作为中国华人华侨的重要组成部分，境外众多的维吾尔人的形成有着独特的历程。新疆地处中国大西北的边疆地区， 周边与 8 个国家毗邻， 历史、文化与贸易联系密切， 交通孔道众多， 现代交通则更为便利， 这些都是维吾尔族华人华侨形成的重要因素。虽然维吾尔族华人华侨的形成经历了漫长历史过程， 不过现代意义上维吾尔族华人华侨则基本上是清代以来形成的。
首先是中亚五斯坦的维吾尔华人华侨，中亚地区大批维吾尔人在中亚的出现， 是由于西方列强强加给中国的一系列不平等条约所致。清代西方殖民者主导的和卓家族叛乱、张格尔叛乱、倭里罕之乱等影响严重， 虽然这些和卓叛乱最后均以失败告终，但是每次都裹挟不少维吾尔人出境。例如1847 年的七和卓之乱，受和卓胁迫前往中亚浩罕的就有三万七千余人，1857 年倭里罕之乱， 又有一万五千余人被裹胁逃往中亚。据研究者估算， 从 18 世纪 50 年代后期至 19 世纪 50 年代后期的百年间， 从新疆喀什地区迁徙到浩罕的维吾尔人就达到 8. 5 万之众。
其次，1877—1878 年阿古柏及白彦虎残部从南疆又裹挟数万维吾尔人到中亚地区。
1881 年 《中俄伊犁条约》签订至 1884 年。《中俄伊犁条约》的签订导致中俄边界重新划分， 俄国以 “人随地归”为借口强行将伊犁大批维吾尔人迁往中亚地区。阿古柏入侵新疆时期， 俄国于 1871 年趁机出兵占领伊犁。中国驱逐阿古柏后， 迫于形势和国际压力， 俄国承诺归还伊犁。但是， 早在俄国占领伊犁时期， 就决定要迁徙中国伊犁的塔兰奇人到俄国境内。中俄伊犁谈判结束前后， 俄国借口 “人随地归” 的原则，通过其掠夺性政策， 先后将伊犁大批维吾尔人迁移到俄国境内。据学者分析和对比俄国有关资料与研究， 此期从伊犁迁往俄国维吾尔人口较客观的数字约为 9572 户、45373 人。可见， 此期迁徙到俄国的维吾尔人数量相当大。
俄国之所以煞费苦心大量争夺中国伊犁人口， 其原因主要有下列几个方面。一是考虑到当时俄属中亚哈萨克地区人口稀少， 哈萨克人又不善耕种， 希望利用伊犁善于耕种的 “塔兰奇人”开垦其毗邻中国伊犁的七河地区; 二是出于报复中国收回伊犁的需要， 企图使中国伊犁近边地区成为无人区; 三是遵照 1864 年 《中俄勘分西北界约记》 第五条所规定的“人随地归”等规定， 在 《中俄伊犁条约》签订前后迫使众多维吾尔人迁居俄国。
1961 年经中国政府允许，大约 600 名自称拥有阿富汗国籍的维吾尔人离开中国来到阿富汗， 但是实际上他们并非都获得阿富汗公民身份。这批人在阿富汗滞留五六年，寻找会接受的国家。1966 年至 1967 年， 在联合国难民署的协助下， 大约 360 名维吾尔人乘坐联合国飞机前往土耳其。他们大多数定居在土耳其开塞利市， 这里后来发展成为维吾尔族华人华侨在土耳其的主要社区。
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