張居正是一個悲劇人物，他為大明王朝改革事業奉獻一生，成效顯著，貢獻突出，但是死後很快遭遇清算，改革政策也被廢止，親信官員被罷黜，一生心血付諸東流。
更為讓人難以接受的是，張居正身為宰輔，能力卓越，卻多次和自己的門生開戰，導致師生失和，或死或傷，用他自己的話來說，他是大明立國兩百多年來第一位被學生彈劾的首輔，心痛之情，可見一斑。
張居正為大明奮鬥終生
關於張居正和學生之間的的開戰，史書上明確記載的就有三次之多，作為一個成就如此之高的歷史人物，可謂罕見。
一是張居正父親去世後，為了大明的改革事業能夠持續推進，萬曆皇帝下詔張居正奪情繼續主持政務的時候，他的門生吳中行和趙用賢走在了反對張居正的最前線，堅決要求張居正辭職回家丁憂，張居正後院失火，勃然大怒，對兩個學生施以廷杖，吳中行當場幾乎被打死，被人用布拖出長安門，趙用賢則被打得腿肉潰爛，“肉潰落如掌”。
這件事極大地損害了張居正的威望。
張居正後來回鄉葬父，身坐三十二人大轎，也被詬病
後來，遼東大捷，張居正的門生，巡按遼東的御史劉臺違規上報這次捷報，張居正秉公辦理，請旨斥責了劉臺。沒想到劉臺竟然不顧師生情誼，直接上疏彈劾恩師張居正，歷數其多條違反祖制的大罪，當中無論任何一條罪狀坐實，張居正都難逃一死。
這件事讓張居正長時間伏地哭泣不起，堅決辭官，後在萬曆的力挺下，把劉臺革職流放，算是給老師張居正出了氣，但張居正經此一役，也是身心受到重創，痛苦不已。
張居正身心受創，萬曆幫他出頭
最後一次更加匪夷所思，也是對張居正打擊傷害最大的一次，因為這次對他下手的，是他撫育教導了十餘年的學生萬曆。張居正死後不久，他的學生萬曆對其開展了瘋狂的清算，不僅將他所有官銜剝奪，還要對他開棺鞭屍，把他家產抄沒，家人流放，一代名臣，竟落得如此下場。
萬曆皇帝對張居正下手夠狠
後人分析張居正的學生為何屢次對張居正下手，多從張居正本人查找原因，認為是他工與謀國，拙於謀身，所以沒和學生搞好關係等等。但現在很多人也開始為張居正鳴不平，認為造成這樣的原因其實很簡單，就是張居正培養了一批白眼狼，平日無論張居正對他們如何百般培養和照顧，一旦私心作祟，個個棄師生情誼於不顧，千方百計攻擊張居正，以此博名，還大言不慚說是為了公義而棄私情。
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