中世紀的歐洲，是一個教權巔峰時代，雖然歐洲大地生活著法蘭克人，日爾曼人，斯拉夫人，凱爾特人，匈牙利人等多個不同的民族，但是他們都有一個共同的信仰——天主教。教廷主宰著一切，只有順從教廷的人死後才能得到解脫，升入天堂，凡是與教廷作對的人，最後都免不了墮入煉獄。教廷這種無上的權威，往往凌駕於王權之上，導致了多次王權和教權之爭，同時也給民眾帶來的沉重的什一稅，再加上教廷四處兜售贖罪券，購買了贖罪券的人死後就可以升入天堂，下層民眾的生活苦不堪言，這就給16世紀的宗教改革運動提供了孕育的土壤。
最先開始的是路德宗（又稱新教）的宗教改革，其領袖馬丁路德，出生於神聖羅馬帝國薩克森公國的圖林根（今德國圖林根州）地區。父親給馬丁的規劃是在大學修習法律，畢業後到皇宮謀得一份差事，但是馬丁有自己的想法，他毅然決然地放棄了父親為他規劃的路線，成為了一名教士，後不斷修習法學和神學，晉升為一名神父。1510年，馬丁被派往羅馬教廷，抗議教廷將奧斯定會強行合併的行為，這成為了他與教廷決裂的開端。
1517年，馬丁路德宣佈他反對贖罪券，併發布了九十五條論綱，詳細闡釋了贖罪券的不合理之處，之後教廷勒令他收回他的言論和著作，但被他拒絕，此後遭受了來自天主教各方的攻擊，甚至被逐出教會，但得到了薩克森公爵的支持，得以在薩克森傳播他的思想。
在條頓騎士團大團長阿爾布雷希特參加神聖羅馬帝國帝國議會尋求德意志王公的幫助無果後，在薩克森的維滕貝格與馬丁路德相遇，路德建議阿爾布雷希特廢棄騎士團禁止結婚的陳規，並把普魯士從羅馬教皇名下的騎士團領地獨立出來成立世襲公國。後來波蘭國王齊格蒙特一世同意了阿爾布雷希特的建議，但要求世俗化之後的普魯士仍然是波蘭王國的封地，雙方達成一致後，阿爾布雷希特正式向齊格蒙特一世宣誓效忠，後者則授予他以及他的家族對普魯士公國的統治權。其後阿爾布雷希特推動新教教義在普魯士地區的廣泛傳播，羅馬教廷和神聖羅馬帝國雖然對他進行了制裁，但鑑於內部的宗教改革運動衝擊，顯得有心無力，使得普魯士地區成為了率先接納新教教義的地區。
此後阿爾布雷希特積極參與帝國事務，加入了新教諸侯們（如勃蘭登堡，普法爾茨等）組成的托爾高聯盟，這個聯盟最後進化為福音派聯盟，與帝國皇帝進行了長達30年的戰爭（史稱三十年戰爭或第〇次世界大戰）。同時他還在柯尼斯堡建立大學，發展教育事業，後來普魯
勃蘭登堡-普魯士示意圖
士內部由於宗教分歧發生內亂，阿爾布雷希特被剝奪了權力，他的兒子阿爾布雷希特 腓特烈攝政，兩年之後，一代梟雄去世。
此後由於普魯士公爵阿爾布雷希特 腓特烈絕嗣，1618年，他將公國傳給女婿——同為霍亨索倫家族的勃蘭登堡選帝侯約翰 希吉斯蒙德，自此，兩個完全獨立發展的國家走到了一起，勃蘭登堡-普魯士建立。1660年，瑞典和波蘭爆發戰爭，此時的瑞典已從丹麥的統治下獨立出來，一躍成為北方雄獅，勃蘭登堡大選帝侯腓特烈 威廉周旋其中，縱橫捭闔，最終迫使波蘭取消了對普魯士的宗主權，從此普魯士從波蘭剝離出來，成為一個完整的中央集權國家。
1701年，西班牙哈布斯堡王朝絕嗣，王位一度空缺，對西班牙早已垂涎三尺的法國波旁王朝意欲吞併西班牙，與奧地利哈布斯堡王朝爆發戰爭，最後導致整個歐洲組成聯盟對抗法國。但奧地利哈布斯堡王朝空有神聖羅馬帝國皇帝頭銜，其實能控制的帝國土地不多，在經過幾年戰爭的消耗之後，人力財力捉襟見肘，此時勃蘭登堡兼普魯士公爵腓特烈三世表示支持帝國皇帝哈布斯堡家族，併為皇帝提供了一支幾千人的精銳部隊，以此換取國王的稱號。但當時神聖羅馬帝國之內不允許出現多的王國，所以腓特烈將王國建立在帝國領土之外的普魯士，成立普魯士王國，並在柯尼斯堡加冕為普魯士國王腓特烈一世，從此開啟了普魯士爭霸歐陸的歷史。
普魯士白底黑鷹旗
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