RT-LAMP法又立功!30分鐘快速檢測新冠病毒 特異性達99%

RT-LAMP法又立功!30分鐘快速檢測新冠病毒 特異性達99%

在目前的防疫措施中,快速檢測病毒是一項重要環節,為了找到在儘可能短時間內檢測出新冠病毒COVID-19的方法,科學家們已經發布了數篇研究。

其中,實時熒光PCR (RT-PCR)法是檢測COVID-19病毒核酸的一種臨床標準。RT -PCR即逆轉錄-聚合酶鏈反應,其原理是,提取組織或細胞中的總RNA,以其中的mRNA作為模板,採用Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA,再以cDNA為模板進行PCR擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。

近日,發佈在medrxiv上的一篇論文中表示,科學家們開發了一種更快速、更方便的檢測病毒核酸的方法——RT-LAMP法(逆轉錄環介導等溫擴增法)。在63℃等溫條件下,一步進行RNA逆轉錄和核酸擴增,30分鐘即可得到結果,同時檢測ORF1ab基因、E基因和N基因。

RT-LAMP法又立功!30分钟快速检测新冠病毒 特异性达99%

(論文截圖)

論文中寫道,由於ORF1ab基因具有很強的特異性,N基因具有很強的敏感性,這種方法可以保證病毒檢測的敏感性和特異性。

RT-LAMP法又立功!30分钟快速检测新冠病毒 特异性达99%

(用RT-LAMP法檢測COVID-19病毒,圖源論文)

RT-LAMP法檢測208份臨床標本的靈敏度與RT-PCR法相近,特異性為99%。該論文所提到的RT-LAMP法具有擴增快、操作簡便、檢測簡便等優點,有助於COVID-19的快速、可靠的臨床診斷。此外,檢測結果可以通過肉眼可見的顏色變化來直接判斷,不需要專用儀器。

這篇論文由Weihua Yang, Xiaofei Dang,Qingxi Wang等人發佈,涉及機構包括濟南市醫學微生物學重點實驗室、山東第一醫科大學附屬濟南市中心醫院臨床試驗室、山東省第二腫瘤靶分子重點實驗室、山東大學附屬濟南市中心醫院等。

並不“新鮮”的RT-LAMP法

其實,RT-LAMP法並不是這篇論文所獨有。RT-LAMP是一種將環介導等溫擴增(LAMP)以及反轉錄相結合,直接檢測出RNA的技術,當它與反應混合物中的pH指示劑耦合時,人們可以通過顏色的變化知道檢測結果。

此前,2月25日,由瀋陽化工大學應用生物學研究所所長尹秀山博士團隊和美國密歇根皇家橡樹博蒙特Michael B Chancellor團隊分別發佈在medRxiv上的兩篇論文也使用該技術快速檢測病毒。這兩種方法不僅操作簡單、能在現場使用,並且可以在45分鐘內出檢測結果。

能夠使用該方法檢測的病毒有很多,包括鴨I型肝炎病毒、A組輪狀病毒、番茄斑萎病毒、腦脊液結核分歧桿菌、人季節性流感病毒等。

環介導等溫擴增(LAMP)技術的特點是針對靶基因的特定領域設計特異性引物,利用鏈置換DNA聚合酶在恆溫條件下保溫幾十分鐘,即可實現核酸的擴增。LAMP法不需要模板的熱變性、長時間溫度循環、繁瑣的電泳、紫外觀察等過程,在食品微生物檢測及臨床醫學上傳染性疾病、轉基因食品和胚胎性別堅定等特性的診斷上都具有獨特的應用價值。

參考文獻:

http://www.biodiscover.com/news/research/736081.html

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.02.20030130v2.full.pdf


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