住好啲居住空间研究院
我来谈一下自己的看法，有不对的希望可以指正。基本的剧情大家应该都看过了，很嗨很爽，人类驾驶机器人大战怪物。但为什么怪物会一直去攻击新东京市呢？这就要说到使徒相互之间的关系，这应该算是动漫版的爸爸去哪了。
亚当、莉莉丝、使徒之间的关系
亚当是第一个来到地球的使徒，在诞生下下其他使徒后自己就陷入了沉睡，其他使徒也在各自的巢穴里猥琐发育，期盼有一天可以长大成人回到亚当爸爸的怀抱。
莉莉丝是第二个来到地球的使徒，莉莉丝拥有和亚当相似的气息，她来到地球后冲击太大把自己和其他使徒直接就给砸晕了，在沉睡中还一直的从身体内流出来羊水，地球上的万物都是从莉莉丝诞生的，包过人类，也就是说莉莉丝是人类的母亲。
使徒为什么一直攻击新东京市
准确的说不是使徒在攻击新东京市，而是新东京市有他们要寻找的东西，人类抓住了使徒的弱点，故意造的新东京市，勾引他们都一个个的往这里集结，然后一个个的干掉。
第一使徒亚当在南极爆炸了，肉体炸成了碎末，灵魂崩出了体外，基本可以说是灰飞烟灭，直接变成了一个只有肉体没有灵魂的卵，身体各各指数都降到了历史最低点。他的孩子们也就是使徒已经感觉不到他的存在了，但却在东京市感受到了一股和他一样的气息。
但使徒不知道呀，他们以为那就是亚当，所以就都往新东京市去寻找爸爸，企盼可以回归爸爸的怀抱。这一点从老版第十七使徒褚熏那里就可以知道，他在到达地底后才发现那是莉莉丝而不是亚当，也才知道自己被骗了。
还有一个细节不知大家注意到没有，第六使徒鱼天使为什么会去攻击载有二号机的太平洋舰队，而不是去攻击新东京？原因就是多面间谍加持良治手中带有亚当的胚胎，在海上被鱼天使感应到了，他攻击的不是二号机而是在寻找他爸。
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我先介绍一下基本设定，亚当和莉莉丝是生命之树诞生出的，生命的“雄体”和“雌体”的最高形态。生命之树瓦解之后，树枝化作了朗基努斯之枪。
数亿年前，亚当和莉莉丝伴随着陨石，相继坠落到了地球。亚当降临在了南极，莉莉丝降临在了日本箱根。从亚当的体内，诞生出了剩下的所有使徒。而莉莉丝体内的LCL溶液混入海水中之后，诞生出了人类。
简而言之，作品中的人类是莉莉丝的“分身”，而使徒则是“亚当”的分身。
故事中的2000年，人类在对亚当进行接触实验是，不慎引发了亚当的觉醒，直接导致了第二次冲击。这次冲击导致了地轴偏转和海平面上升，也让亚当回到了胚胎形态。与此同时，人类也得到了朗基努斯之枪和死海文书。
在这之后，人类在位于箱根的，莉莉丝坠落形成的巨大地下空间中，建立了第三新东京市，也包括NERV总部的基地。同时人类也用朗基努斯之枪抑制住了莉莉丝的再生，将其禁锢在了最终教条区。
实际上，使徒的目的并不是攻击人类，他们行动的唯一准则是回归亚当。但只要使徒回归亚当，必然会引发第三次冲击，所以人类才会去加以阻挠。
有观众会问，使徒回归亚当为什么要去找莉莉丝？这个问题其实在24集“最后的使者”中解释过了，包括渚薰在内的所有使徒，都把最终教条区的莉莉丝当成亚当了。真正的亚当，早就被移植到了碇源渡的手掌里。
这看似是个天大的误会，实际上一切都是早就计划好的。SEELE得到死海文书之后，得知了人类补完计划的条件，并以书中的预言来指导整个计划。预言中非常重要的一条，是所有使徒都被消灭之后，生命之树将会逆生，这就是所谓的“约定之日”。
