墨阳公子
“本来是有三只眼”的这个事情，既对又不对。
首先来说，生物进化的历史上，确实有一些生物生长有第三只“眼睛”。
比如说下面的这种喙头蜥，他的脑袋上就有第三只“眼睛”，不过这一只眼睛不是严格意义上的眼睛，这个眼睛看不见东西，仅仅具有透光的能力，其作用是让大脑内的松果体感受阳光进而调整自身的体温。这只“眼睛”叫做“顶眼”或者“松果眼”。
这种不具有完全功能的第三只眼睛在很多脊椎动物的发展历史上都出现过。只是这种简化版的眼睛并没有最终发展成真正的眼睛，甚至于对于绝大部分生物而言，他们的这第三只眼睛逐渐消失了。
所以说，人类的祖先——当然是非常非常古老的那种爬行动物祖先了，是有第三只眼睛的，只是这第三只眼睛不是真的眼睛，而且那个时代距离现在太久远了。
事实上，多一只真正的眼睛对于生物而言是坏处多于好处的。
两只眼睛最大的好处就是可以看到“景深”，意思就是说我们可以通过两只眼睛来判断物体相对自身的距离，这对于生物的生存是有很大的好处的。但是再多一只眼睛，带给我们的更多的好处是微乎其微的，然而为了让这多出来的一只眼睛工作，我们可能要提供大量的能量，大脑为了更好地调度这只眼睛，可能也要有更复杂、更耗能的结构，而且眼睛非常脆弱，非常容易受到伤害。
所以说，第三只眼睛对于生物而言，坏处多于好处，因此没有生物会有两只以上的具有完整意义的眼睛。（昆虫的复眼是另外一回事）
进化的过程中，很多生物体内还是保存了原始的“松果体”。
人类的大脑中有一种东西叫做“松果体”，这个松果体就是人类古老的爬行动物祖先逐渐演变后的“第三只眼”。松果体的位置可以参考下图。
这个“第三只眼”主要的作用是调节生物钟，通过各种信号感受外界的阳光来控制褪黑激素的分泌的。
我们重新整理一下思路：很久之前，爬行动物有第三只不具有完整功能的眼睛——“松果眼”，因为种种原因，这第三只“眼睛”没有最后进化成真正的眼睛，甚至于逐渐从体外进入体内，变成了松果体。所以我们从进化的角度说，这是第三只“眼睛”，即便这只眼睛跟我们传统意义上的眼睛没有任何相似之处。
最后，这第三只眼睛跟什么“慧眼”、“天眼”、“修炼”没有半点儿关系，别听一些神棍胡说八道。
SilentTurbine
有，但没长脑门上……也没长脑袋的表层……也不能修炼用……
“第三只眼”至少从爬行动物时代有就有了，但是在生物进化中被逐渐内化，现在已经变成了脑的一部分。这玩意儿，叫松果体。
你别以为松果体会像眼睛那么大……它小到几乎很难让你找到——大约只有5-8mm长，3-5mm宽，形似松果，重量不超过1/5克。即使向上追溯到现存的古老爬行动物，比如鳄蜥，虽然还有一点外漏，但也是针尖大小，并且只有感光作用，不能成像。现在，在我们的脑袋里，它在这（红色箭头所指的区域，则是大脑侧面解剖图，左边为前，右边为后）：
松果体对动物（也包括你我）的生活节律有直接影响，能够对眼睛接受到的光刺激作出反应。或者说，它就是我们体内的“钟表”，让我们的身体知道自己所处的时间，并发生周期性的变化——比如，每到晚上，就都会变得想睡觉。松果体产生褪黑激素、黄体生成素释放激素等多种激素，现在更像是一个腺体，其中，最主要的产物，当然是褪黑激素（melatonin，MLT/MT）。
褪黑激素是综合性激素，对各个器官和系统都有调控作用，能够影响和干预人和动物的的许多神经活动，并使之呈现节律性变化，如体温、代谢、睡眠与觉醒、情绪、智力等等。需要特别指出的是，褪黑激素能对下丘脑－垂体－性腺（HPG）轴起作用，影响动物的生殖节律，使动物出现我们常挂在嘴边的发情期，也对女性的月经周期起作用。
冉浩
为什么七岁以下的儿童大人不让晚上出门，或者每天晚上不停的哭，找人看完处理一下就不哭了？因为年龄越小松果体越发达天眼就越清晰，这个和灵性有非常大的关系，人随着年龄的增长，思想、意念、行为、德行，都会有所变化，在我们走过每一个阶段不停的寻找答案的时候，殊不知答案一直就在原地等我们，人的诞生与结束都是两个极点，没有本质区别，所以有些人一辈子都没有活明白，而有些人一直都沁静、随性、自在。
励志真理
人只有两只眼睛，这是连幼儿园的孩童都知道的事实，但是随着时代的发展，身体结构的变化，大家可曾知道，我们人类的身上曾经有过第三只眼睛？
以前读书的时候与学校里面的教授很熟，经常帮他整理各种各样的资料和数据，因此教授经常会把很多不常在上课的时候讲的知识传授给我，让我受益匪浅，一次在帮教授整理资料的时候偶然看到了一篇非常奇特的研究论文，在论文中搜集了各种各样的人类进化数据以及各种古人类骨骼的样式，最终以专业的人类进化学理论总结出了一个结论，那就是在很久以前，人类曾经有过第三只眼。 
当时看到这篇研究论文的时候，我大为惊奇，捧着看了许久，教授看到我对这篇论文这么感兴趣，就坐了下来，跟我讨论了起来，我很惊奇的问教授这篇论文的真实可靠性，教授淡淡的笑了笑，起身走向书柜，拿起了一大沓的文件给我，我拿着这沓文件，逐字逐句的看了起来，上面密密麻麻写着各种古人类的数据以及人类曾有过第三只眼睛的证据，看完之后我的眼睛就亮了起来，仿佛得知了世界上最大的秘密一般高兴得跳了起来。
在往后的时间里，每当有人说起三只眼的传说人物的时候，我都会苦口婆心的跟他们解释说曾经我们的祖先都是有着三只眼睛的，只不过随着时代的发展消失了罢了。
所以说人本来有着三只眼睛，这是真的，并不是人们无聊随编乱造的，有着其真实可靠性，曾几何时在古时候，人们把我们的五谷轮回之地、阴阳汇通的出口称为屁眼，虽然这个词语在现在我们很多人看来有些不雅，但是我们人类的第三只眼，却真真实实的存在于我们的历史中，只不过后来随着科技文化的发展，我们的很多名词都发生了变化，现在人们给我们的五谷轮回之地起了个专业的学术名称，称为肛门。 好了，我编不下去了！
孤客生
第三只眼是个比喻概念，指一只无形但又能夠借助有形肉眼而看到肉眼所看不到的那些一一与有相对的无的一一东西，并且能夠把这些"无"变成自然界中根本不发生，而只有在人的活动中才能发生的那些物质形式和它们的运动形态。如科学的眼睛，能工巧匠的眼睛，甚至连简单移动物体都受着这只眼的支配。说个最简单的事实，一堆碎木料头子，在木工眼里可从中看到制作小物件的料子或加工成木工板。而普通人眼里这些碎料或当柴货烧，或当一堆垃圾处理。为什么会发生这个现象，正确的答案是因为对这堆废料关于"无之以为用"看法不同。无，最初的意思是凭肉眼不论怎么看，翻来覆去看，纯粹只格某种物而不与其它物相联系，就看不到"无"这种东西。孙悟空变成一座小庙，却把尾巴变成杆立于庙后，二郎神一眼便看穿是孙悟空变的。虽是神话，但可以说明第三只眼能夠看到事物相互联系的真相。如果没有这只无形之眼，而纯靠有形肉眼，恐怕连两件自然的事实也联系不起来，恐怕一切科学技术也不会发生了。因此，所谓第三只眼其实就是普遍联系的观点。不理解道，基本上都是普遍联系的观点不充分或者没有，让片面的观点占了思维阵地。
刘俊
这个问题本身的意义并不大，虽然在网络上一直都在流传着古生物有三只眼，最后被退化成松果体，而且还是在爬行动物的时候有三只眼，但是对于人类而言，是没有三只眼的。
至少在现阶段的人类考古学中，所能寻找到的远古人类的化石都不支持人类有三只眼的传说，因为，如果人类有三只眼的话，那么在远古人类的化石上，应该可以寻找到第三只眼在古人类化石头颅上的相应位置，可惜的是，截至目前为止，我们所能寻找到的任何一个远古人类的头颅化石，都没有第三个眼眶的存在。
如果远古人类真的有第三只眼睛的话，那么在相应的位置上应该会有眼眶的存在，毕竟眼睛不可能只是存在于皮肤之上而没有眼眶的位置。
当然，如果说其它的远古生物会有第三只眼的存在的话，也是一种没有根据的说法，如果你曾经去过古生物博物馆参观的话，你一定会知道：直至今日，我们人类还没能够在任何一件远古生物的头颅化石上寻找到可以容纳第三只眼睛的眼眶的位置！
拉拉酋长
人存在第三只眼，可能是某些研究人员根据某些资料（本人未关注、接触过此方面资料）推论而得来的推理。估计只能从基因退化方面来做实证，缺乏实物证明只能让人存在的第三只眼成为感观，本来此题我不想回答，但看到前面有人谈到，佛教他的悟性可开天门也就是开天眼得道理的说法，才想根据自身实际情况作个回答，人除了可见肉眼外还存在三个感观眼（个人真实验证），这三个感观眼作用等同于真实肉眼，可使人闭上眼睛也能清晰照见外界一切，看见平常世界看不见的实况景观，曾经一段特殊时期，各种经历使我学会了一些特殊技能，象某明奇妙学会使自己闭着双眼，也能清晰看见外界和平常看不见的空间景象，及转换视角观察？后果是使自己行为表现异常，如我双手按着眼睛走路，及做正常人行为表现，旁观者却说我发神经病，没事双手按住双眼却对我按住双眼的正常表现，不感到好奇。这种功能的开啟和那个时期的经历，使我非常烦恼纵使自己时刻，提醒自己要理性理智对待人生变化，还是时常失态失常成为平常人眼中的神级病患者，这种游离间的痛苦使我不再追逐好奇，克意谈化自身功能回归现实最终与现实保持同步，但天地、宇宙神性永远记心间，因为曾经开啟过第三只感观眼，所以告诉普通朋友们，我们看见的空间存在另一种，我们看不见的景象，这景象存在于现实空间，不同于异度间（维度空间）。
顿悟146595210
在过去有人说过，这个人很聪明，他的天门开了，也就是悟性，天门指的就是脑门上的第三只眼，比如佛教他的悟性开了天门也就是天眼得道理。人的三只眼是存在着，它是灵魂的之窗，为什么人现在看不到第三只眼存在，因为在大脑里在休眠状态，实际就是一个信息的导体，想开发这种功能就得主观灵动性必须积极发挥作用，以客观的条件来对接信息的思路，这样才能发挥天门开阔，也就是人们的思维能力（悟性）的灵动性。这就是人们的第三只眼有效发挥的概念。人人都有但怎么开发就是人们的主观灵动性的问题，希望大家在主观上积极主动就能激活第三只眼的灵动性，也就是能发挥信息的感作用。谢谢！
AAAET
第三只眼是灵眼
墨墨159746763
用第三只眼的提法来形容，不算过份。修练或有过濒死经历的人都知道，所谓的灵魂出游或出壳可以看到自已，看到很远距离正在发生的事。其实正是人脑在特定条件下，各种机制短暂分离的过程。我们与外部事物接触，主要可以通过相、识、念来表达，其次还有听觉、语言、嗅觉等。在人脑中归结于不同区域且互相影响。在特定的条件下，相识念可能分离。念是占有绝对主导地位作用的，也是大脑运转后的结果。第三只眼相排最后，只要逆行一次，全程结束。所以人死后叫魂飞魄散。至于相信人死还有灵魂在的人是信仰，不想多说。人脑科学的研究或寄希望于未来。欢迎评论，共同探讨。
