故事的緣起是這樣的。
神示預言說阿耳戈斯國王阿克里西俄斯（Acrisius）的女兒達娜厄（Danaë）日後所生的兒子也就是自己的外孫將把他殺死，因此他將女兒囚禁在王宮下的一個地窖裡（一說鎖在一個銅塔裡），不準與任何人往來。但是
宙斯卻化為一陣金雨從天窗中衝進室內，與達娜厄配合，一番雲雨之後過了一段時間，珀耳修斯出生了。珀耳修斯（Περσεύς，Perseus，也譯作珀爾修斯或佩耳修斯）這一名字就是『金光閃耀』的意思。
英國畫家愛德華·伯恩·瓊斯的名畫《達娜厄與青銅塔》，達娜厄憂慮地看著工匠給塔安裝青銅外殼
埃貢·席勒的《達娜厄》
阿克里西俄斯得知女兒生子，就把女兒和新生的外孫裝入木箱，投入大海任其漂流自生自滅。
這時，親爸爸宙斯出馬了，他囑託海王波塞冬幫助母子二人以免他們倆喪生在波濤洶湧的大海之上，最後，達娜厄和珀耳修斯漂流到母子二人基克拉迪群島中的一個島塞裡福斯島（Seriphos）上，在那裡他們被漁人（另外的說法是船匠或牧人）狄克堤斯（Dictys）收留收養，狄克堤斯是國王波呂得克忒斯（Polydectes）的兄弟，後來波呂得克忒斯覬覦達娜厄的美貌，試圖向達娜厄獻殷勤，但達娜厄受到狄克堤斯和快速長大的兒子珀耳修斯的保護，波呂得克忒斯的色心不能得逞。
塞裡福斯島海岸景色
狡詐的波呂得克忒斯心生一計，試圖藉此擺脫珀耳修斯，他下令珀耳修斯為他獲取美杜莎(Medusa)的頭。
美杜薩一譯“墨杜薩 ”，希臘神話中的怪物。她是戈耳工三女妖中最危險的一個，頭髮全部都是毒蛇，任何人看她一眼都會立即變成石頭。據傳說美杜薩是海神福爾基斯與克託之女，地神蓋婭與海神彭託斯的孫女，原為一個豔麗無比、風姿綽約的美女，還是海神波塞冬的情人，因為冒犯女神雅典娜，被雅典娜懲罰將其面貌變得奇醜無比，滿頭金髮全部變成麇集的毒蛇誰看她的面容一眼或者被她的目光直視，就都會立刻變成石頭。
波呂得克忒斯之意，無非是用這個不可能完成的人物，除去他的眼中釘拖油瓶珀耳修斯。
但是珀耳修斯毫不畏懼，說出發就出發了。
珀耳修斯得到了智慧女神雅典娜和眾神的使者赫耳墨斯的幫助——說起來，他們其實是珀耳修斯的姐姐和哥哥。
珀耳修斯先找到了被合起來稱為格賴埃的三個白髮女妖，這三個白髮女妖是三姐妹（一說她們也是美杜薩的姐妹），共用一隻眼睛和一個牙齒，珀耳修斯施展巧計騙取了（一說偷取了）她們的眼睛和牙齒，迫使她們說出了一位擁有登雲鞋、隱身盔和神囊的女仙的下落，從女仙處獲取了三件寶物——另外的傳說是說這三件寶物就在格賴埃三姐妹手中，珀耳修斯先是搞到了她們的眼睛和牙齒，然後把三件寶物換到了手中。
得到登雲鞋、隱身盔和神囊三件寶物的珀耳修斯本已如虎添翼，再加上赫耳墨斯贈給了他一把鑽石彎刀，雅典娜贈給了他一面寶鏡（一說是一個光亮無比的盾牌），珀耳修斯能夠輕鬆地去完成斬首美杜薩的這個貌似不可能完成的任務。
美杜薩住在大洋河邊上的塔耳忒索斯附近，凡人本來無法靠近，但是珀耳修斯憑藉登雲鞋輕鬆飛到了美杜薩的住所，憑藉著隱身盔，美杜薩也根本無法察覺他的到來。
為了防止直視美杜薩而變成石頭，珀耳修斯藉助雅典娜贈與的寶鏡窺伺美杜薩，然而用赫耳墨斯贈給他的那把鑽石彎刀一擊而中，砍下了美杜薩的頭顱，並裝進了神囊。
