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新疆地区屯田最初有兵屯、回屯和户屯，后又增加了犯屯和旗屯。清前期在新疆屯田重北而轻南，北路屯田28万余亩，南路还不及其五分之一。官兵北路驻防，南路则换防；商民北路可以携眷，南路不得携眷。这严重阻碍了南疆的边防建设。魏源指出新疆屯田建设的弊端：“夫家室不成，则生聚不盛，人心不固，垦辟不富。”林则徐被发配到伊犁时，考察西北防务，认为俄国将来必成大患。向伊犁将军布彦泰提出屯田实边，严防沙俄侵犯的主张。布彦泰采纳了林则徐的建议，并请求道光帝“委林查勘办理”。1843年至1844年共开垦荒地19.4万余亩。其基本思想是：扩大民屯，刺激边民的生产积极性；同时改屯兵为操防，加强军事训练，做到屯田与实边紧密结合，促进西陲的开发与军防。
（新疆区划图）
阿古柏入侵新疆后，边屯也随之荒废。1876年左宗棠出兵收复新疆失地，为解决军粮问题，一面进兵，一面组织屯田。他主张“划兵农为二，择其精壮勇胆之兵编入营伍，进行正规操练，羸弱不任战者则散之为农，按户口拨给荒地，令其承垦。”如此“简其精壮，营伍可得而实，散其疲弱，营伍可得而增，两利之道也”。左宗棠的整顿改革，使新疆屯田得以复兴，并飞速发展。
（新疆首任巡抚刘锦棠）
但新疆屯田措施的好坏与其最高长官的推行方法有很大联系，左宗棠之后，首任巡抚刘锦棠大力发展兵屯，但因管理不善，徒滋耗费，旋办旋止。继任巡抚饶应祺又派兵开垦罗布淖尔，但因没有立足实际，因地制宜，盲目发展，耗费巨资，最终不了了之。后再任巡抚潘效苏为裁节兵饷，强征当地垦户壮丁入伍，按户派充。结果民怨沸腾，被迫停办。屯田政策的反复多变，直至清亡都再未出现蓬勃发展的局面。
参考文献：
1、袁大华等.《新疆图志·军制三》.
2、军事科学院. 中国军事通史.第十七卷,清代后期军事史(下)[M]. 军事科学出版社, 1998.
3、赵尔巽. 清史稿.第38册[M]. 中华书局, 2003.
4、左宗棠.《左襄文公全集·书牍》卷14.
回答者：季我努学社青年会会员 王毅
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有一本书叫《东turk斯坦独立运动:1930年代到1940年代》，第一章就讲了满清对新疆的控制。
满清通过和准噶尔汗国的战争，进入了新疆地区，本意并非想控制这里，因为成本上来说，非常不划算。但又不能丢给别人，就保持了下来，又因为大小和卓的冲突，南疆也被满清控制。
从满清获得控制权后，就开始了屯田，因为距离内地太远，转运太难，屯田有助于解决驻扎军队补给问题。
屯田分为好几种，军屯是军队屯田，回屯由回回屯田，户屯由内地迁徙来的人屯田，旗屯由旗人屯田，犯屯由犯人屯田。
这些屯田主要集中在北疆，南疆非常少。
1832年之后，又允许内地的农民移居南疆，建立民屯，之后一度在南疆土著的抗议下取消，最终因为财政困难，又继续。
