在清朝共設有駐防將軍十四人，分別駐守盛京、吉林、黑龍江、綏遠城、江寧、福州、杭州、荊州、西安、寧夏、伊犁、成都、廣州、烏里雅蘇臺，分別冠以所在地名如盛京將軍、吉林將軍等。將軍的品級為從一品，也有正一品（如:伊犁將軍），將軍為旗兵最高長官，凡與總督同駐一省者，如會同奏事，以將軍領銜。
總督是清朝時對統轄一省或數省行政、經濟及軍事的長官，尊稱為“督憲”、“制臺”、“制軍”等，官階為正二品，但可通過兼兵部尚書銜高配至從一品。與只掌握一省行政事務的巡撫不同，總督兼管數省，同時在政務之外也兼掌軍務與經濟。有直隸總督、兩江總督、四川總督、閩浙總督、雲貴總督、湖廣總督、兩廣總督、東三省總督和陝甘總督。此外明清也有河道總督、漕運總督等專管某項政務的總督官職。
從品級上看駐防將軍比總督大，但人們總以為駐防將軍實權不如總督，其實不是這樣的。總督雖是兼管數省政務軍事的二品大員，但總督一般都是有漢人來擔任；而駐防將軍一般都是由滿人（八旗貴胄）來擔任，身份十分尊貴。
滿清為什麼有總督兼管各地政務和軍事還要增設駐防將軍呢？清朝以滿人治天下，雖能重要漢人，但也要提防漢人，增設駐防將軍的原因就是為了監管各方督撫；明裡總督不對駐防將軍負責，皇帝會給予總督很大的權力，但總督有的權利駐防將軍同樣有，而駐防將軍的權力總督不一定有。上朝向皇帝彙報情況都是有駐防將軍領頭的，可見駐防將軍在皇帝眼裡的重要，皇帝對駐防將軍的信任程度不是總督所能比的。
所以駐防將軍無論從權勢、地位都是高於總督的，如果在不是和平的時候，駐防將軍的權力、地位會顯得更突出。很多人以為駐防將軍只能管軍事不能插手地方政務，其實不是這樣的。在和平時期，駐防將軍主要的職責就是監視所在地方的督撫，總督怎麼管理所轄地區的事務，那是總督自己的職責所在，如果沒有什麼緊要的事情駐防將軍是不會過問的，如果有很大的事情要發生，那麼總督都要聽命於駐防將軍的。
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