華夏族群的母系mt-DNA，最大支為D類型，這是從線粒體DNA單倍群測試出來的，D系佔了漢族的最大支。其中D系下屬的D4比較耀眼，D4佔漢族的13%，遙遙領先，而D5僅佔5%。需要注意的是，線粒體DNA主要反映的是母系狀況，Y染色體單倍群是反映父系的，二者都有一個D類型，但不是一回事。
經過科研測試發現，母系D類型（不含D5）的神奇之處，在於她分佈在陝西、山西，同時她也是東亞最古老的母系基因。這為我們推斷黃帝部落的軌跡提供了一點證據，黃帝部落在史料上也是記載為發源於陝西一帶。更確切地說，黃帝部落可能就是陝北發源，因為石峁遺址可能是屬於黃帝的，根據考古發現，石峁遺址是西北方位的巨無霸勢力，可能存在部落聯盟。
從陶寺文化（堯都）裡面，測試出的母系基因有D4、D5，還有M（含M10、M7）等，M10是古老的北方類型，這反映了陶寺人的屬性——文獻資料見《陶寺中晚期人骨的種系分析》。今天的山西人比陶寺人多了南方的元素，例如多了N系、R系。陶寺人比較北方一些。
而陶寺的女性更多的是M系，而且體質上是古中原類型。大M系下屬的M7可能即代表古中原的女性了——M7佔漢族的10%，M10佔漢族的2%左右。那麼可以推測出，M7是黃帝部落打敗了中原部落後，從他們那裡掠奪的女性。
黃帝部落到陝西之前，來自什麼地方？在附近找找，青海的喇家遺址測出有D、以及M10類型，D/M10都見於陶寺，可見二者可能是同一批人。青海在中原的西北方，印證了黃帝的西北起源。Y染色體的突變推演也說明華夏族群的主體O3（現稱O2）是西北方向起源的，所以母系基因更進一步作證了Y染色體的說法。
石峁對應的可能就是黃帝部落，也可能是黃帝的後人。畢竟這是夏朝之前的建築，不能排除就是黃帝的軍事基地。
傳說中的黃帝形象，見下圖，歷史上肯定和這相差很大。
如果按石峁就是黃帝基地來看，當時黃帝部落可能正處於半遊牧半農耕，在向農耕過渡。到了夏朝，夏人還是居無定所，國都經常變換。從考古已經能看出，很多文化遺址是半遊牧半漁獵的，生活方式還比較原始，作風也比較野蠻。可見黃帝時代並非儒家典籍所記載的上古盛世，因為考古的準確性遠大於史料，二者相沖突的時候，肯定以考古優先。而且上古的史料記載，是互相沖突的，不可盡信。
我們還可以推斷，黃帝應該是一個個體英雄，並不是氏族。這是小編個人總結出來的一個規律：凡是帶帝字的人物，都是指個體。例如帝舜就是指舜（帝舜的兒子另有名號），望帝就是指杜宇。當然了，黃帝的事蹟很多，又互相沖突。不排除是因為後人把一些其他人事蹟、一些神化後的事蹟，都附會到黃帝身上。
而帶氏字的名詞才可能是指非個體，例如軒轅氏，可能是指整個氏族。
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