新冠病毒是否已經發生突變？如何突變？這是目前學界研究的焦點之一。中國科研團隊最新發現顯示：
新冠病毒已於近期產生了 149 個突變點，並演化出了兩個亞型，分別是 L 亞型和 S 亞型。研究發現，在地域分佈及人群中的比例，這兩個亞型表現出了很大測差異。其中 S 型是相對更古老的版本，而 L 亞型更具侵略性傳染力更強。對不同亞型的深入瞭解，將有助於新冠肺炎的差異化的治療和防控。以上研究來自中國科學院主辦的《國家科學評論》（NationalScienceReview）於 3 月 3 日發表的論文《關於 SARS-CoV-2 的起源和持續進化》（OntheoriginandcontinuingevolutionofSARS-CoV-2）。
論文通訊作者為陸劍研究員（北京大學生命科學學院生物信息中心）、崔傑研究員（中國科學院上海巴斯德研究所）。
論文通過對目前為止最大規模的 103 個新冠病毒全基因組分子進化分析，發現病毒株已發生了 149 個突變點，而且多數是近期產生的。該研究揭示：新冠病毒已經演化出 L 和 S 兩個亞型。其中 101 個屬於這兩個亞型。從佔比上看，L 亞型更為普遍達到 70%，S 亞型佔 30%。
論文作者認為，根據新型冠狀病毒的演變方式推測，L 亞型和 S 亞型的傳播能力、致病嚴重程度或許存在較大區別。
論文稱，兩個亞型的區別在於病毒 RNA 基因組的第 28144 位點，L 亞型是 T 鹼基（對應亮氨酸，Leu），S 亞型是 C 鹼基（對應絲氨酸，Ser）。通過與其他冠狀病毒比較，作者發現 S 型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近，從而得出 S 型相對更古老的結論。
L 亞型在武漢爆發的早期階段更為普遍，而 L 亞型的發生頻率在 2020 年 1 月初後有所下降。作者認為，人為干預可能對 L 亞型施加了更大的選擇性壓力，如果沒有這些干預，L 亞型可能更具侵略性和擴散得更快速。另一方面，由於選擇壓力相對較弱，在進化上較老且攻擊性較小的 S 型可能在相對頻率上有所增加。這些發現意味著，目前迫切需要結合基因組數據、流行病學數據和 2019 年冠狀病毒病患者臨床症狀圖表記錄，進行進一步的全面研究。
另外，值得注意的是，這 103 個樣本顯示，大部分患者只感染了 L 亞型或 S 亞型中的一個。但其中一位近期有過武漢旅行史的美國患者分離出的病毒株，顯示其可能同時感染了 L 型和 S 型新冠病毒。不過，作者表示目前還無法排除新突變型的可能性。
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