所以第三新东京市建立的在莉莉丝的上层的目的，本身就是为了吸引使徒，并将它们全部消灭。正片中使徒一次次入侵，实际上早就在碇源渡的剧本中写好了，所谓的使徒，也不过是补完计划的一颗棋子而已。
动漫简评
不请自来。高赞回答已经答的八九不离十了，那狗哥我就补充几点他们没提到的。
为何使徒一定要攻击人类基地？
答：因为亚当在那里。使徒进攻Nerv总部的意图均为接触亚当（第十使徒（空天使）以自爆炸弹形式存在，第十一使徒（恐怖天使）通过病毒形态侵入Magi以引发Nerv总部进行自爆），从而引发第三次冲击与使徒的补完，阻止人类通过莉莉丝进行补完。
证据：
第八话一开始碇元度所提到的“行李”，指的并非EVA二号机，而是亚当。
第六使徒的出现地点与其他使徒不同，原因在于其他使徒均是认为亚当被存放在Nerv总部地下，而第六使徒则是直接感受到了太平洋舰队中的加持良治所携带的亚当的气味，从而进行攻击。
而为了应对第六使徒的攻击，加持良治不得不听从碇元度的命令，乘坐飞机离开，并最终将亚当交到碇元度手中，获得了碇元度的信任。
第六使徒（鱼天使）的出现地点与其他使徒不同，它出现在运送二号机的海洋上，原因：感觉到了同行的加持良治所携带的胚胎状的亚当的气息，而其他使徒均出现于日本附近而向Nerv总部底层进攻（原因是认为亚当被存放在Nerv总部底层，目前有以下三种解释：
1. 使徒并不拥有智慧之果，其思维能力较人类低下很多，虽然在使徒依次出现的过程中其智慧在不断进化，但仍然不足以与人类相比，因而使徒可能认为，既然Nerv总部是人类对抗使徒的核心机构，那么落入人类之手的亚当应该存放于此，这一简单的逻辑适用于第三（水天使）、第四（昼天使）、第五（雷天使）使徒等等，就连拥有人类智慧的第十七使徒渚薰都把莉莉丝误认为是亚当。
2. 使徒可以通过追寻亚当的气息寻找亚当，在第六使徒之后亚当便一直存在于碇元度手中，因而这一逻辑适用于第六使徒之后的所有使徒，同时这一逻辑也更加适合解释新剧场版中使徒的出现地点；
3. Nerv总部中有带有亚当气息的物品（较为可信的这一物品是莉莉丝所戴的亚当面具），因而招来了使徒的攻击。
以上三点较为合理地显示了人类与使徒之战的核心在于夺取亚当和莉莉丝的控制权，而人类补完的过程便显示了人类主动赎罪，生命回归本源的基本过程。三种解释中狗哥认为第三种解释较为合理。
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宅狗动漫
简单的说几点啊，亚当和莉莉丝有十三个孩子，前十二个吃了力量果实然后沉睡，到第十三个孩子时候力量果实没了没办法吃了智慧果实，因为心的力量太强大所以人类分裂成无数个体，这也引出心灵屏障（dt立场，为什么人类最厉害）。所有孩子（使徒）都把回归亚当成为完美个体作为毕生追求，但是亚当只能接受一个孩子，所以所有使徒包括人类在最终时刻前只能存活一个（不然人类早跟亚当结合了）。
