1.自然資源部第三海洋研究所
- 自然資源部第三海洋研究所，創建於1959年11月27日，是自然資源部直屬的國家公益一類綜合型海洋科學研究機構，主要從事海洋基礎研究、應用研究和高新技術研究，促進海洋科技進步，為海洋管理、公益服務、海洋經濟發展及海洋安全提供科技支撐。
- 海洋三所是國務院學位委員會批准的碩士學位授予單位，並與國內多所著名高校聯合培養碩士、博士研究生，現建有博士後科研工作站。海洋三所重點發展深海生物研究與海洋生物資源開發利用、全球變化與區域海洋響應、海洋生物多樣性與生態系統保護、應用海洋學四個學科領域13個研究方向，擁有10個研究部門（含自然資源部屬2個重點實驗室和1個工程中心），以及面向服務經濟社會建設為主的廈門海洋工程勘察設計研究院。
- 2020年計劃面向全國招收20名全日制學術型碩士研究生，招生專業有物理海洋學（070701）、海洋化學（070702）、海洋生物學（070703）、海洋地質（070704）、微生物學（071005）、環境科學（083001），學制3年，畢業頒發畢業證、學位證。
2.廈門國家會計學院
- 廈門國家會計學院是我國高層次財經財會人才的重要培養基地，是我國政府倡導成立的“一帶一路”財經發展研究中心所在地。學院經國務院批准於2002年成立，直屬於國家財政部。
- 2020年擬招收全日制專業學位研究生共計100人（含推薦免試生）。其中會計碩士（125300）擬招收60人（其中含推薦免試生6人），審計碩士（025700）擬招收20人（其中含推薦免試生2名），稅務碩士（025300）擬招收20人（其中含推薦免試生2名）。招生人數因教育部正式招生計劃下達或實際錄取推薦免試生有可能產生變動。
3.中國科學院城市環境研究所
- 中國科學院城市環境研究所成立於2006年7月4日，中國科學院下屬的事業法人單位，是目前國際唯一的專門從事城市環境綜合研究的國立研究機構，位於美麗的南方海濱城市—廈門市。
研究所目前擁有“環境科學與工程”、“生態學”專業一級學科博士、碩士學位授予點以及“環境科學與工程”博士後科研流動站。 - 中國科學院城市環境研究所2020年擬招收環境科學、環境工程、生態學、環境經濟與環境管理等4個專業的學術型碩士研究生25名，資源與環境專業學位碩士研究生16名（最終錄取碩士研究生人數以國家下撥指標數為準）。以上各招生專業方向均接收推薦免試研究生，共約22名。
- 另外，2020年城市環境研究所繼續與福建農林大學、福州大學等福建地方高校擬聯合招收40人（以教育主管部門下達計劃為準）。雙方統籌資源優勢，兼具雙方同類學科特色，建立聯合招收培養研究生創新基地和平臺，在高校碩士招生規模中單列招生計劃，以城市環境研究所為培養主體，遵循“雙重管理、同等待遇、兩段式培養”的聯培模式，培養優秀人才。
4.福建物質結構研究所
- 中國科學院福建物質結構研究所由我國著名科學家、教育家盧嘉錫院士於1960年創建，是中科院優秀研究所。
- 福建物構所是1978年國務院學位委員會批准的博士、碩士學位授予權單位之一。現設有化學一級學科博士培養點和無機化學、物理化學、有機化學、凝聚態物理、材料物理與化學、生物化學與分子生物學化等6個博士、碩士培養點；生物工程、化學工程、材料工程、光學工程、控制工程5個碩士研究生培養點；並設有化學學科、材料科學與工程2個博士後流動站。
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