誘嫵魅的瞬息
首先亞瑟王本事就是傳說的虛構的存在，其原型包括了數位英雄的事蹟，包括英國的勝利女王布迪卡。但一般會把亞瑟王視作男性。fate中本身因為有平行世界的設定，所以也有男性亞瑟的設定。
所以可以說fate中任何角色都可能有男，女的角色設定。現在fate系列中出現的與我們常識中相反性別的人物有:
亞瑟王 ， 莫德雷德，梅林（男版亞瑟世界線，只在對話文本中提到），沖田總司/黑總司，織田信長，宮本武藏（說明是異世界流浪過來的，原所屬世界線可能已毀滅），尼祿，阿提拉（設定為遊星尖兵，被初代聖劍使擊潰後誕生），加藤段藏（人形機械），牛若丸（就是源義經），源賴光，酒吞童子，茨木童子（本身就是傳說中的鬼），荊軻，唐玄三藏（唐僧在日本形象中經常是女性，想想觀音進入中國被強行變女性），哪吒（初始是男，製作蓮花化身時弄錯了，以男性身份召喚大概率會是berserker），黎利（越南的國王，和亞瑟王一樣有還劍於湖的傳說，有一份官方短篇搞笑動畫），達芬奇（原本性別男，英靈的身體是他自己製作的，形象是蒙娜麗莎），德雷克（海盜船長）
性別不明的有迪昂，恩奇都
確定是男但形象是可愛的男孩子一阿福
神話中就變過性別的 凱涅斯（還未實裝，只有預告形象）
Misaka11235
《FATE》動畫系列來說的話（遊戲除外）——
第一個肯定要說的就是Saber了，Saber在劇中是一位金髮碧眼的少女，原名是“阿爾託利亞·潘德拉貢”。而其原型正是由傳說中大名鼎鼎的亞瑟王“亞瑟·潘德拉貢”（拉丁語：阿爾託利斯），是個男人。
然後不得不提的就是這位似乎連CAST名單都忘記的角色“貝狄威爾”（或“貝德維爾”等等），傳說中亞瑟王的圓桌騎士之一，也是王的近衛騎士。圓桌騎士最早的成員之一，兼任宮廷的執事和王的負責人。也是見證了亞瑟王的最後一刻，為王送終的人物。最著名的傳說便是將聖劍歸還於湖之仙女手中。當然，傳說中也是個男人。
《Fate/EXTRA Last Encore》主角尼祿·克勞狄烏斯 已經不僅僅是傳說，而是歷史上真實存在的羅馬帝國第五代皇帝“尼祿·克勞狄烏斯·愷撒·奧古斯都·日耳曼尼庫斯”， 是古羅馬乃至歐洲歷史上著名的暴君 。在位時期，行事殘暴，殺死了自己的母親及幾任妻子，處死了諸多元老院議員；同時，亦奢侈荒淫，沉湎於藝術、建築等事。世人稱之為“嗜血的尼祿”。歷史上100%的男人。
筆者暫時就想到這三位，如果有遺漏還望見諒。
windchaos
這個問題的出現主要還是二次元的宅屬性，為了迎合廣大宅男的需求。對於借鑑或改編的神話、歷史人物都刻意的進行了女性化的塑造。這樣廣大用戶才會買單，各種老婆也是層出不窮。廣大友人不亦樂乎的瘋舔，製作方賺錢賺到手軟。一舉兩得，何樂而不為。
至於題主提出的歷史上是女性在FATE世界中為男性的確實沒有。（女人，老婆才是主流）不過FATE世界中確實存在另外一種萌屬性就是性別不明，無性別等的英靈。也是深受廣大友人的喜愛和追捧。你可當做男亦可當做女，完全由你自己來選擇，開放性角色。
以下我就列舉幾個，大家來了解一下。
1.迪昂·德·鮑蒙（騎士迪昂）出自遊戲《FGO》
根據查閱的資料顯示，歷史上的迪昂確實存在而且應該是個男性，母親喜歡將自己的正太兒子打扮成LOLI，於是先天就生得面白身矮的迪昂直到8歲為止都過著女裝的生活，法國曆史上的騎士被人傳言為既是女性又是男性的十八、九世紀法國的傳說人物。 文武雙全的劍士與文學家。 作為間諜活躍於與各列強為敵的機密局，還曾擔任過全權公使、龍騎兵連隊長等職務。
遊戲中的介紹跟歷史上一致，只是性別上是？，立繪與語音上都是偏向女性。又稱偽娘和百合騎士。反正遊戲中我就是把他當做女性對待了。哈哈。。。。
2.阿斯托爾福（阿福）出自遊戲《FGO》、番劇《FA》出典：查理曼大帝傳說
阿斯托爾福是法蘭西的代表性騎士道物語——查理曼大帝傳說的登場人物。 查理曼十二勇士其中之一，英格蘭的王子。 需要補充的是，他是一個理性蒸發的廢柴英靈。又是一個法國騎士，em.........女裝大佬。阿福的知名度還是很高的，其中映射的梗也是很多也深受廣大友人的喜愛。黑虎阿福、烏鴉坐飛機。。。。
3.恩奇都（小恩）出自《FGO》古代美索不達米亞神話
金閃閃唯一認可的對手和摯友
吉爾伽美什史詩講述的，最古老的英雄之一。由眾神創造的兵器。原是眾神製造出的“可任意變形的粘土工藝品”。為應付狀況變化，可自在進行形態變化。等同於眾神們的武器。但是，沒有與人類相似的精神和感情，最初是大體與野獸一致之物。據說顯現於地上之後，與某位聖娼邂逅，獲得了對許多事物的認知後，選擇變化為人類的形態。這姿態是因對某個聖娼的敬重，加以模仿而來。
具有和英雄王吉爾伽美什鼎盛期大致同等的力量。敘事詩中，與吉爾伽美什平分秋色孤高的吉爾伽美什王首次認可的友人，自身也將吉爾伽美什當作獨一無二的摯友。烏魯克城之戰後，成為朋友的恩奇都與吉爾伽美什，進行了數不勝數的冒險，但最終在與神獸天之公牛戰鬥過後殞命。
性別無，因為本身可以任意變換形態。厲害了不是秀吉。因為本人廚小恩其次也是因為閃閃CP的緣故。所有對於小恩我也是以女性對待。
好了以上就是本人所知道的，大家有什麼想說的可以在下方評論。
凌軒ACG
首先就是我們大家最熟悉的呆毛王阿爾託莉雅了，最早出自遊戲，動畫《fate stay night》和小說，動畫《fate zero》，原型為男性
接著是呆毛王的兒子小莫，莫德雷德，出自小說，動畫《fate apocrypha》原型也是男性
我們的暴君尼祿，最早是出自遊戲，動畫《fate extra》也是男的
沖田總司小姐姐，出自漫畫《帝都聖盃奇譚》男的
第六天魔王織田信長，同樣是出自漫畫《帝都聖盃奇譚》也是男的
德雷克船長，出自遊戲，動畫《fate exter》不用說，男的
小柯2
歷史上是女性遊戲裡是男性的角色好像真沒有？歷史上是男性遊戲中是女性的倒是很多，比如亞瑟王阿爾託莉雅，尼祿，宮本武藏，沖田總司，荊軻，阿蒂拉，莫德雷德等等......