人类因为分裂个体保持了清醒并且第一时间抢夺到了亚当，通过不断研究考证特别是第三使徒事件发现跟亚当结合补完事件，从而建立eva提出人类补完计划，但是人类没有吃力量果实没有竞争能力所以，通过莉莉丝的细胞克隆出eva给人类搭载跟其他使徒战斗，后来发现只有心理活动最活跃的14岁少年才有驾驶使徒的资格（很残酷，真嗣他妈和明日香他妈都是牺牲品，前者彻底被吸收，后者一半灵魂被吸收疯了，也间接导致司令改变计划盗取亚当胚胎想最后跟零（莉莉丝）结合成神再见到真嗣他妈）也引出三个问题儿童，用部分莉莉丝和真嗣他妈细胞和灵魂克隆出的驾驶员零（零的灵魂只有一个，身体无数但是每次死亡会失去部分记忆）。三个驾驶员都有资格了，年龄适合，心里有疾病，还都跟机体有联系（都是妈妈。。。）。
到这里提一下，初号机貌似跟其他eva不同使用亚当细胞克隆的（很特别），这也是最后力天使为什么毁掉零号机二号机不管，唯独想抢夺初号机核的原因。大概这样吧。想问别的底下评论大家交流补充。不讨论新版和新剧场版，改了不少设定了。
未戒荤与腥
使徒的目的是为了回归父体ADAM（亚当）。
ADAM亚当是雄体，而莉莉丝LILITH是雌体的最高形式生物。
在他们“禁断的融合”后莉莉丝产生了一个“Lilith之卵即黑之月”，从中进而产生了十八个使徒，其中十七个获得了生命之果。不知是不是因为生命之树上生命之果只长着十七个，第十八使徒只能将就获得了智慧之果，因此力量微弱，不足以维持一个总形态，只能分化瓦解以不同的形态存在着，这就是——人类。
说的俗点就是亚当和莉莉丝有了十八个孩子，第十八个孩子因为特殊原因最弱—就是人类。
源度（也就是男主真嗣他爸）的目的初始就是为了阻止SEELE引发第三次冲击。
但后来真嗣他爹改变了，他想成为神，通过毁灭人类来成为神。决定人类的命运SEELE则是使人类毁灭进而得到进化。
很多细节没有说，直接带过来。如果详细说前因后果太多了…有不懂的朋友可以再讨论。
EVA其实不细看个几次，还真未必看得明白，算是比较有“东西”的动漫了。
小扬说动漫
我建议你上YOUTUBE上找官方的释疑视频来看（虽然烂尾了），B站我没记错的话搬运过第一个，简单说就是亚当生下了十七个使徒，并继承了亚当的力量果实（应该就是S2机关），莉莉丝生下了第十八使徒，也就是人类，继承了莉莉丝的智慧果实，使徒的目的是要回归亚当没错，但有前提条件:1.只有一名使徒能回归，所以使徒之间存在竞争关系。2.回归的条件是同时具备力量果实和智慧果实，所以其他答案说的把莉莉丝误认为亚当的说法是错的，使徒知道第三新东京市下面就是有智慧果实的莉莉丝，只要和莉莉丝接触就可以触发同时拥有力量果实和智慧果实的回归条件从而引发第三次冲击，在新剧场版里，初号机暴走打败第十四使徒并吞噬了其S2机关后满足条件，在随后救援绫波丽的行动中触发了第三次冲击，不过随后被六号机以朗基奴斯枪强行终止，另外提一句，按照官方设定，除了亚当莉莉丝和作为第十八使徒的人类之外，其他使徒的大本营在月球上，《最终幻想8》里的月之泪，月面上的怪物降落并袭击地球这一桥段就是在致敬EVA
雷鸣归魂
显然不少人都被第一话的标题给误导了，“使徒、袭来”作为第一话的标题无疑是成功的，也非常符合机械人动画的标准，巨大怪物袭击人类城市主角驾驶机器人进行迎击，满满就是熟悉的味道，但怎么料想到这部神作日后居然是走这样风骚的设定。
显然使徒并非是来袭击人类，这帮傻乎乎的使徒仅仅是因为想找亚当融和回归到原来的状态而已。而人类在2000年的时候发现了冰封在南极大陆的亚当当时亚当身体还被插着朗基奴斯枪给封印着，但是几乎所有故事就是始于人类作死，于是当朗基奴斯枪被移开亚当苏醒，引发了第二次冲击。
