一、對於長期零報稅的企業，會被罰款，嚴重的還會被稽查。首先稅務機關會把納稅人納入重點的監控範圍內，然後進行相關的納稅評估，如果被評估發現隱瞞收入，虛開發票等行為的，則就要補繳稅款和滯納金。
二、如果企業長期零報稅，可能被稅務納入為走逃戶，納入走逃戶很嚴重，會被納入重大的失信黑名單中並且對外公告，還會被評定為D級的納稅人，被評為D級納稅人，就得承擔D級納稅人的所有後果！
三、如果企業長期零報稅，並且納稅人持有發票的，則發票就會被稅務降板降量，還要納稅人定期到稅務機關進行發票核查。
四、如果企業長期零報稅，被稅務機關核查到，稅務局就會採用成本費用的公司來核定納稅人的收入。
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