一，卡诺莎之耻
额我略七世
1073年额我略七世当选教宗，他主张教权高于君权、教宗可以罢免君主，教宗拥有对教会人员的任免权而君主没有。这引来了德意志国王亨利四世的不满，他对此表示反对，并自行任命米兰主教。额我略七世对亨利四世任命米兰主教十分不满，派人警告他，此举虽不会使他丧失教籍，但会让他丧失王位。
亨利四世
1076年亨利四世召集德意志各地主教，声称额我略七世是一个假教士，要废黜额我略七世，但各地主教没有支持。额我略七世于是开除亨利四世的教籍，神圣罗马帝国的许多诸侯也趁机发动叛乱，支持教宗，反对亨利四世。各个诸侯声称若亨利四世不能在一年内恢复教籍，就废除他的王位。面对诸侯的威胁，亨利四世被迫向教宗妥协。
卡诺莎之耻
1077年亨利四世前往卡诺莎城堡向教宗额我略七世谢罪，在冰天雪地的城堡外站了3天才获得额我略七世的原谅，恢复了亨利四世的教籍。此事标志着教权高于君权，罗马教宗的权力到达巅峰。
二，君权反扑
克莱孟三世（中间）
1080年权力巩固的亨利四世对卡诺莎之耻心怀怨恨，再次反对额我略七世。额我略七世再次开除亨利四世的教籍，亨利四世则扶持克莱孟三世为教宗。1084年亨利四世占领罗马，额我略七世被迫出逃，克莱孟三世加冕亨利四世为罗马人的皇帝。
额我略七世逃到意大利半岛南部向诺曼人求援，诺曼人于是将亨利四世赶出了罗马。诺曼人在罗马烧杀抢掠，引起了罗马人的不满，额我略失去人心，被迫离开罗马，不久在流亡中死去。
三，意大利争夺战
乌尔巴诺二世
1086年
维笃三世当选教宗，继续与亨利四世对抗。亨利四世进军罗马，企图推翻维笃三世，但没有成功。不久维笃三世死去，乌尔巴诺二世当选教宗。1096年为了收复被阿拉伯人占领的基督教圣地，乌尔巴诺二世发起了十字军东征，罗马教宗的威望空前提高。
腓特烈一世
1152年腓特烈一世 当选德意志国王，1153年教宗安日纳三世为了恢复罗马（1145年布雷西亚的阿诺德将教宗赶出罗马）的统治，请求腓特烈一世进军罗马。1154年腓特烈一世第一次进军意大利半岛，于1155年占领罗马，处决了布雷西亚的阿诺德，恢复了教宗对罗马的统治，教宗哈德良四世加冕腓特烈一世为“罗马人的皇帝”。
为了将富庶的意大利半岛纳入自己的统治下，腓特烈一世此后多次进军意大利半岛，这引起了教宗亚历山大三世的不满，与意大利许多城市组建伦巴底同盟对抗腓特烈一世。1176年伦巴底同盟在莱尼亚诺战役大败腓特烈一世，终结了他对意大利的入侵。
四，教权巅峰
西西里国王腓特烈一世兼神圣罗马帝国皇帝腓特烈二世
1197年神圣罗马帝国皇帝亨利六世病逝，其子腓特烈一世（神圣罗马帝国的腓特烈二世）遭废黜为西西里国王，奥托四世当选德意志国王。1198年英诺森三世当选教宗，不久西西里国王腓特烈一世之母病重，死前请求英诺森三世充当年幼国王的监护人，于是英诺森三世控制了腓特烈一世。
英诺森三世
1209年英诺森三世加冕奥托四世为“罗马人的皇帝”，当奥托四世企图吞并西西里王国时，英诺森三世开出了奥托四世的教籍，扶持腓特烈一世为德意志国王。奥托四世于是同教宗对抗，1214年英诺森三世支持的法兰西国王腓力二世在布汶战役击败奥托四世，奥托四世自此无力对抗教宗，次年被英诺森废黜。自此教宗可以废立皇帝，教权到达新的巅峰。
腓特烈一世长大后继续与教宗争夺权力，教宗以开除教籍为威胁，迫使他发动十字军东征。1228年他发动了第六次十字军东征，夺取了耶路撒冷。1250年腓特烈一世病逝后，子康拉德四世进军意大利，继续与教宗争权。1254年教宗意诺增爵四世开除康拉德四世的教籍，不久康拉德四世去世，此后神圣罗马帝国君主不再插手意大利事务，结束了教宗与神圣罗马帝国的争端，伦巴底同盟解散。
总的来说，神圣罗马帝国中期由于帝国分裂，诸侯势大，使得皇权衰弱，再也不能像以前那样对教宗处于绝对优势。教宗巧妙借助各种势力，将神圣罗马帝国的势力赶出意大利半岛，结束了双方的争端。
