轉錄組：研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有 mRNA。
轉錄組測序能夠從整體水平研究基因表達量以及基因結構，揭示特定生物學過程中的分子機理。目前，轉錄組可得到大量差異基因、眾多調控網絡，給篩選目標候選基因和關鍵途徑帶來了很大的困難。
代謝組：代謝物是生物體發育和生理狀態在代謝水平的體現，是生物體表型的基礎。生物信息從基因組到代謝組的傳遞實現了遺傳物質和環境因素對個體生長、發育、衰老的調控。作為生物體表型的體現者，代謝物能夠幫助人們有效地瞭解生命現象，揭示生命本質。
轉錄組 + 代謝組：在系統生物學研究時代，生物發育過程複雜多變，基因調控網絡複雜，單獨用一種組學對系統生物學進行研究，往往比較片面。利用轉錄組的數據獲得大量差異表達的基因，與代謝組檢測得到的差異代謝物進行關聯分析，從原因和結果兩個層次分析生物體的內在變化，鎖定與代謝物變化重點通路，構建核心調控網絡，全面探究生物的生長髮育及脅迫機制，從整體上解釋生物學問題。
以下是本專題總結的關於多組學研究的完整研究思路。
本專題旨在總結代謝組學和轉錄組學聯合應用文獻，為廣大相關的科研人員提供有效的研究思路。
如需要詳細的文獻解讀思路合集以及文獻包，可私聊。
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