雖然這三種病害都屬於真菌性病害，但是侵染菌種、發病條件、發病時間、發病症狀都有所不同。
一、侵染菌種不同
早疫病（例如番茄、辣椒、茄子、馬鈴薯等）多是由半知菌亞門真菌真菌鏈格孢屬，屬於高等真菌侵染，而晚疫病（例如番茄、馬鈴薯等）和綿疫病（例如西瓜、冬瓜、茄子等）多是由鞭毛菌亞門疫黴屬真菌，屬於低等真菌侵染。
發病條件不同
早疫病在25-28℃，溼度在31%-96%，最易發病，另外田間高溫季節中午最高氣溫37-39℃、夜間25-30℃，雨日多，高溼持續時間長，易流行成災。番茄在開花前對病菌的抵抗力強，在盛花期迅速下降，尤其是下部老葉，因此，早疫病的初始發生時期在開花結果期。
晚疫病在生產中白天24℃以下（在感病組織內擴展），夜間10℃以上（侵入），相對溼度大於75%-100%，持續時間長易發病，尤其在葉面有水膜或水滴，病菌極易繁殖。
綿疫病在相對溼度在85%以上，平均氣溫在25-30℃的條件下，特別是雨後轉晴，氣溫驟升，有利於綿疫病的流行。
發病時間不同
早疫病、晚疫病、綿疫病在生長髮育的各個階段均可發病。早疫病主要發生在開花結果期；晚疫病主要發生在幼苗期、結果期；綿疫病主要發生在大雨過後突然轉晴時，接近地面的果實下部。
發病症狀不同
早疫病病菌侵入葉片後，一邊釋放一種半醌衍生物質毒殺細胞和組織，一邊擴展，但因為晝夜或天氣原因造成溫度上的起伏變化，侵染的速度有快有慢，在寄主體內交替性擴展，所以形成的病斑有輪紋，且病斑周圍的葉組織往往先大面積失綠黃化。
上圖為番茄早疫病
晚疫病病菌侵入寄主並獲取營養，必須分泌很多的毒素先殺死大量的寄主細胞，因此，侵染後，很快形成晚疫病病斑，症狀是像被開水燙過一樣的暗綠色（後期再變呈褐色），感病組織幾乎沒有抵抗反應就被殺死。
上圖為番茄晚疫病
上圖為番茄綿疫病
早疫病，當病害發生一段時間以後，病原菌就會在病斑表面上形成數量巨大的灰黑色分生孢子。
晚疫病和綿疫病，在出現病斑後不久就會在其病葉背面或病健組織交界處或病斑表面出現白色的毛黴狀物。
防治方法
1、農業防治：採用高畦栽培，小水勤澆，防止棚室高溼條件出現。及時整枝打杈，去掉老葉、膛葉，使果實四周空氣流通。及時摘除病果病葉，深埋或燒燬。
2、預防方案：靚果安30-50ml+大蒜油5-15ml +沃豐素25ml兌水30斤定期噴霧。
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