土壤資源。雲南因氣候、生物、地質、地形等相互作用，形成了多種多樣土壤類型，土壤垂直分佈特點明顯。經初步劃分，全省有16個土壤類型，佔到全國的1/4。其中，紅壤面積佔全省土地面積的50%，是省內分佈最廣、最重要的土壤資源，故云南有“紅土高原”“紅土地”之稱。雲南稻田土壤細分有50多種，其中，大的類型有十多種。成土母質多為沖積物和湖積物，部分為紅壤性和紫色性水稻土。大部土壤分呈中性和微酸性，有機質在1.5%～3.0%，氮磷養分含量比旱地高。山區旱地土壤約佔全省的64%，主要為紅土和黃土。壩區旱地土壤約佔17%，主要為紅土。旱地土壤分佈比較分散，施肥水平不高，加之水土流失，土壤有機質普遍較水田低。常用耕地面積 423.01萬公頃。
植物資源。雲南是全國植物種類最多的省份，被譽為“植物王國”。熱帶、亞熱帶、溫帶、寒溫帶等植物類型都有分佈，古老的、衍生的、外來的植物種類和類群很多。在全國近3萬種高等植物中，雲南佔60%以上，分別列入國家一、二、三級重點保護和發展的樹種有150餘種。《雲南省生物物種名錄（2016版）》共收錄雲南省的物種2.54萬個。2018年，雲南森林面積為2311.86萬公頃，森林覆蓋率為60.3%，森林蓄積量19.70億立方米。全省共有自然保護區161個，其中，國家級21個、省級38個、州市級55個、區縣級47個，總面積約286萬公頃，佔全省國土總面積的7.3%。雲南樹種繁多，類型多樣，優良、速生、珍貴樹種多，藥用植物、香料植物、觀賞植物等品種在全省範圍內均有分佈，故云南還有“藥物寶庫”“香料之鄉”“天然花園”之稱。
動物資源。雲南動物種類數為全國之冠，素有“動物王國”之稱。脊椎動物達1737種，佔全國58.9%。其中，鳥類793種，佔63.7%；獸類300種，佔51.1%；魚類366種，佔45.7%；爬行類143種，佔37.6%；兩棲類102種，佔46.4%；全國見於名錄的2.5萬種昆蟲類中雲南有1萬餘種。雲南珍稀保護動物較多，許多動物在國內僅分佈在雲南。珍禽異獸，如：蜂猴、滇金絲猴、野 象、野牛、長臂猿、印支虎、犀鳥、白尾梢虹雉等46種均屬國家一類保護動物；熊猴、獼猴、灰葉猴、穿山甲、麝、小熊貓、綠孔雀、蟒蛇等154種均屬於國家二類保護動物；此外還有大量小型珍稀動物種類。
礦產資源。雲南地質現象種類繁多，成礦條件優越，礦產資源極為豐富，尤以有色金屬及磷礦著稱，被譽為“有色金屬王國”，是得天獨厚的礦產資源寶地。雲南礦產資源的特點，一是礦種全，現已發現的礦產有143種，已探明儲量的有86種；二是分佈廣，金屬礦遍及108個縣（市），煤礦在116個縣（市）發現，其他非金屬礦產各縣都有；三是共生、伴生礦多，利用價值高，全省共生、伴生礦床約佔礦床總量的31%。雲南有61個礦種的保有儲量居全國前10位，其中，鉛、鋅、錫、 磷、銅、銀等25種礦產含量分別居全國前3位。
能源資源。雲南能源資源得天獨厚，尤以水能、煤炭資源儲量較大，開發條件優越；地熱能、太陽能、風能、生物能有較好的開發前景。雲南河流眾多，全省水資源總量2206億立方米，居全國第3位；水能資源蘊藏量達1.04億千瓦，居全國第3位，水能資源主要集中於滇西北的金沙江、瀾滄江、怒江三大水系；可開發裝機容量0.9億千瓦，居全國第2位。煤炭資源主要分佈在滇東北，全省現已探明儲量240億噸，居全國第9位，煤種也較齊全，煙煤、無煙煤、褐煤都有。地熱資源以滇西騰衝地區的分佈最為集中，全省有出露地面的天然溫熱泉約700處，居全國之冠，年出水量3.6億立方米，水溫最低的為25°C，高的在100°C以上（騰衝縣的溫熱泉，水溫多在60°C以上，高者達105°C）。太陽能資源較豐富，僅次於西藏、青海、內蒙等省區，全省年日照時數在1000～2800小時之間，年太陽總輻射量每平方釐米在90～150千卡之間。省內多數地區的日照時數為2100～2300小時，年太陽總輻射量每平方釐米為120～130千卡。
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