最近也看了許許多多了論文，（當然不是因為冠狀病毒採取有心看的，是實驗室導師給的課題），通過對有相關研究的學者們所發的文章來說，其實觀點很廣泛。更多是來自不確定性。
新型冠狀病毒遺傳信息為RNA單鏈，RNA單鏈病毒本身穩定性弱，在複製的過程中鹼基配對出錯或者與宿主體內其他存在的同類病毒甚至是不同類型的病毒產生個重組都是很常見的情況。病毒發現之初，變異這個問題我想鍾南山院士等科研團隊就已經考慮到這個問題，基因組本身是會發生變異，就如我們出生時基因組是一個樣子，長期受環境等因素影響，基因也會發生改變。正所謂萬事萬物都在變化中，對於新型冠狀病毒這種單鏈RNA病毒，更是如此，連雙鏈都hold不住的變異，單鏈更別提了。
那先面我就此次所讀的論文觀點及總結個人想法說明：
1.
注意到8,782和28,144這兩個位點本身的連鎖（通俗的解釋就是這兩並不是隨機變的），根據該位點的鹼基引發的氨基酸改變，可以分為兩類鹼基是T，對應的是亮氨酸，命名為L亞型。鹼基是C，對應的是絲氨酸，命名為S亞型。（名字的由來，搞懂了吧）
S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近，S型相對更古老。但L型具有更強的傳染性。每一次傳播都是優勝落汰的過程，而人體充當環境這個角色，一次又一次自然選擇，於是又增強一次，最後就是線性傳播越多，自然選擇越多，病毒變異越多。（更嚴重的是中國L型反而在國內更多些，而S型在國外較多，比如武漢的96.3%是L型的，武漢之外是61.6%。）
2、L型的相對頻率比其他地方的S型有所下降。不是因為他不厲害，而是由於人為干預可能會導致侵略性且傳播速度更快的L型的嚴重選擇壓力。反正就是說L型壓力山大
3、新冠狀病毒在患者體內的異質性，就是同時體內有LS型病毒
差不多就這些乾貨，以上信息都是生物信息分析出來的結果，但我覺得還要結合具體的流行病學的分析結果，同時本次只做103個樣本的分析，但是對於目前全球感染量超10萬，大概0.1%不到，這個對於統計學還是生信來說樣本量還是太微不足道了，可能存在錯誤的情況。但說實話此時中國科學院主辦的《國家科學評論》於3月3日發表的論文《關於SARS-CoV-2的起源和持續進化》發出，其實我覺得時間段非常好，經過這一個月的奮戰以及復工，好消息不斷的傳出，大多數人對疫情不是疲倦就是放鬆，這篇論文的發表不是危言聳聽，也不是施壓，其實就是想說疫情的防控如火如荼，此時我們決不能掉以輕心！最後來一張核心圖片⚕️
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