正在珀耳修斯大功告成準備打道回府之際，美杜薩的兩外兩個姐妹歐律埃、斯忒諾殺來了——除了美杜薩，這兩個女妖是永生不死的，珀耳修斯便沒有和她們直接對抗，穿上登雲鞋，戴上隱身盔，小爺走了……
電影《諸神之戰》中珀耳修斯
切利尼創作於1545年，位於意大利佛羅倫薩蘭齊迴廊的青銅雕塑《珀耳修斯和美杜薩》
在經過北非利比亞上空的時候，美杜薩的頭顱流出的血滴滴答答地滴在了沙漠上，變成了各種顏色地毒蛇。
珀耳修斯首先來到了揹負蒼穹的提坦巨神阿特拉斯（Άτλας、Atlas）的王國，想在他的三個女兒和巨龍守護的金蘋果花園留宿一夜，阿特拉斯不許，珀耳修斯大怒，就把美杜薩的頭顱拿了出來，阿特拉斯一看到這個頭顱，立刻化作了一座大山——這就是直到現在還矗立在非洲西北部的阿特拉斯山（Atlas Mountains，阿特拉斯山作為非洲西北部山脈，是非洲最廣大的褶皺斷裂山地區，它也是阿爾卑斯山系的一部分。阿特拉斯山橫跨摩洛哥、阿爾及利亞、突尼斯三國也包括直布羅陀半島，把地中海西南岸與撒哈拉沙漠分了開來）。
珀耳修斯繼續飛行，在埃塞俄比亞（Ethiopia）海岸發現一個美麗的少女被鎖在海邊的懸崖峭壁上，這個美麗少女名叫安德羅墨達（Andromeda），她是埃塞俄比亞國王刻甫斯（Cepheus）與王后卡西奧佩婭（Cassiopeia）之女，因為其母卡西奧佩婭不斷炫耀女兒的美麗而得罪了海神波塞冬之妻安菲特里忒，安菲特里忒要波塞冬替她報仇，波塞冬遂派海怪刻託（Ceto）蹂躪埃塞俄比亞，使得生靈塗炭，身為國王的刻甫斯大駭之餘，請求神諭，神諭指示要解此劫難唯一的方法就是用安德羅墨達向海怪刻託獻祭。
安德羅墨達就是星座中的仙女座
珀耳修斯就是星座中的英仙座
珀耳修斯殺死了海怪，救下了安德羅墨達，並同她結了婚——安德羅墨達與珀耳修斯誕下七子二女：七子分別是珀耳塞斯（Perses）、阿爾凱奧斯（Alcaeus）、埃勒克特律翁（Electryon）等七人，其中珀耳塞斯是波斯的建國者；二女中有一位就是後來的斯巴達王廷達柔斯（Tyndareus）之母戈耳戈福涅（Gorgophone），這是後話，暫且按下不表。
回到塞裡福斯島之後，珀耳修斯發現自己的母親迫於波呂得克忒斯的逼婚只能躲在了神廟之中避難，與此同時，波呂得克忒斯根本不相信珀耳修斯成功完成了任務，因此珀耳修斯只好『被逼無奈』給他看自己成功的證據——美杜莎的頭，結果波呂得克忒斯立刻就變成了一塊石頭，當初收養珀耳修斯的狄克堤斯成了塞裡福斯島的國王。
完成了這些事之後，珀耳修斯把三件寶物換給了女仙，把美杜薩的頭獻給了雅典娜——雅典娜把它鑲嵌在自己的盾牌上（一說是胸甲上），從此女戰神更加讓敵人膽寒。
珀耳修斯很想去看望外祖父阿克里西俄斯，便同母親、妻子一起回到了阿耳戈斯。阿克里西俄斯仍然記得當初的神諭，變特意避開前往了拉里薩。
擲鐵餅者雕塑局部
珀耳修斯也來到了拉里薩，當地正在舉行競技運動會，珀耳修斯一時技癢，下場玩了一把鐵餅，鐵餅擲出後無意間將一位老人打死，這個老人恰巧是他的外祖父阿克里西俄斯。
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