物理防治在先
化學防治在後的方法
1
先清除菌源，少染病
感染了灰黴病的果實、葉片、花朵等部位，均含有大量的灰黴病原孢子，這些都是灰黴病的侵染源，當棚內出現高溼的環境條件時，病原菌就會從開敗的殘花、病果或柱頭上進行侵染，造成灰黴病的大發生，因此，在不良天氣到來前，要及時、全面清除這些侵染源。
當摘除感染了灰黴病的果實、葉片及花朵時一是要注意“輕拿輕放”，避免在移動病殘體時將灰黴病原孢子擴散到空氣中繼續侵染危害其他植株。二是摘除要徹底。尤其是拾花要徹底，通常菜農只注意對未脫落的病果、病葉、殘花的摘除，而已經凋落在地上的殘花因個頭小很容易被忽視，比如，番茄棚內出現的死棵，有部分原因就是因為凋落在地的殘花感染了灰黴病而引起的，所以，在拾花時也一定要將落在莖蔓、地膜或操作行內的殘花一併拾去。三是把摘除的病殘體放入袋子，封住袋口，並帶出棚內銷燬，以防進行再次傳播。
2
後藥劑防治，全面殺菌
雖然已將染有灰黴病的病殘體清除棚外，但棚內仍然存在灰黴病病原菌，所以還要進行藥劑防治。藥劑防治應做到噴藥細緻、全面，使整個植株都要接觸藥液。此外，不良天氣過後，植株抗藥性差，用藥時一是濃度千萬不要貪大，按正常濃度即可；用藥種類也不要貪多，最好不要超過4種；二是用藥最好在晴天之後2-3天進行，這樣植株可以經歷一個緩衝期，抗藥期增強，避免藥害的發生。
藥劑配方：21.2%氟唑菌酰胺+21.2%吡唑醚菌酯（健達），此配方建議在發病前期或初期使用，與喹啉銅等細菌藥劑混配；或者50%氟啶胺（福帥得）+70%丙森鋅（安泰生）。
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