定質
消毒工作要達到預期的效果，必須按照適宜的程序進行。消毒前必須要徹底清洗，並做到：撣塵、清除蜘蛛網，清除舍內各種雜物，如廢飼料袋、舊掃把等，欄舍內外的糞便、尿液等有機物及所有用具必須徹底清除，以減少各種有機物。
空舍內欄舍：如高床保育舍、高床產子欄等欄位、料槽、柵欄漏縫地板等一定要及時徹底清洗，所有能移動的設備和用具包括電風扇葉片、鐵鏟等，清洗後必須浸泡在福爾馬林中消毒，地面、牆角等不允許殘留豬糞，清洗空舍時需要用豬場專用的去垢劑處理，整個豬場的走廊和環境中不得見豬糞。
定時
全場各部門要根據規定及時做好消毒工作。產房每天消毒1次，保育舍每兩天消毒1次，中大豬舍每週消毒2次，全場每15天大消毒1次，豬場售豬處每天消毒，外來購豬車輛先消毒後裝豬，進入生產區的車輛必須消毒後方可進入。
消毒劑的選擇
所有豬舍必須要用高效廣譜的消毒劑消毒：舍外及豬舍，先後用燒鹼溶液（3%~5%）和福爾馬林（10%）消毒，舍內再用廣譜低毒的消毒劑消毒欄舍。消毒工作必須有技術員的指導和監督。舍內需用敵百蟲或殺滅菊酯對環境殺蟲；豬場所設各種消毒池 （包括大門口、生產區大門、各豬舍門口前）應有專人負責，定期更換消毒液，保持藥量。主要通道和走廊清洗後用福爾馬林或燒鹼溶液進行噴灑消毒。
工作服及時清洗並要求在陽光下暴曬，或晾乾後掛在紫外線室中進行消毒處理。及時做好滅蠅、滅鼠、滅蚊工作，特別是滅鼠後應及時清除死鼠、掩埋於合適地點。產房中的墊料 （布、板）需及時更換或清洗、消毒和乾燥。
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