曹操与华佗同是沛国谯（今安徽亳州）人，华佗被民间誉为神医，曹操本该珍惜才对，但他却毫不手软杀了华佗，所著《青囊经》也佚失。
华佗之死的原因，一直众说纷纭：
猜忌疑心说
电视剧《三国演义》第58集：“关云长刮骨疗毒，吕子明白衣渡江”。
关羽水淹七军，擒于禁，斩庞德，但在攻打樊城时被曹仁弓弩手所伤，剑毒入骨，右臂青肿，不能运动。适逢阴雨，剑伤发作加剧，华佗驾船来到，这里甚为感人，体现了人们惜英雄爱英雄的高尚情操。华佗为关羽刮骨疗毒，关羽一边饮酒下棋，淡笑自若，后华佗由衷赞叹：“将军真乃天神也。”
然，事实上《三国志·关羽传》中写关公“尝(曾)为流矢所中，贯其左臂”，伤的是“左臂”，而不是“右臂”。以后虽然有医者“刮骨去毒……” 《志》记全文85字并无一字说医者为谁，也就是个无名氏。
而早在11年前(建安十三年，公元208年)，名医华佗因为曹操头风发作屡召不至，操“大怒”，拿回许昌，“遂考竟佗”，也就是拷打至死。后来曹操的儿子仓舒(曹冲)病危，曹操还“吾悔杀华佗”。
华佗都死了十多年，上哪儿去给关公“刮骨疗毒”。 因而说华佗之灾，是曹操怀疑华佗是为了给关公报仇，才要劈开他的头颅治疗头风，一怒才杀了华佗，显然这条纯属子虚乌有。
罗贯中老先生写的是小说，他想把哪路大神凑一起，是他的自由，都是“合情合法”的。
持才挟官说
也有说华佗是感于医术为“方技”，在封建社会是“贱业”，不被人看得起，《后汉书方术传——华佗篇》中这样一句话，或许可以说明一点问题：“为人性恶，难得意，且耻以医见业。”因此推断他从医只是业余爱好，主要还是追求“学而优则仕”的伟大理想。
所以，曹操要他长期做贴身的‘御医’，华佗等来等去，觉得赐官无望，便以家中妻子生病为由，一去不复返。也不管曹操头疼的要命，只多次请求延长假期。
曹操很生气，便派人去查看，如果他妻子真的病了，便赐小豆四千升，放宽假期期限；如果欺骗，就逮捕问罪。结果证实华佗撒谎，于是把他收监，经审讯验实，华佗供认服罪。
谋臣荀彧为华佗求情，说：“佗术实工，人命所县，宜含宥之。”而曹操不从，并说：“不忧，天下当无此鼠辈耶？”曹操生气他持才要挟，很是看不起他，就把他杀了。
也有说华佗是持才清高，不愿意为曹操这等权贵奴役，因此借口拖延。曹操按照“不为君用大不敬”之罪，杀了他，以泻心头之恨。这其中而不管哪种说法的结果，是华佗那卷珍贵的医书《青囊经》，最后都被证实是付诸一炬，没能流传下来，真是医学上一大损失。
术业有专攻
《后汉书•华佗传》说他“兼通数经，晓养性之术”，尤其“精于方药”。 华佗是东汉末年三位杰出的医学家之一。华佗深入民间，足迹遍于中原大地和江淮平原，在内、外、妇、儿各科的临证诊治中，曾创造了许多医学奇迹。
他发明了针灸，更懂养生之术，发明了“五禽戏”。尤其以他发明的麻沸散、行剖腹术闻名于世。后世每以“华佗再世”、“元化重生”称誉他。
传说，当时没有麻药，他在治疗各种剜肉锯骨的伤病时，病人往往因承受不住疼痛，不是昏厥，就是痉挛了，哭爹喊娘真是惨不忍睹。
于是，他就想方设法来减轻病人的痛苦。
有一天，有个病人，因为吃了山上的一种果子，躺在地上不能动，脉搏和体温一切正常。他有所启发，就上山去寻找，他年小的儿子沸儿，也吵着要去，他便带着一起。
到了山上，终于找到了那个人形容的果子，便对沸儿说：“我要是吃了这个果子不醒人事，你就赶紧去叫人把我弄回家，在这山上晚上不安全，”沸儿说：“那还是让我吃吧！我要是不能动，您还可以把我抱回家。”
华佗也觉得有理，沸儿吃了一个，没什么反应，又吃了一个，还是没反应，后来，吃了很多个，突然，菲儿脸色一变，往地上瘫软下去。
华佗等了一阵子，拍拍儿子的脸，没有反应，赶紧抱回家，可是，等到了家，沸儿就死了。华佗伤心欲绝，后来，他把发现的药和其它几种草药结合研究，发明了麻醉药，以儿子的名字取名为“沸儿散”，后来慢慢叫成“麻沸散”。
当然，“麻沸散”的创立还有各种传说，但付出与牺牲肯定是无法避免的。
持业需以恒
我们知道神农尝百草，也知道屠呦呦与青蒿素，都是付出毕生心血的事业。任何的伟大，想来都不是容易的事。
延伸想象，华佗医学上这一大堆成果，在那个只有原始工具的背景下，总也不可能是一朝一夕能随意采撷来的。
这样一个悬壶济世、慈悲救人、执着于医学的人，怎么相信他会有精神去清高自傲，持才自庸？或者是自渐形秽、虚慕官职？
只看近代我们杰出的各类伟大科学家们，他们的生平，多有一份持之以恒、坚韧不拔的决心，他们不受世俗干预、不受环境制约，生活多朴素，性情多高洁。怀抱牺牲小我，成就大我的精神，从而才造就了那一个个传奇人生。
华佗这样的大神，想必曹操的愤怒，或后人的任何猜想，怕都只是以时事渡了“英雄”而已，而全不能真正去读懂一个“匠人”朴素的心。
