雜交屬於同種間的基因交換，不同種間由於存在生殖隔離，不可產生下一代。是兩條DNA單鏈的結合。後代的可預測性差，不知道會產生什麼樣的結果，得從後代中不斷的篩選，再篩選，優中再選優，直到得到想要的結果，具有很大的盲目性。
轉基因可以是同種間基因交換，也可以是不同種，如把動物的基礎轉接到植物上都可以，可預測性強，目標性明顯，可以大大加快得到需求品種功能性表達的時間。
太空育種通過強輻射，微重力和高真空等太空綜合環境因素誘發植物種子的基因變異。只是加速了基因的自然變異的結果。
舉個例子來說明下，假如原始的基因序列為 99999999雜交N次後，篩選得到你想要的結果99998888
太空育種是一步到位，基因發生突變後，篩選出99998888
轉基因就是把原來的9999剪去，直接換成8888，變成99998888
從結果來看，是並沒有什麼區別的。
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