有其父必有其女,如何让后代更优秀(含抗病性预测遗传计算示例)

宾夕法尼亚州立大学奶牛遗传学副教授今年四月,CDCB(奶牛育种委员会)首次公布了对6种疾病包括乳房炎、酮病、真胃移位、子宫炎、胎衣不下和产后瘫痪的抗性基因评估。

此前,我们在《养牛》首刊中有讨论过关于这些评估的数据来源以及它们与其他疾病的关系评估的更多细节。

本文将对这些特性的PTA(预测传递力)分布进行评估,考虑到父系对女儿证明有贡献的记录数量,以及由此产生的可靠性,在之后的续篇中,我们将继续讨论这六种疾病的评估与其他特性的关系以及父系对其的影响。

有其父必有其女,如何让后代更优秀(含抗病性预测遗传计算示例)

乳房炎抗病性的预测遗传力

基于公牛PTA的乳房炎抗性分布如图1所示,包含在这个图中的PTAs数据是来自于2015年及之后人工配种出生的近5000头公牛。之所以选择这个出生年,是因为这可以为目前可用的公牛提供一个预期PTA范围的指示。


有其父必有其女,如何让后代更优秀(含抗病性预测遗传计算示例)

正如图中所示,大多数公牛的PTA都在+0.5%至+2%的区间,但最高的接近+4%,最低的接近-2%。这些数据是相对于2010年出生公牛基数为0而言,且这些数据大多数是高于0,这表明bull studs选择的公牛和市场上的公牛的乳房炎抗性优于平均值。

公牛抗病性的高与低

体现到女儿身上是怎样的?

通过比较第90百分位和第10百分位的公牛,可以帮助我们了解抗病性高公牛和抗病性低公牛的女儿在可预测发病率上到底有多大的差异。

关于自2015年出生的公牛这6个性状的抗病性百分位数据如表1,关于经女儿证明过的公牛将在以后讨论。

有其父必有其女,如何让后代更优秀(含抗病性预测遗传计算示例)

表1基因检测青年公牛第90和10百分位的PTA(预测传递力)

Rel GYS:基因检测青年公牛的平均可信度

Rel DP:经女儿证明的公牛的平均可信度

让我们来看看高(第90百分位)和低(第10百分位)公牛的乳房炎抗性情况,高抗性公牛的PTA为+2.2%,低抗性公牛的PTA为-0.1%,这意味着高抗性比低抗性公牛的女儿患乳房炎的几率低2.3%。

以一群泌乳阶段患乳房炎率10%为例,这意味着这群奶牛的乳房炎抗病性为90%,那么高抗性公牛的女儿的乳房炎抗病性为92.2%(90+2.2),而低抗性公牛的女儿的乳房炎抗病性为89.9%(90-0.1)。因此,我们预测高抗性公牛的女儿患乳房炎率为7.8%,而低抗性公牛的女儿患乳房炎率为10.1%。

从表格中,我们可以看到高抗性和抵抗性公牛的女儿在乳房炎上的特性差异最大,其次是子宫炎和酮病。

因为乳房炎是最普遍的奶牛疾病,这在很大程度上就是为什么乳房炎存在最极端偏差的原因。但另一个极端是,较少看到真胃移位和产后瘫痪特性的极端偏差。

表中也包含了基因检测青年公牛的平均可信度,其范围从乳房炎抗病性的59%到产后瘫痪抗病性的41%,这也表明了为什么奶牛乳房炎发病率要比产后瘫痪高。

有其父必有其女,如何让后代更优秀(含抗病性预测遗传计算示例)

在图2中,我们总结了这6种疾病特性的PTAs,可以让大家对女儿发病率的差异有个大致的了解,CBCD或bull studs不会以这种形式展示这些信息。

相反,

CBCD将衡量PTAs的经济价值,以便在未来将其纳入净价值。这是合理的,因为有些疾病的成本要比其他疾病更高,例如,真胃移位比胎衣不下的治疗费用更昂贵。

研究这6种特性,发现与2010年出生的奶牛相比,一般公牛的女儿预期抗病性增加3.5%~4.5%,第90百分位公牛的女儿抗病性增加+5.2%,第10百分位公牛的女儿抗病性增加+1.9%。

缺少数据

事实上,可用于公牛的女儿健康遗传评估的数据远远少于产量及其他性状评估的数据。表中的数据包括了公牛2009年及以后出生女儿的数据,而且这些公牛都处于基因组时代,至少拥有100位女儿的记录数据。

平均而言,这些公牛的女儿中,平均患有胎衣不下(43)和乳房炎(40)的数量最多,患酮病(29)和产后瘫痪(20)数量最少,女儿数量最多的那头公牛有2845头患有胎衣不下,1330头患有产后瘫痪。

为了做一个比较,这些公牛的女儿们有泌乳记录的平均头数为744,最多的是80840头。可以在表中看到,

经女儿证明过的公牛的可信度更高,但是与我们对大多数其他特性的预期相比,仍然相对较低。

虽然这可能是CBCD的第一次抗病性评估,但事实上,这项工作已经开展了一段时间。我们已经在进行抗病性的选择了,健康特性,如长寿性、女儿怀孕率、体细胞和乳房特征,有助于帮助牧场选择更健康的奶牛。

这是培育高产、高效、健康奶牛的又一次积极努力,可以预期,随着CBCD健康数据库的增加,这些评估的可信度会稳步提高。

原文|Chad Dechow

编译 | 王封霞

排版 | 杨小寒


分享到:


相關文章: