在臨床工作中，造成支氣管擴張的疾病譜龐大，已知的病因歸納如下：
1、囊性纖維化、囊性纖維化跨膜傳導調節因子基因突變與氣管擴張
囊性纖維化是白種人支氣管擴張的主要原因。在美國，儘管囊性纖維化的平均診斷年齡為6個月，但該病患者實際年齡是從0～80歲。近30年成年患者數量增加，一方面是因為患者的預期壽命延長，另一方面，導致該病的囊性纖維化跨膜傳導調節因子（CFTR）基因突變種類多達1604種，一些溫和突變造成不典型囊性纖維化。這些患者多有胰腺炎病史，肺部病變輕，汗液分析結果可能正常，生存期也較長。CFTR 基因突變是囊性纖維化的明確病因，它與非囊性纖維化支氣管擴張的關係尚存爭議。
2、感 染
鳥分枝桿菌是主要的一類。由鳥分枝桿菌引起的肺部感染首先報道於 COPD 合併纖維空洞的老年男性吸菸患者。隨後的研究描述由鳥分枝桿菌造成肺部感染的患者中 81%為老年女性，中葉或舌葉病變。HRCT表現為多發的小結節(＜1cm)及柱樣支氣管擴張和“樹芽徵”。影像與病理組織學的對比研究發現：小結節可以導致氣道擴張，無論是否形成肉芽腫，炎症均可造成支氣管壁的損傷。這些證據表明非結核分支桿菌侵犯肺組織有形成支氣管擴張的可能。囊性纖維化和CFTR突變患者中非典型分枝桿菌的分離率較高，分別為20%和36.5%。
3、免疫功能障礙
肺對微生物感染的防禦機制是複雜並且分層次的。第一道防線包括：由上皮細胞、黏膜、纖毛構成的物理屏障和具有調理作用的肽類、溶菌酶和表面蛋白。第二防線是指：免疫系統的活化和調節。當免疫系統受到激發後，B淋巴細胞產生抗體，T淋巴細胞決定免疫系統反應的強弱，在感染的轉歸上起重要作用。我們對原發性免疫缺陷病造成支氣管擴張的認識越來越多。常見的免疫缺陷病是抗體減少和功能障礙，其他少見的情況包括白細胞黏附缺陷、氧爆發和趨化障礙。
4、慢性阻塞性肺疾病合併支氣管擴張
2002年Barker首先描述了支氣管擴張與COPD疾病特點重疊，如慢性咳嗽和氣道阻塞。此後，關於COPD 併發支氣管擴張的相關研究逐漸增多。文獻報道，4%~57.6%的COPD患者經HRCT證實存在支氣管擴張。這組患者氣道阻塞的程度重，急性加重的次數增多，可以分離出定植病原微生物，但對預後的影響尚不明確。
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