膠質瘤是常見的顱內腫瘤，其中惡性程度最高的是膠質母細胞瘤。異常的快速增殖、極強的浸潤性及高度異質性是膠質母細胞瘤的典型特徵。患者的平均中值生存期僅為一年左右，是目前人類腫瘤中死亡率極高的腫瘤之一。膠質母細胞瘤難以治療的重要原因之一是其高度異質性。遺傳突變的多樣性是其異質性形成的重要原因。而現有以組織病理特徵為標準的分級方法無法解釋腫瘤異質性帶來的一系列問題，如具有相同病理學分級的病人經過相同的治療手段後產生不同的藥物反應和預後，因此要改善對膠質母細胞瘤的診斷和治療，需要尋找新的分類方法。2008年美國癌症基因組數據庫（The Cancer Genome Atlas，TCGA）完成了對膠質母細胞瘤病人的全基因組測序。後續大量癌症基因組數據的獲得為膠質母細胞瘤尋找新的分型提供了有利條件。
中科院昆明動物研究所趙旭東研究員團隊和黃京飛研究員團隊合作，通過對TCGA數據庫進行數據挖掘，發現高達60%的人膠質母細胞瘤樣本包含CDKN2A基因缺失，30%樣本具有TP53基因突變，且其通常情況下成“相互排斥”現象。進一步對CDKN2A和TP53突變的膠質母細胞瘤進行分析發現，這兩類患者具有截然不同的遺傳表達譜，且病人生存曲線呈現出顯著差異。以CDKN2A和TP53基因突變對膠質母細胞瘤分型可涵蓋80%的膠質母細胞瘤樣本，具有顯著遺傳代表性。綜合以上分析提示以CDKN2A和TP53基因作為特徵基因對膠質母細胞瘤進行分型的可能。同時本研究通過沉默Tp53和Cdkn2a/b基因成功的在小鼠上誘導了具有人膠質母細胞瘤典型病理和分子表達特徵的膠質母細胞瘤模型。進一步對Tp53和Cdkn2a/b基因突變起源的腫瘤進行表達譜分析比對結果證實其表達譜與人膠質母細胞瘤具有相同的差異趨勢。該動物模型的成功構建為以CDKN2A和TP53基因作為特徵基因對膠質母細胞瘤進行分型提供了可靠的模型支持。
該研究成果目前已發表於期刊Oncogene上。中科院昆明動物研究所博士生周霞、副研究員李功華、碩士生安三奇為本文共同第一作者，中科院昆明動物研究所趙旭東研究員、黃京飛研究員和哥倫比亞大學Antonio Iavarone教授為本文共同通訊作者。該項工作得到國家自然科學基金、中科院先導專項、雲南省自然科學基金、雲南省高端科技人才等項目資助。
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