1864年天京城破時，忠王李秀成等一群將領保護幼天王突圍，當時幼天王從太平門壟口突出天京城，被清軍發現後窮追不捨，李秀成為保護幼天王，讓幼天王騎著自己的戰馬先走，自己斷後 ，隨後，幼天王一行人突出了包圍，而李秀成則被俘。
後來幼天王被俘，寫下了這次突圍中多位將領的名字，其中有名有姓有王號的就有95人，這裡包括式王蕭三發。按照幼天王的記錄，當時他在諸位將領的保護下趕向湖州，尊王劉慶漢在前面 開路，養王吉慶元、藩王黃萬興、揚王李明成、式王蕭三發等多個王護衛著他急速前進。
式王蕭三發據說是蕭朝貴的族弟，不過，有關他的記載的資料極少。目前能看到的史料中，僅有王瀚在《賊情略記》提到，太平天國蘇福省所屬的諸縣鎮將佐中，有吳江平望鎮的珮天燕蕭三 發，此人是廣東人，三十多歲。至於蕭三發早年參加了太平天國哪些戰役，何時封了王，均沒有明確記載。
但可以肯定的是，隨著幼天王被俘，太平天國覆滅，蕭三發輾轉多地，動盪不安，他再次出現在史料中，是1895年劉永福的黑旗軍在臺灣和日軍交戰的時候。
我們都知道，幾乎就和太平天國期間，有一支特殊的地方武裝活躍於廣東、廣西的邊境地區，這支有貧苦農民組成的軍隊，由劉永福組建，這支軍隊在1865年舉行祭旗儀式時，以七星黑旗為 軍旗，所以被稱為黑旗軍。這支軍隊因為反抗清政府統治，所以遭到圍剿，他們也轉移到中越邊境，後來得以參加中法戰爭、中越戰爭，從而揚名歷史。
由於太平天國早期發源於兩廣地區，而蕭三發又是廣東人，對他來說，加入黑旗軍，一方面既能繼續和清政府對抗，另一方面，也繼續能和兩廣地區的父老鄉親並肩作戰。
1895年甲午中日戰爭爆發，劉永福調兵前往臺灣抗日。在當年8月，日軍佔領臺中，進攻彰化的時候，義軍與敵人在八卦山展開了激戰，這次戰役中，就有蕭三發參與，他的職位是前敵總指揮 。可以猜得出，此時的蕭三發早已經是年過六旬的老人了。
八卦山是彰化的天然屏障，形勢十分險要。但在8月27日，義軍奮勇抵抗1天后，日軍從山谷僻徑悄悄爬上山頂，第二天，日軍居高臨下，炮轟彰化城，彰化淪陷。彰化失守，臺南震動，劉永福親赴嘉義指揮戰鬥，令副將楊泗洪率五營奔赴前敵，並派人聯絡附近的簡精華、黃榮邦、林義成等義軍，共同抗敵。
8月30日晚上，楊泗洪率部進攻大莆林，簡精華、林義成等率數千人助戰。日軍警戒疏忽，經過一場激戰，日軍逃竄，但就在這次戰鬥中，楊泗洪中彈犧牲。隨後，劉永福令蕭三發統率其部黑 旗軍，指揮前敵各軍。
隨著義軍反攻節節順利，蕭三發督率各軍包圍彰化城。但彰化地勢險要，易守難攻，蕭三發幾次攻擊都未能得手，由於長期的戰鬥，部隊消耗大，卻得不到外援補充。
此時日本自遼東半島調來的2萬多人義軍到達臺北，為了避免日軍增援彰化，蕭三發全力攻打彰化城，但始終沒有打下來。到10月時，日軍有大量援軍到達，蕭三發轉移到了雲林。但日軍窮追 不捨，相持數日，彈盡糧絕，10月8日，蕭三發在中彈犧牲。隨後，抗日軍也失敗了。
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