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树枝上部茂盛下部弱是自然现象，不过出现这种现象还是你在整形修剪上的问题。不知道你是不是按正确的方式定株整形的，我来初步说说幼树定干整形方法。
1、定植当年整形，定植后距地面40――60公方处定干，剪口下留10――15公方处选留5――6饱满芽，到6月中、上旬从主干新梢中选留3个主枝，成三角形枝与枝的角度基本120度，保持其方枝角度为45度左右，除3组主枝外，其余枝条枝芽全部摘除。
2、第二年萌芽前对选定的主枝，留取35――45公方短截，遇到主枝强弱不均时，可把强枝留短些，，弱枝剪留长些，剪口芽均留外芽，第=、第三芽留两侧。
3、如果是你说的那样的话，那只有摘心和短截两种方法。一，把主枝上部分枝顶端芽摘心，以控其狂长，有利于下部技头养份的供应。二、一不做，二不休，干跪短截，在主枝三个分枝外，全部短截然后，再重新培植主枝。这样的话可使树体强状，不过挂果期又推迟了一年。(仅供参考)。
晚霞余光
依个人实际经验与手法采取必要措施。
花椒幼树若采用修剪法，就会形成阔展，占用空间面积大，影响种植棵树，若是套种兼作，上部茂盛好，如是仅仅做为普通种养，可进行修剪，疏弱枝条，留壮条。
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花椒的剪枝方法供椒农学习参考：
修剪方法，主要介绍疏剪、短剪和回缩剪三种。
(一) 疏剪
疏剪是将枝条从基部剪去。其作用:①疏除过密枝、交叉枝、重叠枝、纤弱枝和着生位置不当的枝条，使主侧枝配合匀称，通风透光，节省养分的消耗;②疏去干枯枝、病虫枝、减少病虫危害;③疏去树冠外围的密生枝，使树冠内部通风透光，提高内膛结实率。同时，也起到提高果实质量的作用。
花椒怎样剪枝？花椒树修剪方法详解
(二)短剪
短剪是剪去枝条的一部分。其作用:①抑制强旺的营养枝和徒长枝，让它萌发侧枝，形成结果枝;②刺激较弱的枝条，抽生强壮的新梢或抽生中庸的结果枝;③短剪结果枝，减少花量，增加营养枝，平衡大小年结果;④重剪衰老的主、侧枝，刺激发生健旺的新梢，更新树冠，复壮树势;⑤摘心，也是一种短剪手段，它能及早减少养分消耗。
(三)回缩剪
回缩剪是将多年生长枝条回缩到分枝处。作用是:①降低先端的优势位里，改变外长枝的方向，改善通风透光条件，控制树冠扩大;②能缩短枝条的长度.减少枝芽量和母枝总量;③能使剪口枝长势削弱，剪口下第二、第三枝长势增强。
花椒树修剪时一定要按不同的生长阶段采取相应的修剪方法。
(一)幼树修剪
花椒树在幼年时期，应掌握整形和结果并重的原则，采取以疏剪为主，疏剪与短剪相结合的修剪方法。栽后第一年按要求高度剪截，第二年在发芽前除去树干基部30一50厘米处的枝条，并均匀保留5一7个主枝进行短截，其余枝条不短截，疏除拥挤枝、细弱枝、交叉枝、病虫枝，长放强壮枝。幼年和壮年树应以疏剪为主，使其迅速扩大树冠成形。同时，适当多留一些小枝，成为辅养枝、结果枝，以利早结果、多结果。对于强壮的枝条，要放而不剪;对于较弱的枝条要短剪，促使发生强健枝。短剪宜轻不宜重，一般剪去枝条的1/3或1/4即可。
(二)盛果期树修剪
盛果期花椒树的修剪，应逐步疏除多余大枝，完成整形工作，对冠内枝条进行细致修剪，应以短剪为主，短剪与疏剪相结合。通过短剪不断更新结果枝组，同时使各级枝条不断复壮，促进生长，形成结果枝。疏除病虫枝，交叉占用空间，并结合短截营养枝，对生长中庸的营养枝先行缓放，结果后缩成枝组，对有空间生长的旺枝先轻短截，下年去强留弱，培养成枝组。此外，在这一时期内，还要注意在树冠内部适当保留一些营养枝，就是 徒长枝也要注意短剪利用，以免树冠内膛空虚，防止结果部位外移。盛果期树的修剪程度，应依树而定。一般生长健壮的树，修剪宜轻;生长衰弱、结果过多的树，修剪宜重。每年在落叶后应及时疏除枯死枝，回缩更新老果枝，以保持树体旺盛的结果能力。有大小年现象的花椒树，大年应重剪结果枝，多留发育枝或促生发育枝;小年应多留结果枝，适当疏除一些发育枝。凡是大小年现象严重的花椒园，如果在正确运用上述修剪方法的同时，再加上其他的农业技术措施，在3-5年内定能克服大小年现象。
(三)老树修剪
花椒树衰老时期.主要运用短剪和疏剪，促进结果枝组更新。疏剪能促进开花结实;短剪有利于抽生强壮的新梢，加强营养生长，提高树势。去弱枝，留大芽，及时更新复壮结果枝组，去老养小，疏弱留壮，选壮枝壮芽带头，以恢复树势。对已衰老需要更新的树，既要注意利用徒长枝，也要对骨架进行交替更新。
花椒树潜伏芽的寿命较长，剪口也较容易愈合，因此，对衰老的树，在加强肥水管理的同时，可以进行骨干枝轮换回缩促进更新。但花椒整株衰老后，要及时进行全株更新。
