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從2019年10月10日開始，至今已經給大家推薦了134篇單細胞領域最新高分文獻，本週最新推薦的5篇高分文章信息如下。
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序號：2020-052
作者通過時間間隔成像和單細胞RNA-seq來測量年輕和年老的肌肉乾細胞的激活軌跡和速率，挺有意思的推薦給大家~
小鼠肌肉乾細胞中衰老誘導的異常狀態轉變動力學
【文獻類別】細胞生物學-衰老
【發表期刊】Development
【影響因子】5.8
【發表時間】2020.03.20
【文章摘要】
小鼠肌肉乾細胞(MuSCs)經歷了從靜止到活化的轉變，這是再生所必需的，但其活化的軌跡和動力學是否隨著年齡的增長而改變仍是未知的。本文中，研究人員使用時間間隔成像和單細胞RNA-seq來測量年輕和年老的MuSCs的激活軌跡和速率。研究人員發現在老化細胞中激活軌跡是保守的，並開發了有效的細胞年齡機器學習分類器。通過細胞行為分析和RNA速度分析，研究人員發現在衰老的MuSC中，激活動力學被延遲，這表明幹細胞動力學的變化可能導致隨著年齡的增長，幹細胞功能受損。有趣的是，研究人員還發現，幹細胞的激活似乎是一個隨機的過程，經常發生逆轉，而不是一個連續的線性進展。這些結果支持了一種觀點，即衰老的幹細胞表型是穩定細胞狀態位置的差異和它們之間轉化率的差異的組合。
序號：2020-053
慢性疼痛是全球致殘的主要原因，並且具有代際傳遞的現象。本文作者的研究發現，為慢性疼痛的正確治療有著積極引導。
MeCP2介導慢性疼痛的跨代傳遞
【文獻類別】神經學-痛疼
【研究手段】scRNA-seq、體內成像、免疫沉澱
【技術平臺】SMART-Seq
【發表期刊】Progress in Neurobiology
【影響因子】10.7
【發表時間】2020.03.18
【文章摘要】
疼痛症狀可以跨代傳播，但這些結果背後的機制仍知之甚少。本文中，研究人員確定了初級體感皮層(S1)穀氨酸神經元DNA甲基- CpG結合蛋白2 (MeCP2)在疼痛的跨代傳遞中的重要作用。在雌性小鼠慢性疼痛模型中，後代表現出明顯的疼痛敏感性。在這些小鼠中，MeCP2在S1穀氨酸(GluS1)神經元中的表達增加，這與神經元活動的增加有關。GluS1神經元MeCP2在有疼痛的母鼠中表達下調，使子代疼痛敏化消失，而MeCP2在無疼痛的母鼠中過表達，導致子代疼痛敏化。值得注意的是，單細胞測序和染色質免疫沉澱分析顯示，在子代和母體GluS1神經元中，多種基因的表達發生了變化，其中一些基因是由MeCP2調控的。這些結果共同證明了MeCP2作為一種關鍵的調節因子，通過對GluS1神經元不適應的作用，在疼痛的跨代傳遞中起著重要的作用。
序號：2020-054
這篇文章中單細胞結果是利用dbGaP中已發表數據而來，希望做數據庫挖掘的老師可以借鑑一下。
IL-5Rα標記阿司匹林惡化呼吸道疾病的鼻息肉IgG4和IgE表達細胞
【文獻類別】疾病研究-呼吸道
【發表期刊】J Allergy Clin Immunol
【影響因子】14.1
【發表時間】2020.03.18
【文章摘要】
阿斯匹林加重呼吸系統疾病(AERD)中鼻息肉的病因尚不清楚。抗體水平升高與鼻息肉(NPs)的疾病嚴重程度有關，但NPs中局部抗體產生的上游驅動因素尚未確定。研究人員試圖確定來自AERD受試者的NPs中局部抗體表達細胞(AECs)的上游驅動因素和表型特徵。研究人員從AERD患者、有NPs (CRSwNP)的慢性鼻竇炎患者、無NPs (CRSsNP)的CRS患者和非CRS對照組患者中獲取鼻竇組織。通過ELISA和免疫組織化學方法定量檢測組織抗體水平，並與疾病嚴重程度相關。研究人員通過單細胞RNA測序、流式細胞儀和免疫熒光描述AECs的特徵，並通過IL-5刺激並進行RNA-seq和qPCR探究IL-5Rα的功能。研究人員確定了AERD中通過IL5RA和IGHG4或IGHEAECs的轉錄富集提升AECs，伴隨IL-5Rα表面表達和功能性IL-5的信號。組織IgE和IgG4在AERD中升高，IgE水平越高，NP再生越快。研究人員的發現表明在AERD中IL-5Rα+ AECs在促進局部抗體產生和加重NPs的角色。
序號：2020-055
文章通過體外培養獲得胰島類器官，是糖尿病研究領域的一個重大突破。
從成體Procr+祖細胞培養獲得胰島類器官
【文獻類別】細胞發育-胰島類器官
【研究手段】scRNA-seq、電鏡
【技術平臺】10x
【發表期刊】Cell
【影響因子】36.2
【發表時間】2020.03.19
【文章摘要】
體外製造功能性β細胞通常是具有挑戰性的。本文中，研究人員通過單細胞RNA測序(scRNA-seq)，描述了一種以前未被識別的成年小鼠胰腺蛋白C受體陽性(Procr+)細胞群。這些細胞存在於胰島，不表達分化標記物，具有上皮-間質轉化的特徵。通過遺傳譜系追蹤，Procr+胰島細胞克隆擴增，並在成年期產生所有四種內分泌細胞類型。分選後的Procr+細胞，佔胰島細胞總數的1%，在克隆密度下培養時可穩定地形成胰島類器官。通過連續傳代，可以在較長時間內保持指數擴增，而在培養的任何時間點都可以誘導分化。在分化胰島器官中，β細胞占主導地位,而α、δ、PP細胞發生在較低的頻率。類器官對葡萄糖有反應並分泌胰島素。在糖尿病小鼠移植後，這些器官逆轉了疾病。這些結果表明，成年小鼠胰島含有Procr+內分泌祖細胞群。
序號：2020-056
本文作者自己開發了LaST的流程，應用空間轉錄組學以單細胞和定量的方式篩選大的組織區域。
原位空間轉錄組圖譜揭示哺乳動物大腦皮層星狀細胞層
【文獻類別】空間轉錄組-星狀細胞
【研究手段】smFISH、RNAScope
【技術平臺】LaST
【發表期刊】Nature Neuroscience
【影響因子】21.1
【發表時間】2020.03.16
【文章摘要】
雖然大腦皮層被組織成六個興奮性神經元層，但膠質細胞是否有明顯的分層尚不清楚。在本研究中，研究人員開發了一個高通量的流程，大面積空間轉錄組(LaST)圖譜，可以在原位定量單細胞基因表達。研究人員在小鼠皮層中篩選了46個星狀細胞多樣性的候選基因，在不同於神經元的梯度層模式中識別了淺層、中層和深層星狀細胞。星狀細胞層特徵建立於出生後早期皮層，主要存在於成年小鼠和人類皮層。單細胞RNA測序和空間重建分析進一步證實了成體皮層中存在星形細胞層。Satb2和Reeler突變改變了神經元有絲分裂後的發育，足以改變神經膠質的分層，這表明了神經信號的指導作用。最後，星形細胞層模式在小鼠皮層區域間分化。這些發現表明興奮性神經元和星形膠質細胞被組織成與譜系相關的不同層狀結構。
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