一，卡諾莎之恥
額我略七世
1073年額我略七世當選教宗，他主張教權高於君權、教宗可以罷免君主，教宗擁有對教會人員的任免權而君主沒有。這引來了德意志國王亨利四世的不滿，他對此表示反對，並自行任命米蘭主教。額我略七世對亨利四世任命米蘭主教十分不滿，派人警告他，此舉雖不會使他喪失教籍，但會讓他喪失王位。
亨利四世
1076年亨利四世召集德意志各地主教，聲稱額我略七世是一個假教士，要廢黜額我略七世，但各地主教沒有支持。額我略七世於是開除亨利四世的教籍，神聖羅馬帝國的許多諸侯也趁機發動叛亂，支持教宗，反對亨利四世。各個諸侯聲稱若亨利四世不能在一年內恢復教籍，就廢除他的王位。面對諸侯的威脅，亨利四世被迫向教宗妥協。
卡諾莎之恥
1077年亨利四世前往卡諾莎城堡向教宗額我略七世謝罪，在冰天雪地的城堡外站了3天才獲得額我略七世的原諒，恢復了亨利四世的教籍。此事標誌著教權高於君權，羅馬教宗的權力到達巔峰。
二，君權反撲
克萊孟三世（中間）
1080年權力鞏固的亨利四世對卡諾莎之恥心懷怨恨，再次反對額我略七世。額我略七世再次開除亨利四世的教籍，亨利四世則扶持克萊孟三世為教宗。1084年亨利四世佔領羅馬，額我略七世被迫出逃，克萊孟三世加冕亨利四世為羅馬人的皇帝。
額我略七世逃到意大利半島南部向諾曼人求援，諾曼人於是將亨利四世趕出了羅馬。諾曼人在羅馬燒殺搶掠，引起了羅馬人的不滿，額我略失去人心，被迫離開羅馬，不久在流亡中死去。
三，意大利爭奪戰
烏爾巴諾二世
1086年
維篤三世當選教宗，繼續與亨利四世對抗。亨利四世進軍羅馬，企圖推翻維篤三世，但沒有成功。不久維篤三世死去，烏爾巴諾二世當選教宗。1096年為了收復被阿拉伯人佔領的基督教聖地，烏爾巴諾二世發起了十字軍東征，羅馬教宗的威望空前提高。
腓特烈一世
1152年腓特烈一世 當選德意志國王，1153年教宗安日納三世為了恢復羅馬（1145年佈雷西亞的阿諾德將教宗趕出羅馬）的統治，請求腓特烈一世進軍羅馬。1154年腓特烈一世第一次進軍意大利半島，於1155年佔領羅馬，處決了佈雷西亞的阿諾德，恢復了教宗對羅馬的統治，教宗哈德良四世加冕腓特烈一世為“羅馬人的皇帝”。
為了將富庶的意大利半島納入自己的統治下，腓特烈一世此後多次進軍意大利半島，這引起了教宗亞歷山大三世的不滿，與意大利許多城市組建倫巴底同盟對抗腓特烈一世。1176年倫巴底同盟在萊尼亞諾戰役大敗腓特烈一世，終結了他對意大利的入侵。
四，教權巔峰
西西里國王腓特烈一世兼神聖羅馬帝國皇帝腓特烈二世
1197年神聖羅馬帝國皇帝亨利六世病逝，其子腓特烈一世（神聖羅馬帝國的腓特烈二世）遭廢黜為西西里國王，奧托四世當選德意志國王。1198年英諾森三世當選教宗，不久西西里國王腓特烈一世之母病重，死前請求英諾森三世充當年幼國王的監護人，於是英諾森三世控制了腓特烈一世。
英諾森三世
1209年英諾森三世加冕奧托四世為“羅馬人的皇帝”，當奧托四世企圖吞併西西里王國時，英諾森三世開出了奧托四世的教籍，扶持腓特烈一世為德意志國王。奧托四世於是同教宗對抗，1214年英諾森三世支持的法蘭西國王腓力二世在布汶戰役擊敗奧托四世，奧托四世自此無力對抗教宗，次年被英諾森廢黜。自此教宗可以廢立皇帝，教權到達新的巔峰。
腓特烈一世長大後繼續與教宗爭奪權力，教宗以開除教籍為威脅，迫使他發動十字軍東征。1228年他發動了第六次十字軍東征，奪取了耶路撒冷。1250年腓特烈一世病逝後，子康拉德四世進軍意大利，繼續與教宗爭權。1254年教宗意諾增爵四世開除康拉德四世的教籍，不久康拉德四世去世，此後神聖羅馬帝國君主不再插手意大利事務，結束了教宗與神聖羅馬帝國的爭端，倫巴底同盟解散。
總的來說，神聖羅馬帝國中期由於帝國分裂，諸侯勢大，使得皇權衰弱，再也不能像以前那樣對教宗處於絕對優勢。教宗巧妙藉助各種勢力，將神聖羅馬帝國的勢力趕出意大利半島，結束了雙方的爭端。
