“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

現在中國的疫情已經基本得到了控制,但糟糕的是疫情在中國以外愈加嚴峻。面對人類共同的敵人,全球各種力量都在盡力繼續對抗新冠肺炎。在與病毒鬥爭的過程中可以看到,抗擊的力量來自各個方面,算力也在其中。

“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

近日IBM的超級計算機Summit 也加入抗疫行列,以其超強的計算能力,在全球已知的8000種藥物和化學物中,尋找可能治癒新冠肺炎的那種,該項目白宮也參與其中。此外英偉達、英特爾等公司同樣將自家的算力貢獻。在中國,騰訊、阿里、滴滴等企業和機構都在算力抗疫方面做出努力,並取得了實質性的進展。

算力抗疫的應用範圍相當廣泛,從文獻查找、藥物成分研究到監測流動人口信息、進行大數據分析、維護防疫平臺運行等,幾乎涉及了抗疫所需的全部領域。那麼這些功能是如何通過算力具體實現的?在這一過程中,算力對推動人類與病毒抗爭的進程起到了怎樣的作用?又會對未來產生何種影響呢?

一、中外“算力抗疫”如火如荼,多企業參與全方位抗擊

基於強大算力的支撐,Summit搜尋藥物的進展相當之快,兩天之內就將數千種藥物的範圍縮減到77種,如果是一般的電腦則需耗時數月。該項目的研究人員根據病毒基因組、傳播機制等病理信息,設計出了篩選匹配藥物的程序,讓Summit自動尋找能與冠狀蛋白結合的藥物,然後通過算力與機器學習,分組迅速模擬冠狀蛋白進行微小運動的方式,解決了原本異常複雜的數學問題。

“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

這個過程和研發新藥與疫苗相比將更為迅速。一旦找到合適的藥物,就可直接跳過在研發、試驗方面需要花費的數年時間。該項目由IBM與白宮科技政策辦公室、美國能源部共同開發,並且還有NASA(美國國家航空航天局)、麻省理工學院、阿貢國家實驗室和國家科學基金會等合作伙伴參與其中,可見美國方面對“算力抗疫”的重視。

Summit是由ORNL(美國能源部OakRidge國家實驗室)在2018年6月發佈的超級計算機。它最高能達到每秒20億億次的計算峰值,在特定應用中能夠實現每秒330億億次的混合精度計算。而在Summit的諸多功能中,包括可以為AI與科學發現的整合提供可能性,可以幫助研究人員將機器學習和深度學習的技術應用到人類健康的領域中,此次尋找對抗疫情的藥物就與此項技術有很大關聯。

除了IBM,國外也有其他企業或機構在憑藉算力抗擊疫情。斯坦福大學 Pande 實驗室發起的Folding@home計劃,是用於疾病研究的分佈式計算項目。目前Folding@home正研究如何讓小分子和抗體療法瞄準 COVID-19的“元兇”,即新冠病毒。來自全球的用戶都可以為該項目貢獻個人計算機上的空閒算力,就連PS遊戲機也可加入其中。

這一公益性質項目的參與者包括英偉達、索尼、英特爾、微星等企業。可以說是群策群力,共同通過算力來推進對疫情的抗擊進程。在疫情面前,誰也無法置身事外,中國的許多企業也紛紛從算力著手,並且全方位多角度地實現了對算力的應用。

1月29日,阿里雲宣佈在疫情期間向全世界的公共科研機構免費開放一切AI算力,以加快新冠肺炎新藥和疫苗的研發速度。在這個過程中,有大量的文獻篩查、數據分析和科學超算工作需要完成,而阿里雲提供的AI算力可以在這些方面起到很大的作用。

“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

在此之前,阿里雲就曾與相關機構合作,在算力方面對醫療研究做出過貢獻,例如用15分鐘的時間,完成了普遍需要120個小時才能完成的高精度的個人全基因組測序。而此次阿里云為疫情的藥物研究提供SCC超級計算集群和CPU集群;針對病毒植株感染者的DNA提取提供阿里雲超算支持;為全球範圍內的大規模文件篩查和分析提供阿里雲通用平臺支持;為虛擬篩選提供阿里雲AI平臺支持。

騰訊雲在1月29日~2月6日每天都在進行資源擴容,日均擴容雲主機接近1.5萬臺,8天總共擴容超過10萬臺雲主機 ,共涉及超百萬核的計算資源投入。並且在本月開放了超級算力設施,速度比普通計算機要快得多,用以幫助研究人員尋找治療措施。

2月1日,滴滴雲宣佈免費向中國的科研機構和醫療及救助平臺開放GPU雲計算資源和技術支持,包括但不限於GPU雲服務器、負載均衡SLB、彈性公網EIP等技術,用以支持抗擊疫情的相關工作。任何針對病毒研究、藥物開發的公共科研機構,醫院、學校、以及線上醫療平臺、免費教育資源提供方等都可以聯繫滴滴雲,得到免費算力的支持。



