天下網商記者 張超
自從阿里雲宣佈向全球公共科研機構免費開放一切AI算力後，何萬青博士就進入了連軸轉狀態，經常工作到凌晨。作為阿里雲高性能計算團隊負責人，他要對接大量科研機構、高校院所以及化學、生物醫學專家的需求。
這些機構和專家，在這個特殊的階段，都是想快捷利用阿里雲的超大規模算力，來縮短藥物研發週期，以儘早讓相關的疫苗、特效藥上市，控制住新型冠狀病毒感染肺炎疫情。
新型冠狀病毒的圖片
基於阿里雲的藥物研發和大數據平臺已經上線
在免費開放算力之前，阿里雲的超大規模算力早就服務於多家生物醫藥機構和專家，一個典型代表就是全球健康藥物研發中心GHDDI。
GHDDI是由蓋茨基金會、清華大學和北京市政府三方聯合成立的公共衛生與藥物創新機構。主要為建設新藥研發和轉化的創新平臺，加強醫藥研究和開發。
比爾·蓋茨（左二）參加GHDDI啟動儀式
2017年，GHDDI成立的第二年，阿里雲就開始為GHDDI的各類新藥研發、化合物篩選等提供算力支持。
在新型冠狀病毒感染肺炎疫情發生後，GHDDI也在1月27日上線了“一站式科研數據與信息共享平臺”，這是一個基於阿里雲的藥物研發和大數據平臺，主要功能有四個：
針對SARS/MERS等冠狀病毒的歷史藥物研發進行數據挖掘與集成；
開放相關臨床前和臨床數據資源；
計算靶點和藥物分子性質；
跟進新型冠狀病毒最新科研動態，實時向科學界和公眾公佈，為新型冠狀病毒科學研究提供重要數據支撐。
GHDDI上線的一站式科研數據與信息共享平臺
藥物研發為什麼要用到超大規模算力
很多人會有疑問，藥物研發屬於生物醫學領域，超大規模算力屬於計算機科學領域，為什麼藥物研發要用到超大規模算力？而且GHDDI宣佈上線研發平臺以及阿里雲宣佈免費提供相關算力後，為什麼眾多機構和專家趨之若鶩？
何萬青博士說，這跟藥物研發的流程不無關係。
通常一款藥物的研發，始於病毒的“毒株分離”，然後進行測序分析；找到病毒的靶點進行識別和驗證；尋找對應化合物；合成先導化合物；評估研究和動物實驗；製劑合成；臨床試驗以及上市等步驟。
全球健康藥物研發中心GHDDI
說起來很簡單，實際上新藥研發卻是個費錢費力更費時間的過程，數據顯示，在美國研發一種新藥，從項目啟動到被FDA（美國食品藥品監督管理局）批准上市，平均需要花費10-15年的時間，耗資超過13億美元。
目前，針對新型冠狀病毒疫苗和新藥的研究，已經完成了“毒株分離”的“溼實驗”，“基因測序”工作也已經結束，接下來就要了“幹實驗”階段。“幹實驗”階段，涵蓋對病毒靶點進行識別和驗證、尋找對應化合物等過程。
研究人員對新型冠狀病毒進行“毒株分離”
可以這麼理解，生物醫藥領域的“溼實驗”，主要是在實驗室裡的研究工作，“幹實驗”就要靠超大規模算力幫忙。
何萬青博士解釋，“特別是尋找對應化合物，一定要調用超大規模算力，因為可供製成藥物的化合物有5000-15000種。要先從龐雜的化合物中找到針對病毒合適的‘進攻方向’，再進行合成和拼接，如果都要從實驗室裡一一比對，那就太浪費時間了。”
然而云計算可以解決這些耗時的環節。
例如與阿里雲合作的全球健康藥物研發中心GHDDI，具備了上千種化合物的數據庫，這些化合物的性質、藥效也都已經掌握，通過計算機模擬，可以加快找到遏制新型冠狀病毒對應化合物的速度。
GHDDI針對此次新型冠狀病毒蛋白質序列實現部分靶點的同源建模工作
特別重要的是，面對人類共同的敵人-病毒，公共科研機構更需要無需排隊，隨時可以得到彈性伸縮、數據交流和發佈更加方便的協同環境。
“在全國人民為配合切斷病毒傳染途經而自我隔離的情況下，阿里雲彈性高性能計算EHPC平臺和超級計算集群SCC恰好解決這個燃眉之急。這也印證了阿里的一句土話‘此時此刻，非我莫屬’。”何博士說。
阿里雲神龍超級計算集群SCC上做的分子動力學分析結果
但是，就算通過雲計算找到了對應化合物，按照流程還要進行“先導化合物合成”、“動物實驗”、“臨床實驗”等一大堆繁瑣的步驟，藥物和疫苗研發的速度，極有可能趕不上疫情發展的週期。
換句話說，就是沒等新藥研發出來，疫情就已經結束了。
“老藥新用”也許能派上用場
好在針對新型冠狀病毒新藥和疫苗的研發，還有一條路可以選，“老藥新用”。
“老藥新用”指的不僅僅是藥物，還可以是相關的治療經驗。
此前類似的SARS/MERS等疫情爆發後，醫學界留有大量的歷史藥物研發以及臨床數據，還有很多醫學文獻散落全球各地，這些都可能成為這次新型冠狀病毒治療突破口。
調用篩選醫學文獻，分析歷史數據時，超大規模算力也會派上大用場。
比如GHDDI在上線研發平臺就表示，目前研發平臺已經涵蓋既往冠狀病毒相關研究中涉及的900多個小分子在不同階段的相關實驗信息，“希望科研界能參與提煉有用信息並得到幫助或啟示”。
何博士感慨，“有了超大規模算力的幫助，在‘軍情緊急’的情況下，也不用完全從‘0’開始了。”
何萬青博士
而GHDDI上線研發平臺後，也致謝阿里雲團隊協助部署後端並提供計算資源。
何萬青博士團隊中還有很多技術專家，比如孫相徵和餘洋等人，目前的工作就是對接GHDDI以及各類科研機構、專家們的需求。
這些計算機科學領域的大牛說，他們並不是醫學專業出身，能做的只是為研究人員提供算力保障、優化技術支持和應用答疑等“後勤工作”，讓科學家能夠專注於學科本身的科研突破，而無需耗費太多精力去學習“交叉學科”的計算技術，但是他們看到了越來越多的生物醫學專家加入了進來，感受到了“很強的使命感”，大家都在用自己的綿薄之力，加速對新型冠狀病毒的研究以及相關藥物、疫苗的研發。
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