棚室栽培蔬菜，由於人為地創造了增溫、保溫條件，避過災害性氣候，加速生長進程，能使蔬菜早熟、高產。但由於蔬菜生產週期加快，需肥量比露天蔬菜大，肥料投放量要高出50%。正是由於施肥量的增加，如控制不當，則會帶來一些負面影響，特別是冬季和早春，特別要注意合理施肥。
調控基肥和追肥比例
為了防止一次性投肥過多，應掌握施足基肥，少施追肥的原則。一般基肥比例應占總投肥量的60%，其中磷肥由於分解緩慢，可提高到70%。優質農家堆肥、廄肥一定要充分腐熟，每畝使用量為5000公斤左右，複合肥每畝一般75公斤，不宜超過100公斤。其餘追肥根據蔬菜的長勢和需肥規律靈活掌握。
適當增施有機肥
有機肥營養全面均衡，既可改良土壤，提高保肥保水能力，又能調節土壤的酸鹼度以及避免土壤因集中供肥發生肥害。除施用農家堆造的肥料外，還應大力提倡施用生物有機肥或菌肥。
實施配方施肥
根據不同蔬菜的需肥特點和土壤供肥狀況，確定氮、磷、鉀及微量元素的適宜用量與相應的施肥技術。據有關部門研究結果表明，大棚蔬菜對氮、磷、鉀的最大需求期分別為：黃瓜在種植後75～140天，番茄在30～52天，甜椒在30～60天。最佳化肥（氮、磷、鉀）施用比例為黃瓜1∶0.67∶1.83，番茄為1∶0.38∶1.75，甜椒為1∶0.38∶1。蔬菜對微量元素雖說需要極少，但必不可少。使用微肥葉面噴灑，應把好用量標準。注意葉菜不要葉面噴肥，以免增加硝酸鹽含量。
禁止淺層追肥
棚室蔬菜由於密閉程度高，淺層施肥或撒施肥料極易使肥料揮發，既降低肥效又易產生氨氣危害。因此追肥時一定要穴施或條施，深度為5～6釐米，另外還要和蔬菜根系保持8～10釐米的距離。
適溫追施氮肥
氮肥特別是尿素和碳銨只有在轉化為硝態氮時才易被蔬菜所吸收，而轉化的快慢取決於棚內溫度的高低。當棚內溫度低於15℃時，硝化細菌的活動將受到抑制。因此，追施氮肥應選擇在晴天中午前後進行，過早或過遲都會由於溫度低而降低追肥效果。對於缺氮的蔬菜或葉菜類蔬菜，噴施0.5%～1%濃度的尿素溶液效果會更佳。
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