一位審稿人曾經說：“我看稿件的順序是題目、摘要、圖表、前言、參考文獻和正文。”可見論文圖片質量非常重要，圖片質量的高低很大程度上決定了論文能否被順利錄用。毋庸置疑，擁有賞心悅目的配圖的稿件更加能夠獲得審稿人的青睞！登高望遠，學習高分文獻中的精美配圖是提高自身文章配圖水平的不二法門
。今天半就給大家分享從一篇2020年2月26日發表的Cell文獻【1】中學習繪製南丁格爾玫瑰圖、GO富集圖等，權當拋磚引玉。
首先，我為什麼分享使用Excel繪圖？
1、 幾乎所有人電腦上都安裝有Excel；
2、 Excel功能強大，可繪製出不遜於編程與其他專業軟件的圖形效果；
3、 可導出高分辨圖片；
4、 Excel還能夠實現一些常用軟件（如Graphpad prism）繪製不了的圖形。
Excel繪製南丁格爾玫瑰圖
南丁格爾玫瑰圖（Rose diagrams）是英國護士和統計學家弗羅倫斯·南丁格爾（Florence Nightingale）發明的一種圓形的直方圖。
其優點是使數據易於理解，讓人印象深刻。
下圖是國際頂級期刊Cell文章中使用的玫瑰圖【1】，用以說明差異表達基因（DEGs）在不同組織中的分佈情況：
“見賢思齊”，我們該如何繪製南丁格爾玫瑰圖呢？
尺有所長，寸有所短。
目前常用繪圖軟件GraphPad Prism暫不能繪製南丁格爾玫瑰圖，然而幾乎所有人電腦中均安裝了的軟件Excel卻可以輕鬆繪製漂亮的玫瑰圖。
繪製步驟：
1. 數據準備
模擬與Cell文獻中類似的7組數據，每組所佔角度為360°除以7為51.4286°：
對各組織間角度範圍細分如下，此外為了讓各組織之間有一定的間隔，使其對應數據為0：
得到1-360°各角度對應的組織與上調或下調數據：
2. 繪製玫瑰圖
選擇步驟1得到的數據，菜單欄點擊插入 -> 插入圖表 -> 雷達圖下選擇填充雷達圖：
得到填充雷達圖：
3. 美化玫瑰圖
3.1 選擇並刪除玫瑰圖外圍的數字：
3.2 設置上調與下調顏色
選中圖形，鼠標右擊選擇設置數據系列格式：
標記處依次設置上調與下調填充顏色，例如上調設置為紅色，透明度設置為60%，效果如下：
設置完成後效果如下：
主要網格線處可以設置網格線的顏色、透明度、寬度等：
4. 添加序列標籤
添加序列標籤前準備好如下輔助數據：
選擇數據，插入餅圖：
餅圖右上角加號選擇數據標籤 -> 更多選項 -> 標籤選項選擇標籤僅包括類別名稱，位置為數據標籤外：
餅圖進入設置數據系列格式，圖表選項設置為無填充：
得到漂亮的南丁格爾玫瑰圖：
5. 導出高清圖片
使用XL toolbox（https://www.xltoolbox.net/）插件Import＆Export下導出高清Tiff圖片：
Excel提取配色方案
相信很多人都曾經為繪圖配色而苦惱，無論怎麼調整都覺得自己的配色“辣眼睛”。
向高分文章學習漂亮的配色方案是一個不錯的選擇。
在此繼續以Cell文章【1】為例向大家分享Excel提取配色的方法！
下圖是Cell文章中7個不同組織的顏色：
步驟：
1. EasyCharts插件
鏈接：http://easychart.github.io/post/Easycharts/ 。
下載完成後按照說明進行安裝：
安裝完成後在菜單欄可見EasyCharts插件。
2. 使用顏色拾取進行配色提取
將想參考配色圖片截圖導入Excel，點擊E asyCharts中的顏色拾取，逐一提取各組顏色，保存獲得各顏色對應的RGB值：
使用提取顏色時只需要在填充顏色時選擇自定義，顏色模式選擇RGB，填入對應的RGB值即可：
4. 在其他繪圖軟件使用配色
以GraphPad Prism為例，填充顏色時選擇More colors，在RGB處填入提取的RGB值，Add to custom colors可以保存顏色後續使用，不需要再次輸入：
使用時點擊More colors，在Choose color下選擇保存好的custom顏色即可：
擴展：
1. EasyCharts插件除可以進行顏色拾取外色輪參考亦可輔助配色：
2. 關於配色Excel表格頁面佈局下顏色處也有不同的顏色供大家參考：
Excel繪製GO分析圖
Cell文獻還對差異表達基因進行了GO分析，圓圈中的數字對應每一項中富集的基因數量：