之后就被n2地雷炸了个稀巴烂，SEELE后来更是将其还原成为原始的胚胎状态带回去第三新东京市。正是由于本来姿态的亚当被几乎被完全的削去，之后的使徒就随之复活并且踏上寻找亚当的道路，这应该算得上就是整个故事的真正开始。
光之巨人形态下就是本来姿态的亚当，拥有巨大的光之翼这时候的姿态才是最完整的姿态，虽然被炸成胚胎但也就因此诞生了其他的使徒，所以其他的使徒还是因为这样诞生出来，不然根本不可能凭空出现也不在南极大陆。
这些一波又一波的使徒频频袭击第三新东京市只是为了回归到亚当体内，根据SEELE手中的死海文书想要实现人类补完计划还得所有的使徒被消灭才能够实行。
于是第三新东京市就成为了迎击使徒的堡垒，而事实上第三新东京市最主要的功能都是对使徒的迎击能力，市区内的人更加多的是工作人员而不是市里普通市民。
而事实上到了后期，基本已经不存在非战斗人员还居住在第三新东京市中，已经连学生都搬走，这已经成为了一个单纯的迎击使徒的要塞，只不过最后这个无法被使徒攻陷的要塞最终还是被人类自己所摧毁。
穿越者HARO
首先，要确定的是，死海古卷中记载，现今地球上的人类并不是亚当的后裔，是莉莉丝与撒旦的后裔，当年乘坐诺亚方舟来地球的原亚当后裔因为数量原因，被地球的人类逐渐淘汰灭绝，而人类取而代之自诩为亚当的后裔，上帝是不承认其为亚当后裔的身份。所以人类是永远无法到神之侧的，死后只能去地狱。二是“约定之日”的由来，上帝发动洪水淹没所有巨人和身负罪孽的人类后，神的身边没有了陪伴之人，但是神认可亚当和莉莉丝的身份，允许他们回归神之侧，人只能通过回归莉莉丝，才能到达神之侧，第三就是那些天使的身份，EVA里的天使（也就是使徒来自亚当），但是在死海古卷里则是上帝派去保护亚当的，因为当年诺亚方舟来地球时，也把亚当的圣身（胚胎）带了下来，并被诺亚埋在了南极，上帝为了防止人类接触亚当的圣身，在当年犯了罪孽的200位看守天使中，除去被打入地狱和在天界负罪的人，派了12位看守天使去看守亚当的圣身，以迎接约定之日的到来，在EVA里这些设定得到了改编
小哈动漫
头条还是B站，好像是头条吧，有个小编用几个视频的形式讲解了这个问题，视频内容挺好的，就是看的人不多，我来简单说一下。
第三新东京市下面是黑之月，莉莉丝在几亿年前随着黑之月来到地球，之后身上流出了液体，就是生命之汤充满了地球，生命开始形成，包括人类。南极的是白之月，白之月比黑之月更早来到地球，里面带来了三样东西：亚当、死海文书、朗基努斯之枪。随后亚当引发第一次冲击，并且创造出使徒。科研队去南极发现并研究亚当的时候导致第二次冲击。使徒去黑之月寻找莉莉丝，解放莉莉丝之后的话莉莉丝会把几亿年前从自己身体里面释放出去的生命之汤重新变回原样，由于人类也是由生命之汤演变而来的，变回原样就是变回液体的形态，所以人类不能让使徒解放莉莉丝。剧场版真心为你里面的人类就变成了生命之汤的形态，后来剧场版序破Q里面月球表面上有一条巨大的血渍，应该就是真心为你里面最后从莉莉丝脖子那里喷出来的。
此时明月起
因为使徒们要和使徒之父亚当结合才能完成新一轮的进化，继而生存下去。
而第二次冲击之后人类把亚当还原成了胚胎隐藏了起来，却把莉莉丝伪装成亚当的样子，放置在NERV的巨大的地下基地中间，误导使徒寻找的方向。
所以在明面上的意义，第三新东京市和EVA正是为此建立，迎击使徒。
