乾符五年春(公元878年)，王仙芝在黃梅戰死，其餘部由尚君長之弟尚讓率領投奔亳州與黃巢所部會合，黃巢得以獨統全軍10餘萬人，自稱黃王，號沖天大將軍，改稱元王霸。其餘義軍將領也一致推舉黃巢為沖天太保均平大將軍，統一指揮農民起義隊伍。手中握有強大軍事實力的黃巢，本應該順天意，應民心，救民於苦難之中。然而，黃巢卻近乎瘋狂地將血淋淋的屠刀伸向了普通百姓，對中原大地造成了極大的破壞。
屠廣州
乾符六年(公元879年)三月，黃巢攻佔福州，同年九月，領軍進攻南方重鎮廣州。攻陷廣州後，黃巢聲勢漸壯，於是自稱率土大將軍，在城內屠殺各國商人12萬人，摧毀一切教堂，砍絕桑樹，不許養蠶織絲以貨外夷，把曾經是海外貿易中心的廣州幾乎一舉蕩平。
黃巢在廣州屠城，其原因彘是忌恨唐朝廷允諾其招安後的待遇太低。此前，黃巢的軍隊屢次被唐朝官軍打敗，於是黃巢給唐天平節度使張楊一封求降信，請求代向朝廷上奏。唐僖宗得到奏文後下詔任命黃巢為右衛將軍，命令黃巢率部眾到鄆州解除武裝。黃巢認為官職太低，於是再次致書唐嶺南東道節度使李迢，講明若唐朝廷授他以天平節度使之職，即可休兵罷戰，願受朝廷節制，但朝廷不準。黃巢再向朝廷上表乞求廣州節度使的職位，唐僖宗命滿朝大臣對此事討論。左僕射於琮認為：廣州市舶寶貸所聚，豈可令賊得之!於是經過商議，朝廷只授黃巢以率府率的小官。這下黃巢大怒，一種被瞧不起的自卑之感油然而生，於是他衝冠一怒，狂攻廣州。攻下廣州後，活捉了廣州節度使李迢。這時，黃巢又讓李迢草寫表文向朝廷申述自己想當廣州節度使的願望，李迢回答說：予代受國恩，親戚滿朝，腕可斷，表不可草。黃巢馬上將其殺死。
在一償夙願的慾望下，黃巢即刻文告天下，義軍即將北上，直赴長安，問罪朝廷。在向長安進發的戰鬥中，黃巢數次犯下了嚴重的戰爭罪行。在攻打潼關時，唐軍憑藉堅固的城防拼死抵抗，並在兩軍陣前挖下幾道極深的塹壕，黃巢軍數次進攻，都被這幾道塹壕擋住。於是黃巢一聲令下，將強拉入軍充作伕役的普通百姓趕到塹壕邊填土，黃巢嫌進度太慢，又下令將其中的1000多名無辜百姓趕入塹壕，再派人掘土填埋，活人加上泥土，終於填平大溝。黃巢大軍就踩著還在不停蠕動的地面一衝而過，向關樓投擲火炬，關樓俱盡，攻下了潼關。
由於唐王朝的腐敗透頂，義軍所向披靡，高歌猛進，黃巢很快攻陷了唐帝國的核心長安。那麼，黃巢給這座偉大的城市帶來了什麼呢?
焚長安
黃巢於公元881年1月8日傍晚佔領長安，16日稱帝，中間僅八天，而在這八天裡，義軍也沒有頒佈任何安民措施。這段時間裡，黃巢無暇他顧，一心一意地為自己的登基大典做準備。黃巢入主長安後，除分封妻妾、將相以外，沒有任何作為。
新政權成立後，毫無新氣象可言，政府沒有發佈任何保境安民的公告，如果黃巢的政權還能稱作政府的話，再加上黃巢軍隊大肆洗劫，長安很快就陷於混亂之中。
在黃巢入城時，民夾道聚觀，由此可見，苦幹李唐壓迫的老百姓還是比較歡迎義軍的。義軍將領尚讓也挨個向士民們宣諭說：黃王起兵，本為百姓，非如李氏不愛汝曹，汝曹但安居無恐。剛開始的幾天，義軍看到貧窮的人，還往往施捨財物。對此，《資治通鑑》評論說，黃巢的部下為盜賊既久，通過戰爭中的搶掠已經變得極為富有了，這只不過是暫時的現象。原來，這些為盜賊既久的戰士只是在用搶來的財富戲耍著長安的居民，這只是久為人下又突然成為人上人的反常舉動。果然，幾天以後，就發生了諷刺性的一幕：黃巢的部下看到黃巢忙於登基，忙於封官，忙於找女人充實三宮六院，而自己遲遲得不到封賞，於是義軍將士如同明火執仗的強盜一般在長安街頭殺人越貨，各出大掠，夢市肆，殺人滿街。長安百姓在驚愕之中，血流成河。
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