步驟：
1. 準備GO分析數據,繪圖需使用GO分析名稱（Description列）、-Log10P與基因數量：
2. 選擇Description與-Log10P兩列，插入二維條形圖：
3. 美化圖片
設置柱形圖顏色為灰色：
選中並刪除豎直網格線：
設置邊框為灰色：
右擊圖表右上方加號，添加座標軸標題：
添加數據標籤，選擇更多選項：
標籤選項設置僅顯示單元格中的值：
選擇基因數量列：
選擇基因數量，右擊更改數據標籤形狀為橢圓形：
設置形狀填充顏色與字體顏色，導出高分辨率圖片即可：
擴展：
Excel繪製另類柱形圖：
準備號GO分析數據：
選擇數值，開始菜單下條件格式，選擇數據條，漸變填充下選擇需要的填充顏色：
視圖處選擇不顯示網格線：
選擇數值，右擊設置單元格格式 -> 數字 -> 自定義 -> 類型中輸入；；；（三個分號），將隱藏數字：
選擇數據列，設置左側與下方框線：
最終效果如下：
模式圖繪製
Cell文章中使用不同組織的模式圖，增加了圖形的趣味性。今天半夏給大家分享一款高效模式圖繪製神器——BioRender。
BioRender鏈接：https://biorender.com/
BioRender包含Imuunology、Microbiology、Neuroscience等在內的30多個生命科學領域的數千個模板。需要什麼搜索即可挑選自己需要的模式圖，例如搜索kidney：
我搜索選取了一些常用的模式圖讓大家感受一下：
有了BioRender小白也可以在文章中輕鬆使用模式圖！
實用網站
除了可以從Cell文章學習繪圖外，文中還涉及了一些實用網站。
1. Metascape
鏈接：http：//metascape.org
Metascape【2】整合了GO、KEGG、UniProt和DrugBank等多個權威的數據資源，不僅能完成通路富集和生物過程註釋，還能做基因相關的蛋白質網絡分析和涉及到的藥物分析。作者使用Metascape進行了GO分析。
2. CellPhoneDB
鏈接：www.cellphonedb.org
CellPhoneDB是一種用以預測潛在的特殊的細胞間互作新型統計工具【3】。
3.eagledit
鏈接：www.eagledit.cn
eagledit是一家很棒的語言服務公司，他們的編輯都具有專業的學科背景知識，同時，很多編輯曾經或者現在供職於雜誌社，具有豐富的審稿經驗。所以語言為語言問題苦惱的小夥伴們可以試試
今天給大家分享從高分文獻學習科研繪圖就到此為止了，祝大家繪製高質量的圖片、發高分文章！
參考文獻：
1. Ma S, Sun S, Geng L, et al. Caloric Restriction Reprograms the Single-Cell Transcriptional Landscape of Rattus Norvegicus Aging [published online ahead of print, 2020 Feb 26]. Cell. 2020;S0092-8674(20)30152-5. doi:10.1016/j.cell.2020.02.008
2. Zhou Y, Zhou B, Pache L, et al. Metascape provides a biologist-oriented resource for the analysis of systems-level datasets. Nat Commun. 2019;10(1):1523. Published 2019 Apr 3. doi:10.1038/s41467-019-09234-6
3. Vento-Tormo R, Efremova M, Botting RA, et al. Single-cell reconstruction of the early maternal-fetal interface in humans. Nature. 2018;563(7731):347–353. doi:10.1038/s41586-018-0698-6
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