斯坦福大學現在是世界名校，但在其創立的頭20年，也是多災多難，先後經歷了資金短缺、教師流失、加州地震、學生鬧事四次“大地震”，現在看來，也算是大難不死必有後福了。
斯坦福去世，幾乎將錢丟光
1893年，斯坦福大學創始人斯坦福因中風去世。在遺囑中，斯坦福贈給斯坦福大學250萬美元，但當時其外債約為1800萬美元。為保證債權人的利益，要求是先還債再談捐贈的問題，這樣一來這250萬美元就免談了，而當時斯坦福大學沒有一分錢的儲備金，每個月光工資就要1.5萬美元，眼看就要關門了。
結果，還是法官聰明，他網開一面，將斯坦福大學的校長和教授都視為斯坦福夫人的“僕人”，每個月可領1.25萬美元的生活費，其餘用學雜費來解決。
小心翼翼過了三年，1896年，聯邦政府又跳了出來，要求凍結斯坦福的財產，斯坦福夫人找到時任總統克利夫蘭才算擺平。此後三年，斯坦福夫人堅持不關閉斯坦福大學，而是裁減自己的僕人，壓編自己的開銷，變賣自己的首飾，到1899年這場財務危機才算基本結束，斯坦福大學躲過一劫。
羅斯事件，幾乎使教授走光
財務危機剛過，1900年又爆發了“羅斯事件”，讓斯坦福夫人前期的努力幾乎一筆勾銷。羅斯是當時斯坦福的經濟學教授，但對社會問題非常敏感，經常在校內外發表自己的見解。羅斯明確支持鐵路工人罷工，其文章也被用於黨派競選，斯坦福夫人十分不滿，認為羅斯過於偏激，也將斯坦福大學拖進了黨派之爭，一直想把羅斯開除。但時任校長喬丹從中和稀泥，倒也相安無事。
1990年，羅斯又在舊金山一勞工集會上發表言論，反對無限制讓東方人移民美國，並說：我們最好以槍口來歡迎駛向我們的裝滿日本人的船隻。這讓斯坦福夫人大為光火，要知道斯坦福修中太平洋鐵路時就僱用了大量亞裔勞工，於是堅決要求將其開除。
羅斯被開除，許多教授覺得學術自由受到侵害，於是紛紛抗議並辭職，斯坦福大學一時陷入教授危機。
加州地震，幾乎使校舍坍光
羅斯事件後不到6年，1906年，舊金山又爆發大地震，192英里長的地段向北移了16英寸，斯坦福大學新建的大拱門、圖書館、教堂和當時全美最大的私人博物館毀於一旦。好在時任校長喬丹本就對斯坦福夫人將錢主要花在建築上不滿，他很坦然地對學生髮表講話：“大學之所以是大學，不是因為它有建築物，而是它有教授和學生”。
斯坦福大學藝術博物館1891年初建，1906年毀於地震，1963年重啟。現在已是法國巴黎之外的收藏羅丹雕塑最多、最豐富的機構。
整肅學風，幾乎將學生罰光
斯坦福大學當時規定宿舍內嚴禁吸菸飲酒，但有一次創始人斯坦福在男生宿舍招待前總統哈里森，那可是有煙有酒好招待。學生一看，好傢伙，敢情這是上流社會的選擇嘛，於是上行下效，學生開始酗酒成分，違法亂紀行為層出不窮。高年級學生酒後變著花樣欺負低年級學生，宿舍“不醉一次的新生禁止入內”竟成潛規則，甚至有學生凌晨大醉而歸，被人當強盜一槍打死。
學校決定成立“學生事務委員會”，嚴厲打擊酗酒行為，而學生認為這限制了他們的自由，300多人遊行威，燒燬告示。最後，40多名學生被停學，150多名學生被罰，要求多修五到十個學分才能畢業。
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