太平洋战争爆发后，日澳关系彻底进入敌对状态。澳大利亚政府对日宣战，日本也把澳大利亚划入“大东亚共荣圈”之中。 战争时期的敌对关系延续到了战后初期，澳政府积极参加东京审判，主张对日严厉制裁。
日本计划的大东亚共荣圈
二战期间，澳大利亚这个700万人口的国家，共有100万人参军，其中56万人派往海外作战，37000人阵亡，共有30000人被俘，其中22000人被日军俘虏，只有14000人在1945年活着回到澳大利亚。相当一部分战俘被日军虐待致死，被俘的女护士也遭受了野蛮的待遇，大家都能想象到。
日本对战俘的不人道待遇使得澳大利亚国民一直不能忘记这段历史。
死亡行军
战后澳大利亚对日本的强硬外交
日本投降后，澳大利亚认为必须从严解决日本问题，绝不能从宽，因此必须坚持这样的方针：审判日本战犯，予以严惩。审判战犯裕仁天皇，以确保东亚、东南亚和太平洋未来的安全。
澳军士兵
在澳大利亚看来，日本是一个侵略成性，不肯悔改的国家，澳国内的各政党以及人民对日本都充满了不信任感，为防止战后日本恢复经济后对其他国家进行侵略，对其进行非军事化是必要的。
而且对以麦克阿瑟为首的盟军一年多来对日本的军事占领及管制的效果非常不满，认为盟军的管制太过软弱，并且担心这种占领可能是短期的。
日本在战后急需资源和农牧产品，澳大利亚根据帝国特惠制把商品出口英国而拒绝出口日本。日本为了消除澳大利亚对其疑虑积极调解印巴分歧，在马来西亚和印尼的冲突中也起到了一定积极作用，通过一定的赔偿计划来介入东南亚地区，从而改善日澳之间的关系，增加澳大利亚对其信任。
二战后澳大利亚对日政策经历了从“硬和平”到“软和平”的转变
日本在美国的支持下积极修复与澳大利亚的关系，因为双边互补性的经贸关系使得日本逐渐重视与澳大利亚关系的发展。
但是，澳大利亚因为战时所受伤害对日本充满了不信任，寄希望于美国为首的盟军可以对日本进行非军事化改革，使其彻底失去侵略他国的可能，主张对日严厉制裁，使其对战争期间所犯的罪行付出代价，战争刚结束美国主张对日本进行民主化改革，但是随着冷战时代的到来，美国出于全球战略考虑开始微调对日政策，这引起了澳大利亚的不满。众所周知，澳大利亚坚持对日强硬政策是出于自身安全考虑，如果与美国结盟能确保自身安全，可以适当改变对日政策。最终1951年澳大利亚、新西兰、美国三国签订《澳新美条约》，组成了军事战略利益一致的军事同盟，通过努力澳大利亚终于获得了美国保障其安全的一纸凭证。这一条约是澳大利亚努力寻求建立地区安全机制的结果，实际上该条约只是使澳大利亚对美国的依附加剧，而澳大利亚并未从中获得其所需要的安全保障。
旧金山和约
因此在签订了《澳新美安全条约》一周后，1951年5月8日，澳大利亚与日本签订了和约。
总之，战后初期，澳大利亚政府要求严厉制裁日本，主张对战犯的审判，甚至天皇也不能逃脱，并且要求美国对日本进行彻底的非军事化改革，澳政府还对日本进行经济歧视。澳大利亚政府主要出于自身安全考虑，害怕日本的军国主义死灰复燃，对其带来更多伤害。但是因为二战的影响使美国在澳大利亚和日本战后外交政策制定中占据着决定性位置，美国为使澳大利亚和日本服务于其全球霸权战略，改变对日政策，并迫使澳大利亚接受对日《旧金山和约》。
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