馮玉祥對基督教感興趣，是在1918到1919年駐軍常德的時候。馮玉祥對於自己手裡的部隊，上心得很。有錢，就買槍，招兵，一個一個地挑。
別人的一個旅，不過兩個團，兩三千人，混成旅，也不過多加一個機炮營，他的第十六混成旅，四個步兵團，還加一個炮兵團，每個團都超編，差一點就一萬人了，比人家一個師的人數還多。所以，在徐樹錚做陸軍部次長的時候，就因為超編問題，跟馮玉祥有過沖突，接任陸軍次長的傅良佐，還因此免了馮玉祥的職。
只是，馮的部隊，誰也領導不了，到了張勳復辟之時，段祺瑞用得著馮玉祥了，又給他官復原職，超編的事兒，也沒有人追究了。這麼大的一支部隊，惦記的人多。不僅看不順眼的人惦記，連一直提拔他，但已經下野的陸建章，也惦記。被人惦記多了，自己就不大放心了，總擔心部隊散攤子。在常德期間，他的內弟患精神病，聽說當地一個英國牧師能看病，就請他去診治，結果被內弟發瘋打死，牧師的夫人沒有要馮玉祥一點賠償。
這事兒，讓他覺得基督教很不錯，是個可以拿來用的好東西。外面傳說，他曾經用水龍頭給他的士兵洗禮，其實這是沒有的事兒。但他的確把牧師引進了部隊，一個營就有一個。每個星期天，部隊都要做彌撒，請牧師講道。每次飯前，都要做禱告。儘管並非所有官兵都領洗了，但那段時間，部隊裡信徒還是挺多的，不信的，因為馮玉祥的緣故，也跟著走。開口上帝，閉口救世主的。
那時期，他覺得已經給部隊找到了精神支柱，因此，他的部隊被稱為基督軍。引入基督教之後，對整個部隊的軍風紀大有好處，而且，也在牧師的帶領下，開始講究公共和個人衛生。別的部隊，駐紮在哪兒，哪兒就一片狼藉，但馮玉祥的部隊，一定會挖臨時廁所，不亂丟垃圾。官兵也要定期洗澡，洗衣服，所以，外出顯得十分整潔。間接地，也把大兵出身的馮玉祥，變成了潔癖，他每到一地，一定要挖一個自己專屬的廁所，派衛兵看守，不許別人用。
1924年發動北京政變之後，臨時政府總理黃郛來張家口找他，內急之下，想用他的專屬廁所，衛兵都不幹。基督軍的名聲，在外國人和城市精英居民中，是有魅力的，為馮玉祥徵得了在華基督教會和基督教青年會的支持，在很多關鍵時刻，教會的幫助，對馮玉祥度過難關，是大有好處的。在北洋時期，給部隊找精神支柱的，還有其他軍頭。比如唐生智就引入了喇嘛教，給全軍受戒。
但他的手下，只有一個喇嘛教的居士，並沒有引來眾多喇嘛在軍營裡做佛事。比較起來，基督教的凝聚力，就要比喇嘛教大得多。而馮玉祥鬧出的動靜，也比唐生智大些。不過，基督教對於馮玉祥來說，不過是拿來用的工具。
到了國民革命開始，他日益激進，就開始把基督教放下了。在北伐期間，馮玉祥的部隊，已經是清一色的無神論天下了。
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