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新疆地區屯田最初有兵屯、回屯和戶屯，後又增加了犯屯和旗屯。清前期在新疆屯田重北而輕南，北路屯田28萬餘畝，南路還不及其五分之一。官兵北路駐防，南路則換防；商民北路可以攜眷，南路不得攜眷。這嚴重阻礙了南疆的邊防建設。魏源指出新疆屯田建設的弊端：“夫家室不成，則生聚不盛，人心不固，墾闢不富。”林則徐被髮配到伊犁時，考察西北防務，認為俄國將來必成大患。向伊犁將軍布彥泰提出屯田實邊，嚴防沙俄侵犯的主張。布彥泰採納了林則徐的建議，並請求道光帝“委林查勘辦理”。1843年至1844年共開墾荒地19.4萬餘畝。其基本思想是：擴大民屯，刺激邊民的生產積極性；同時改屯兵為操防，加強軍事訓練，做到屯田與實邊緊密結合，促進西陲的開發與軍防。
（新疆區劃圖）
阿古柏入侵新疆後，邊屯也隨之荒廢。1876年左宗棠出兵收復新疆失地，為解決軍糧問題，一面進兵，一面組織屯田。他主張“劃兵農為二，擇其精壯勇膽之兵編入營伍，進行正規操練，羸弱不任戰者則散之為農，按戶口撥給荒地，令其承墾。”如此“簡其精壯，營伍可得而實，散其疲弱，營伍可得而增，兩利之道也”。左宗棠的整頓改革，使新疆屯田得以復興，並飛速發展。
（新疆首任巡撫劉錦棠）
但新疆屯田措施的好壞與其最高長官的推行方法有很大聯繫，左宗棠之後，首任巡撫劉錦棠大力發展兵屯，但因管理不善，徒滋耗費，旋辦旋止。繼任巡撫饒應祺又派兵開墾羅布淖爾，但因沒有立足實際，因地制宜，盲目發展，耗費巨資，最終不了了之。後再任巡撫潘效蘇為裁節兵餉，強徵當地墾戶壯丁入伍，按戶派充。結果民怨沸騰，被迫停辦。屯田政策的反覆多變，直至清亡都再未出現蓬勃發展的局面。
參考文獻：
1、袁大華等.《新疆圖志·軍制三》.
2、軍事科學院. 中國軍事通史.第十七卷,清代後期軍事史(下)[M]. 軍事科學出版社, 1998.
3、趙爾巽. 清史稿.第38冊[M]. 中華書局, 2003.
4、左宗棠.《左襄文公全集·書牘》卷14.
回答者：季我努學社青年會會員 王毅
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有一本書叫《東turk斯坦獨立運動:1930年代到1940年代》，第一章就講了滿清對新疆的控制。
滿清通過和準噶爾汗國的戰爭，進入了新疆地區，本意並非想控制這裡，因為成本上來說，非常不划算。但又不能丟給別人，就保持了下來，又因為大小和卓的衝突，南疆也被滿清控制。
從滿清獲得控制權後，就開始了屯田，因為距離內地太遠，轉運太難，屯田有助於解決駐紮軍隊補給問題。
屯田分為好幾種，軍屯是軍隊屯田，回屯由回回屯田，戶屯由內地遷徙來的人屯田，旗屯由旗人屯田，犯屯由犯人屯田。
這些屯田主要集中在北疆，南疆非常少。
1832年之後，又允許內地的農民移居南疆，建立民屯，之後一度在南疆土著的抗議下取消，最終因為財政困難，又繼續。