另外,曙光雲撫州計算中心用兩天時間開發了一套疫情排查管理上報系統並完成了測試上線,該系統可通過雲計算、大數據分析技術掌握回鄉人員的相關信息,並且根據這些信息進行分析,幫助制定科學的疫情監督措施。


面對此次的災難,抗疫戰同時也是一場“算力技術戰”。從中可以看到諸多大企業的身影,也可以看到算力的實際應用範圍相當廣泛。而中國在算力方面的實力又尤其強悍,相信在未來持久的“戰爭”中還能起到更重要的作用。

二、算力支撐多種先進技術,未來或將打響抗疫“持久戰”

這次美國以IBM的超級計算機Summit為核心的抗疫動作規模很大,多個國家級機構參與其中。實質上中國的超級計算機在這代Summit出來之前實力一直相當強悍,在全球第一的位置已經坐了超過5年的時間,就在2017年世界超級計算機排名中,中國的“神威·太湖之光”和“天河二號”還分別名列第一和第二。

雖然被Summit超越,但中國在超算領域的實力依然強悍。今年1月,美國權威學術雜誌《科學》刊文,對2020年可能成為頭條的十大科學新聞作出了預測,其中提到中國有望在2020年建造出全球第一臺E級超算。

E級超算即百億億次超級計算機,是國際上高端信息技術創新與競爭的制高點。美國、日本和歐盟都在努力推進各自的E級超算開發計劃。而中國經過幾十年的發展與創新,在超算領域進入了以應用需求引領系統研製的階段。

目前抗擊病毒是迫切的需求,所以中國的E級超算如果能夠按照預測那樣順利推出,結合目前算力抗擊疫情的經驗,加之中國的超算技術走在世界前端,必然能起到重要的推動作用。

看看超級算力在疫情中實際的應用情況,也可以讓這一點得到證實。大量的算力資源被用來進行病毒的藥物篩選和病毒突變預測。國家超級計算深圳中心調度大量計算資源加以支持,優先調度出兩個分區超出 400 個的計算資源,並調度了合作伙伴曙光崑山的DCU 資源和商湯公司的 GPU 資源,成立應急工作組。

在超級算力的幫助下,華中科技大學同濟醫學院基礎醫學院等機構與華為雲聯合科研團隊在2月針對病毒的多個靶標蛋白,對8506種藥物進行了篩選工作,僅用了7天就取得了階段性的成績。

“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

從整個抗擊疫情的過程中,可以感受到算力的重要程度:算力可以提高基因測序效率,加快疫苗研發進程;可以精準掌握人員流動情況,最大限度避免人傳人;可以模擬病毒突變預測,時刻監測、預測病毒發展動態。它還支撐著大數據、AI技術的運行,讓它們在抗擊疫情的各個環節儘可能多地發揮作用,包括雲計算,背後也離不開算力的支持。

企業和機構也可利用算力做出貢獻,近年來整個社會計算資源迅速“雲”化,手機應用、信息系統的後臺運轉多借助雲計算平臺。疫情期間,雲計算迅速擴容的優勢在各類應用對計算力短期爆發性需求的緊急態勢下得以顯現,各種軟件的訪問量暴漲,但仍能保持流暢運行就是這種優勢最好的外在體現。

“算力”抗疫,會比疫苗更有效嗎?

中國的疫情能夠迅速有效地得到控制,離不開算力的協助,但是這並不意味著我們可以對疫情放鬆警惕。

就連Summit取得的進展也不意味著一定能找到治癒方案,專家認為,接下來完全確認有效藥物依然還要用數月時間,人類在以算力抗擊疫情這條路上也有很多阻礙需要去突破。

不過在人類的智慧面前,病毒終究是可以被有效防治的。據說這次的疫情不會像非典那樣被夏日的高溫曬死,上海市新冠肺炎醫療救治專家組組長張文宏在近日的一個採訪中還表示疫情在明年春天可能出現小高峰。這樣看來,新冠病毒與人類長期共存也並非完全不可能,所以當前算力對病毒的研究其實還有更大的價值和更深遠的意義,而且如果未來再爆發新流行病,算力可用於模擬已有適用藥物的發掘,讓科研人員能更迅速地對藥物進行試驗。

在此次疫情中,國內外的科技企業和機構有錢出錢有力出力,都擔負起了社會責任,而算力就是重要的動力來源之一。面對疫情,我們都是命運共同體,針對新冠病毒的疫苗研究成功可能還要很長時間,而算力在未來的抗疫之路上會成為打“持久戰”的利器,“算力抗疫”也將進一步成為“風潮”。


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