄国十月革命前夕，以塔内什巴耶夫为首的穆斯林反对派在浩罕宣布建立反布尔什维克的突厥斯坦共和国。他们高举突厥斯坦自治大旗，在英国的支持下，与奥伦堡的杜托夫白匪相勾结，发动了对苏维埃的军事暴动。
逆流刚刚冒出，便于1918年2月28日被苏维埃赤卫队镇压下去。 部分浩罕分裂分子投奔了“巴斯马奇”（突厥语，意为土匪、强盗）。他们在得到了协约国和土耳其泛突厥主义运动的资助后，在山区、农村与苏维埃展开了凶猛的武装对抗。 沙州回鹘有一句谚语：猎物有多少条路逃遁，猎人就有多少种计谋。面对来势汹汹的巴斯马奇，苏维埃政权刚柔并用：第一步是在中亚广泛推行新经济政策，减少居民纳税，部分恢复宗教界的土地和精神权威，铲除了巴斯马奇的思想基础和群众基础。第二步则是对巴斯马奇成员发布大赦令，促使巴斯马奇官兵自动放下武器，返回家园。
雨过天晴，突厥斯坦苏维埃社会主义自治共和国终于诞生。与此同时，隶属俄罗斯联邦的吉尔吉斯（哈萨克）苏维埃自治共和国、布哈拉苏维埃人民共和国和花剌子模苏维埃人民共和国也宣告成立。 掀开新的盖头，却露出旧的面孔。尽管一部分激进的民族主义者加入了共产党，但他们并未放弃民族主义目标。以苏丹加列夫为首的一批鞑靼共产党员提议建立一个包括伏尔加-乌拉尔河和中亚地区的大突厥国家。突厥斯坦则响起建立“突厥民族”的自治共和国的呼声，吉尔吉斯（哈萨克）和花剌子模也动议建立“中亚联邦”。
看来要彻底打倒泛突厥主义，必须破除一个拥有2000万人口的庞大的“突厥民族”的自治共和国的怪影，但是要做到这一点谈何容易？一个又一个方案被否决。后来有人提出是否能对中亚突厥民族进行“识别”，从而肢解现有的突厥斯坦共和国呢？ 苏联领袖（列宁）尽管个子不高，但双眼如炬，他在权衡利弊之后同意了这个不错的建议。1920年6月，他建议绘制划分乌兹别克斯坦、吉尔吉斯（哈萨克）和土库曼的突厥斯坦民族志地图，详细弄清这三部分合并与分开的条件。后来在划分实践中延伸到了卡拉吉尔吉斯（即吉尔吉斯）、塔吉克。
按照一个德国人的说法：“列宁根据突厥斯坦前线指挥官伏龙芝的提议，下令编制民族志地图。这件事交由突厥斯坦省长官署的秘密工作头领柯恩办理。柯恩建议把突厥斯坦分成5个自治共和国，莫斯科接受了这一建议。”由于苏联档案至今没有解密，这一说法的真伪尚待考证，但基本可以相信，这5个民族和5个共和国的划分方案是在办公室里构思和决定的。
历史记载，1924年6月26日，俄共中央中亚局决定成立16个民族代表组成的领土委员会，负责民族的边界和行政领土划分。中亚除已经成立的吉尔吉斯（哈萨克）共和国外，又分别组建了乌兹别克、塔吉克、土库曼自治共和国和卡拉吉尔吉斯自治州。它们先后以加盟共和国的名义加入了苏联，这也就是后来中亚五国的雏形。
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